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基于生物信息学分析ALDH2对肺腺癌的预后价值评估
1
作者
申效榕
闫梓翼
+6 位作者
黄园莉
朱清
张光辉
慈红非
吴琼
高琴
吴礼高
《齐齐哈尔医学院学报》
2023年第19期1801-1808,共8页
目的分析乙醛脱氢酶基因(ALDH2)在肺腺癌(LUAD)中的表达对其预后的影响。方法通过生物信息学,利用从TCGA数据库下载的肺腺癌RNA及临床资料,分析ALDH2基因在多种癌症中的表达情况,以及其在配对和非配对的肺腺癌样本中的表达,用免疫组化...
目的分析乙醛脱氢酶基因(ALDH2)在肺腺癌(LUAD)中的表达对其预后的影响。方法通过生物信息学,利用从TCGA数据库下载的肺腺癌RNA及临床资料,分析ALDH2基因在多种癌症中的表达情况,以及其在配对和非配对的肺腺癌样本中的表达,用免疫组化的方法验证ALDH2在肺腺癌中的表达。采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析ALDH2在LUAD中的临床特征关系及预后价值。用免疫棒棒糖图显示ALDH2与免疫浸润关系。结果对于TCGA数据库下载的数据进行分析,可得到ALDH2在33种癌症中的表达情况,发现ALDH2在多形成性胶质细胞瘤、子宫内膜癌、乳腺浸润癌、肺腺癌、食管癌、胃和食管癌、混合肾癌、前列腺癌、胃癌、头颈鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、肺鳞癌、肝细胞癌、肾母细胞瘤、黑色素瘤、膀胱尿路上皮癌、甲状腺癌、卵巢浆液性囊腺癌、子宫肉瘤、白血病、急性髓细胞样白血病、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、肾上腺皮质癌、肾嫌色细胞癌和胆管癌中低表达(P<0.001);在胶质瘤、脑低级别胶质瘤、肾乳头状细胞癌、结肠癌、结直肠癌和胰腺癌中表达上升(P<0.001);对肺腺癌及正常组织进行分析,发现ALDH2在LUAD中低表达(P<0.001);在肺腺癌中ALDH2的表达与患者的ALDH2的表达水平与肿瘤T分期(P=0.041)、淋巴结转移(P=0.009)、病理分级(P=0.037)、年龄(P=0.038)以及吸烟史(P=0.019)等临床特征显著相关;将肺腺癌患者分为高、低表达ALDH2两组,总体生存时间(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无进展间隔(PFI)、首次进展生存期(FP)、无复发生存期(RFS)具有显著差异;ROC分析ALDH2基因表达水平对预测患者有较好敏感性;ALDH2表达与免疫浸润的CD8+T细胞、T细胞、辅助性T细胞、CD56bright NK细胞、肥大细胞、嗜酸粒细胞和DC细胞显著相关;免疫组化显示LUAD中存在ADH2低表达。结论ALDH2在肺腺癌中低表达,与其临床特征和患者预后情况具有相关性,可以作为肺腺癌患者预后良好的指标,且与免疫浸润相关。
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关键词
乙醛脱氢酶2基因(ALDH2)
肺腺癌
TCGA数据库
生存预后
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题名
基于生物信息学分析ALDH2对肺腺癌的预后价值评估
1
作者
申效榕
闫梓翼
黄园莉
朱清
张光辉
慈红非
吴琼
高琴
吴礼高
机构
蚌埠医学院病理学教研室
蚌埠医学院生理学教研室
出处
《齐齐哈尔医学院学报》
2023年第19期1801-1808,共8页
基金
安徽高校自然科学研究重点项目(KJ2021A078)。
文摘
目的分析乙醛脱氢酶基因(ALDH2)在肺腺癌(LUAD)中的表达对其预后的影响。方法通过生物信息学,利用从TCGA数据库下载的肺腺癌RNA及临床资料,分析ALDH2基因在多种癌症中的表达情况,以及其在配对和非配对的肺腺癌样本中的表达,用免疫组化的方法验证ALDH2在肺腺癌中的表达。采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析ALDH2在LUAD中的临床特征关系及预后价值。用免疫棒棒糖图显示ALDH2与免疫浸润关系。结果对于TCGA数据库下载的数据进行分析,可得到ALDH2在33种癌症中的表达情况,发现ALDH2在多形成性胶质细胞瘤、子宫内膜癌、乳腺浸润癌、肺腺癌、食管癌、胃和食管癌、混合肾癌、前列腺癌、胃癌、头颈鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、肺鳞癌、肝细胞癌、肾母细胞瘤、黑色素瘤、膀胱尿路上皮癌、甲状腺癌、卵巢浆液性囊腺癌、子宫肉瘤、白血病、急性髓细胞样白血病、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、肾上腺皮质癌、肾嫌色细胞癌和胆管癌中低表达(P<0.001);在胶质瘤、脑低级别胶质瘤、肾乳头状细胞癌、结肠癌、结直肠癌和胰腺癌中表达上升(P<0.001);对肺腺癌及正常组织进行分析,发现ALDH2在LUAD中低表达(P<0.001);在肺腺癌中ALDH2的表达与患者的ALDH2的表达水平与肿瘤T分期(P=0.041)、淋巴结转移(P=0.009)、病理分级(P=0.037)、年龄(P=0.038)以及吸烟史(P=0.019)等临床特征显著相关;将肺腺癌患者分为高、低表达ALDH2两组,总体生存时间(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无进展间隔(PFI)、首次进展生存期(FP)、无复发生存期(RFS)具有显著差异;ROC分析ALDH2基因表达水平对预测患者有较好敏感性;ALDH2表达与免疫浸润的CD8+T细胞、T细胞、辅助性T细胞、CD56bright NK细胞、肥大细胞、嗜酸粒细胞和DC细胞显著相关;免疫组化显示LUAD中存在ADH2低表达。结论ALDH2在肺腺癌中低表达,与其临床特征和患者预后情况具有相关性,可以作为肺腺癌患者预后良好的指标,且与免疫浸润相关。
关键词
乙醛脱氢酶2基因(ALDH2)
肺腺癌
TCGA数据库
生存预后
Keywords
Aldehyde dehydrogenase 2 gene(ALDH2)
Lung adenocarcinoma
TCGA database
Survival prognosis
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于生物信息学分析ALDH2对肺腺癌的预后价值评估
申效榕
闫梓翼
黄园莉
朱清
张光辉
慈红非
吴琼
高琴
吴礼高
《齐齐哈尔医学院学报》
2023
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