目的基于网络药理学和分子对接研究红芪活性成分抗阿霉素心肌毒性的作用机制。方法通过系统药理学平台(traditional chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)、瑞士靶点预测数据库(swiss target prediction)检索红芪化学成分及对...目的基于网络药理学和分子对接研究红芪活性成分抗阿霉素心肌毒性的作用机制。方法通过系统药理学平台(traditional chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)、瑞士靶点预测数据库(swiss target prediction)检索红芪化学成分及对应靶点。以毒性基因数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)、基因卡片数据库(GeneCards)分别得到阿霉素毒性靶点、心肌损伤靶点。阿霉素致心肌毒性靶点与药物靶点进行映射,得到红芪抗阿霉素心肌毒性的靶点,通过STRING 11.0在线平台进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI),运用注释、可视化和集成发现的数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集。最后,通过Autodock软件对红芪的关键活性成分与作用靶点进行分子对接。结果收集红芪活性成分14个、阿霉素致心肌毒性靶点2203个、红芪抗阿霉素心肌毒性潜在靶点37个。PPI结果显示表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin peroxidase 2,PTGS2)、基质金属蛋白酶2(matrix metalloproteinase 2,MMP2)、单胺氧化酶B(monoamine oxidase B,MAOB)等可能是红芪抗阿霉素致心肌毒性的关键靶点。GO功能富集主要涉及单一生物代谢过程、脂质代谢过程、氧化还原酶活性、细胞外区域等。KEGG信号通路主要包括色氨酸代谢、酪氨酸代谢、花生四烯酸代谢等。分子对接结果显示毛蕊异黄酮、槲皮素、芒柄花素、食脂素与PTGS2、EGFR、MMP2、MAOB有效好的结合活性。结论红芪中活性化合物毛蕊异黄酮、槲皮素、芒柄花素、食脂素等可能作用于PTGS2、EGFR、MMP2、MAOB等靶点调节花生四烯酸代谢、氧化还原酶活性、ErbB等多条信号通路,发挥抗阿霉素心肌毒性的作用。展开更多
目的应用Lable-free蛋白组学技术探究当归对血虚大鼠的补血作用机制。方法采用皮下注射盐酸乙酰苯肼(APH)建立溶血性血虚大鼠模型;采用ATP酶试剂盒测定大鼠红细胞膜ATP酶的含量;采用HE染色法观察大鼠脾脏、肝脏病理组织切片变化;采用Lab...目的应用Lable-free蛋白组学技术探究当归对血虚大鼠的补血作用机制。方法采用皮下注射盐酸乙酰苯肼(APH)建立溶血性血虚大鼠模型;采用ATP酶试剂盒测定大鼠红细胞膜ATP酶的含量;采用HE染色法观察大鼠脾脏、肝脏病理组织切片变化;采用Lable-free蛋白组学分析各组大鼠脾脏组织的蛋白,鉴定差异表达蛋白,并对其进行生物信息学分析。结果与正常对照组(K)比较,模型组(M)红细胞膜Na^(+)-K^(+)-ATP酶、Ca^(2+)-Mg^(2+)-ATP酶活力均显著降低(P<0.01);脾窦扩张充血(+++),巨噬细胞数目增多(+++),白髓结构散乱(+++);肝脏中央静脉内充血(+++),枯否细胞数目增多(+++)。与模型组(M)比较,当归组(Q)Na^(+)-K^(+)-ATP酶、Ca^(2+)-Mg^(2+)-ATP酶活力均显著升高(P<0.05,P<0.01);脾窦扩张充血减轻(+),巨噬细胞数目减少(+),白髓结构清晰(+);肝脏中央静脉内充血减轻(+),肝血窦无扩张。蛋白组学显示:M vs K共有219个差异蛋白,其中上调蛋白116个,下调蛋白103个,Q vs M共有172个差异蛋白,其中上调蛋白117个,下调蛋白55个;进一步取交集得到37个差异蛋白,其中CPOX、HMBS、TFRC、ALAD、WASF2、SPTB、PXN七个差异表达蛋白为当归发挥补血作用的关键靶点,涉及卟啉代谢、溶酶体、辅助因子的生物合成和铁死亡等信号通路。结论当归可明显增强大鼠红细胞膜ATP酶活力,改善血虚模型大鼠的脾脏和肝脏功能,可能是通过CPOX、HMBS、TFRC、ALAD、WASF2、SPTB、PXN等多靶点和卟啉代谢、溶酶体、辅助因子以及铁死亡等多通路发挥的协同作用机制有关。展开更多
