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蓝莓3-O-葡萄糖基转移酶基因克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
刘娜
田雨菁
+4 位作者
冯哲瀚
李虎良
张蕾
黄金海
华德平
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2023年第2期120-128,共9页
为研究蓝莓3-O-葡萄糖基转移酶基因(3GT)的性质和功能,探明3-O-葡萄糖基转移酶在花青素合成过程中发挥的作用,以成熟的蓝莓果实为材料,利用同源克隆获得了3GT基因的单一拷贝,运用生物信息学软件分析预测蓝莓3GT的序列特征。结果表明:3G...
为研究蓝莓3-O-葡萄糖基转移酶基因(3GT)的性质和功能,探明3-O-葡萄糖基转移酶在花青素合成过程中发挥的作用,以成熟的蓝莓果实为材料,利用同源克隆获得了3GT基因的单一拷贝,运用生物信息学软件分析预测蓝莓3GT的序列特征。结果表明:3GT基因长度为1371 bp,编码456个氨基酸,位于蓝莓的4号染色体末端,含有3个外显子和2个内含子。蛋白的分子式为C_(2279)H_(3521)N_(595)O_(650)S_(15),理论等电点(pI)为6.14。信息分析预测3GT蛋白有37个磷酸化位点,亲水指数小于0为亲水性蛋白,不稳定系数大于40为不稳定蛋白,无跨膜区和信号肽;蛋白质二级结构由α-螺旋(Hh)、延伸链(Ee)、β-转角(Tt)和无规则卷曲(Cc)4种结构形式组成,其中α-螺旋占比最高,达40%;3GT属植物糖基转移酶家族(GTB-型),PSPG结构域中第44位是组氨酸,糖基供体可能为UDP-半乳糖;与猕猴桃亲缘关系最近,同源性为67%;分子对接显示蓝莓3GT与矢车菊素分子存在4种相互作用力;蓝莓3GT启动子上游可能具有与光响应、抗胁迫响应及特定激素响应相关的顺式作用元件。本研究克隆得到了蓝莓3GT基因,通过在线网站和预测软件对其进行了生物信息学分析和功能预测。
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关键词
蓝莓
3GT
基因特征分析
花青素合成
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职称材料
外源褪黑素对非生物胁迫下植物生长发育的影响
被引量:
8
2
作者
田雨菁
胡雅琦
《生物化工》
2020年第4期163-164,170,共3页
研究发现,褪黑素可以通过外源施加的办法,作为植物生长调节物质,对植物光周期、耐受性、叶绿素保护等具有一定的生长调节功能。本文通过介绍外源褪黑素对于植物的抗氧化酶、丙二醛、叶绿素含量、光合特性以及种子萌发的影响,旨在为进一...
研究发现,褪黑素可以通过外源施加的办法,作为植物生长调节物质,对植物光周期、耐受性、叶绿素保护等具有一定的生长调节功能。本文通过介绍外源褪黑素对于植物的抗氧化酶、丙二醛、叶绿素含量、光合特性以及种子萌发的影响,旨在为进一步探讨植物生长发育中外源褪黑素的作用提供理论基础。
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关键词
外源褪黑素
抗氧化酶
丙二醛
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职称材料
唾液宿主关联乳杆菌ATCC 11741益生特性
3
作者
梅雪锋
华德平
+2 位作者
田雨菁
黄金海
张蕾
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期3901-3915,共15页
【目的】部分唾液宿主关联乳杆菌(Ligilactobacillus salivarius)菌株具备优良的益生特性和较好的应用潜力。以唾液宿主关联乳杆菌ATCC11741菌株为研究对象,探究其生长特性、耐受性和黏附能力,以期为唾液宿主关联乳杆菌的有效利用提供...
【目的】部分唾液宿主关联乳杆菌(Ligilactobacillus salivarius)菌株具备优良的益生特性和较好的应用潜力。以唾液宿主关联乳杆菌ATCC11741菌株为研究对象,探究其生长特性、耐受性和黏附能力,以期为唾液宿主关联乳杆菌的有效利用提供理论基础。【方法】利用形态观察和16SrRNA基因测序确认唾液宿主关联乳杆菌ATCC11741的准确性;通过监测生长曲线和产酸曲线来探究其生长特性;此外,还进行了一系列耐受性试验,包括耐酸、耐碱、耐胆盐、耐高渗和耐温测试,以评估其耐受能力;最后,借助自聚集和疏水性试验来间接测定其黏附性。【结果】唾液宿主关联乳杆菌ATCC 11741呈快速“S”型生长;产酸高峰期在2-7 h,14 h后趋于稳定,最终pH值稳定在4.3左右;该菌株在pH 4.0-11.0范围内生长良好,在pH 2.0的MRS培养基中培养4 h存活率为50.48%;在胆盐浓度为0.10%的MRS培养基中培养2 h之后的存活率可达到94.4400%;在NaCl浓度为6%的MRS培养基中仍能生长;温度对其生长影响显著,30-42℃促进生长,而20℃和50℃则抑制其生长;转速为120 r/min和180 r/min对其生长无显著影响;该菌株在5h时自聚集率为41.4%,疏水性(碳烃化合物黏着法)为44.5%。【结论】L.salivarius ATCC 11741是一株生长快,耐酸、耐碱、耐盐能力强,具有一定胆盐耐受性,温度适应性较广,具有较强黏附能力的乳酸菌。
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关键词
唾液宿主关联乳杆菌
生长特性
耐受效果
黏附能力
原文传递
题名
蓝莓3-O-葡萄糖基转移酶基因克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
刘娜
田雨菁
冯哲瀚
李虎良
张蕾
黄金海
华德平
机构
