目的:利用网络药理学去探究鱼腥草治疗急性肺损伤的作用机制。方法:首先,通过TCMSP、Swisws Target Prediction数据库查找鱼腥草的有效成分,并利用Uniport数据库将有效成分转化为基因靶点;然后通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取...目的:利用网络药理学去探究鱼腥草治疗急性肺损伤的作用机制。方法:首先,通过TCMSP、Swisws Target Prediction数据库查找鱼腥草的有效成分,并利用Uniport数据库将有效成分转化为基因靶点;然后通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取急性肺损伤疾病的靶点,再将两者基因相交,筛选得到共同的基因靶点,并用Venny绘图,再使用Cytoscape去构建中药–疾病–成分–靶点的网络图,并从STRING数据库分析并筛选获得相同靶点蛋白–蛋白相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape软件分析绘制PPI网络图,运用cytoHubba的Degree算法,筛选关键基因靶点,建立关键基因靶点的网络模型。同时,使用微生信在线平台去进行富集分析,分析潜在靶点的基因功能以及信号通路,从而从系统生物学整体水平揭示鱼腥草潜在有效成分和作用机制。结果:结果分为三部分:成分、靶点和途径。在成分方面,发现鱼腥草的5种活性成分,其中槲皮素、山奈酚是主要活性成分。共发现132个靶点,其中128个主要靶点和ALI共同拥有。此外,鱼腥草治疗ALI的主要通路是Pathways in cancer信号通路、Lipid and atherosclerosis信号通路、AGE-RAGE信号通路等。结论:由于鱼腥草的多组分、多靶点和多通道功能,本研究通过网络药理学初步揭示了鱼腥草治疗ALI的潜在调节网络。为合理开发利用鱼腥草植物资源、保护和发展民族医药文化提供研究依据。展开更多
文摘目的:利用网络药理学去探究鱼腥草治疗急性肺损伤的作用机制。方法:首先,通过TCMSP、Swisws Target Prediction数据库查找鱼腥草的有效成分,并利用Uniport数据库将有效成分转化为基因靶点;然后通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取急性肺损伤疾病的靶点,再将两者基因相交,筛选得到共同的基因靶点,并用Venny绘图,再使用Cytoscape去构建中药–疾病–成分–靶点的网络图,并从STRING数据库分析并筛选获得相同靶点蛋白–蛋白相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape软件分析绘制PPI网络图,运用cytoHubba的Degree算法,筛选关键基因靶点,建立关键基因靶点的网络模型。同时,使用微生信在线平台去进行富集分析,分析潜在靶点的基因功能以及信号通路,从而从系统生物学整体水平揭示鱼腥草潜在有效成分和作用机制。结果:结果分为三部分:成分、靶点和途径。在成分方面,发现鱼腥草的5种活性成分,其中槲皮素、山奈酚是主要活性成分。共发现132个靶点,其中128个主要靶点和ALI共同拥有。此外,鱼腥草治疗ALI的主要通路是Pathways in cancer信号通路、Lipid and atherosclerosis信号通路、AGE-RAGE信号通路等。结论:由于鱼腥草的多组分、多靶点和多通道功能,本研究通过网络药理学初步揭示了鱼腥草治疗ALI的潜在调节网络。为合理开发利用鱼腥草植物资源、保护和发展民族医药文化提供研究依据。