文摘目的基于网络药理学和分子对接研究红芪活性成分抗阿霉素心肌毒性的作用机制。方法通过系统药理学平台(traditional chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)、瑞士靶点预测数据库(swiss target prediction)检索红芪化学成分及对应靶点。以毒性基因数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)、基因卡片数据库(GeneCards)分别得到阿霉素毒性靶点、心肌损伤靶点。阿霉素致心肌毒性靶点与药物靶点进行映射,得到红芪抗阿霉素心肌毒性的靶点,通过STRING 11.0在线平台进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI),运用注释、可视化和集成发现的数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集。最后,通过Autodock软件对红芪的关键活性成分与作用靶点进行分子对接。结果收集红芪活性成分14个、阿霉素致心肌毒性靶点2203个、红芪抗阿霉素心肌毒性潜在靶点37个。PPI结果显示表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin peroxidase 2,PTGS2)、基质金属蛋白酶2(matrix metalloproteinase 2,MMP2)、单胺氧化酶B(monoamine oxidase B,MAOB)等可能是红芪抗阿霉素致心肌毒性的关键靶点。GO功能富集主要涉及单一生物代谢过程、脂质代谢过程、氧化还原酶活性、细胞外区域等。KEGG信号通路主要包括色氨酸代谢、酪氨酸代谢、花生四烯酸代谢等。分子对接结果显示毛蕊异黄酮、槲皮素、芒柄花素、食脂素与PTGS2、EGFR、MMP2、MAOB有效好的结合活性。结论红芪中活性化合物毛蕊异黄酮、槲皮素、芒柄花素、食脂素等可能作用于PTGS2、EGFR、MMP2、MAOB等靶点调节花生四烯酸代谢、氧化还原酶活性、ErbB等多条信号通路,发挥抗阿霉素心肌毒性的作用。
文摘目的应用Lable-free蛋白组学技术探究当归对血虚大鼠的补血作用机制。方法采用皮下注射盐酸乙酰苯肼(APH)建立溶血性血虚大鼠模型;采用ATP酶试剂盒测定大鼠红细胞膜ATP酶的含量;采用HE染色法观察大鼠脾脏、肝脏病理组织切片变化;采用Lable-free蛋白组学分析各组大鼠脾脏组织的蛋白,鉴定差异表达蛋白,并对其进行生物信息学分析。结果与正常对照组(K)比较,模型组(M)红细胞膜Na^(+)-K^(+)-ATP酶、Ca^(2+)-Mg^(2+)-ATP酶活力均显著降低(P<0.01);脾窦扩张充血(+++),巨噬细胞数目增多(+++),白髓结构散乱(+++);肝脏中央静脉内充血(+++),枯否细胞数目增多(+++)。与模型组(M)比较,当归组(Q)Na^(+)-K^(+)-ATP酶、Ca^(2+)-Mg^(2+)-ATP酶活力均显著升高(P<0.05,P<0.01);脾窦扩张充血减轻(+),巨噬细胞数目减少(+),白髓结构清晰(+);肝脏中央静脉内充血减轻(+),肝血窦无扩张。蛋白组学显示:M vs K共有219个差异蛋白,其中上调蛋白116个,下调蛋白103个,Q vs M共有172个差异蛋白,其中上调蛋白117个,下调蛋白55个;进一步取交集得到37个差异蛋白,其中CPOX、HMBS、TFRC、ALAD、WASF2、SPTB、PXN七个差异表达蛋白为当归发挥补血作用的关键靶点,涉及卟啉代谢、溶酶体、辅助因子的生物合成和铁死亡等信号通路。结论当归可明显增强大鼠红细胞膜ATP酶活力,改善血虚模型大鼠的脾脏和肝脏功能,可能是通过CPOX、HMBS、TFRC、ALAD、WASF2、SPTB、PXN等多靶点和卟啉代谢、溶酶体、辅助因子以及铁死亡等多通路发挥的协同作用机制有关。