天津大学生命科学学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2023年第2期120-128,共9页
基金
蔬菜种质创新国家重点实验室开放课题(201901)
国家自然科学基金项目(31400236)
天津市重大专项合作项目(17ZXZYNC00050)。
文摘
为研究蓝莓3-O-葡萄糖基转移酶基因(3GT)的性质和功能,探明3-O-葡萄糖基转移酶在花青素合成过程中发挥的作用,以成熟的蓝莓果实为材料,利用同源克隆获得了3GT基因的单一拷贝,运用生物信息学软件分析预测蓝莓3GT的序列特征。结果表明:3GT基因长度为1371 bp,编码456个氨基酸,位于蓝莓的4号染色体末端,含有3个外显子和2个内含子。蛋白的分子式为C_(2279)H_(3521)N_(595)O_(650)S_(15),理论等电点(pI)为6.14。信息分析预测3GT蛋白有37个磷酸化位点,亲水指数小于0为亲水性蛋白,不稳定系数大于40为不稳定蛋白,无跨膜区和信号肽;蛋白质二级结构由α-螺旋(Hh)、延伸链(Ee)、β-转角(Tt)和无规则卷曲(Cc)4种结构形式组成,其中α-螺旋占比最高,达40%;3GT属植物糖基转移酶家族(GTB-型),PSPG结构域中第44位是组氨酸,糖基供体可能为UDP-半乳糖;与猕猴桃亲缘关系最近,同源性为67%;分子对接显示蓝莓3GT与矢车菊素分子存在4种相互作用力;蓝莓3GT启动子上游可能具有与光响应、抗胁迫响应及特定激素响应相关的顺式作用元件。本研究克隆得到了蓝莓3GT基因,通过在线网站和预测软件对其进行了生物信息学分析和功能预测。
关键词
蓝莓
3GT
基因特征分析
花青素合成
Keywords
Blueberry
3GT
Gene characterization analysis
Anthocyanin biosynthesis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S663.9 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
外源褪黑素对非生物胁迫下植物生长发育的影响
被引量:
8
2
作者
田雨菁
胡雅琦
机构
内蒙古大学生命科学学院
出处
《生物化工》
2020年第4期163-164,170,共3页
文摘
研究发现,褪黑素可以通过外源施加的办法,作为植物生长调节物质,对植物光周期、耐受性、叶绿素保护等具有一定的生长调节功能。本文通过介绍外源褪黑素对于植物的抗氧化酶、丙二醛、叶绿素含量、光合特性以及种子萌发的影响,旨在为进一步探讨植物生长发育中外源褪黑素的作用提供理论基础。
关键词
外源褪黑素
抗氧化酶
丙二醛
Keywords
Exogenous melatonin
Antioxidant enzymes
Malondialdehyde
Chlorophyll
Photosynthesis
Seed germination
分类号
Q946.885 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
唾液宿主关联乳杆菌ATCC 11741益生特性
3
作者
梅雪锋
华德平
田雨菁
黄金海
张蕾
机构
天津大学医学部生命科学学院
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期3901-3915,共15页
基金
国家合成生物技术创新中心(TSBICIP-KJGG-014)。
文摘
【目的】部分唾液宿主关联乳杆菌(Ligilactobacillus salivarius)菌株具备优良的益生特性和较好的应用潜力。以唾液宿主关联乳杆菌ATCC11741菌株为研究对象,探究其生长特性、耐受性和黏附能力,以期为唾液宿主关联乳杆菌的有效利用提供理论基础。【方法】利用形态观察和16SrRNA基因测序确认唾液宿主关联乳杆菌ATCC11741的准确性;通过监测生长曲线和产酸曲线来探究其生长特性;此外,还进行了一系列耐受性试验,包括耐酸、耐碱、耐胆盐、耐高渗和耐温测试,以评估其耐受能力;最后,借助自聚集和疏水性试验来间接测定其黏附性。【结果】唾液宿主关联乳杆菌ATCC 11741呈快速“S”型生长;产酸高峰期在2-7 h,14 h后趋于稳定,最终pH值稳定在4.3左右;该菌株在pH 4.0-11.0范围内生长良好,在pH 2.0的MRS培养基中培养4 h存活率为50.48%;在胆盐浓度为0.10%的MRS培养基中培养2 h之后的存活率可达到94.4400%;在NaCl浓度为6%的MRS培养基中仍能生长;温度对其生长影响显著,30-42℃促进生长,而20℃和50℃则抑制其生长;转速为120 r/min和180 r/min对其生长无显著影响;该菌株在5h时自聚集率为41.4%,疏水性(碳烃化合物黏着法)为44.5%。【结论】L.salivarius ATCC 11741是一株生长快,耐酸、耐碱、耐盐能力强,具有一定胆盐耐受性,温度适应性较广,具有较强黏附能力的乳酸菌。
关键词
唾液宿主关联乳杆菌
生长特性
耐受效果
黏附能力
Keywords
Ligilactobacillus salivarius
growth characteristics
tolerance
adhesion capacity
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蓝莓3-O-葡萄糖基转移酶基因克隆及生物信息学分析
刘娜
田雨菁
冯哲瀚
李虎良
张蕾
黄金海
华德平
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
外源褪黑素对非生物胁迫下植物生长发育的影响
田雨菁
胡雅琦
《生物化工》
2020
8
下载PDF
职称材料
3
唾液宿主关联乳杆菌ATCC 11741益生特性
梅雪锋
华德平
田雨菁
黄金海
张蕾
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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