Schr?dinger药物虚拟筛选流程模块在大学生物和化学信息学教学中的应用

介绍了Schr?dinger药物虚拟筛选的基本原理和流程,结合大学生物和化学信息学课程的相关教学内容,分别描述了蛋白受体的预处理、类药性五原则、毒药物动力学(ADME)、泛筛选干扰化合物(PAINS)、高通量虚拟筛选、标准精度筛选、高精度筛选和MM/GBSA的打分排序原理和使用方法。该软件可以在大学生物和化学信息学的教学中演示,有助于提高学生对蛋白结构、分子构象、药物虚拟筛选和计算机辅助分子设计的理解,该软件有很好的图形界面,可以给学生直观的体验,大大丰富了大学课堂的教学内容。此外,该软件在药物设计领域里面也有很好的应用价值,大大节约了药物筛选的成本,提高了药物发现的效率。

基于C6C IPv6 IaaS云服务平台的交叉学科教学实践

为推动我国以IPv6为核心的下一代互联网技术的创新与普及，在教育部科技发展中心的指导下，自2015年起，赛尔网络有限公司每年出资2000万元，面向全国高校举办“下一代互联网创新项目”和“下一代互联网技术创新大赛”，鼓励扶持以大学生为核心的下一代互联网技术创新，以推动中国IPv6网络技术的普及与发展。

医学生的依恋模式及其与心理弹性和共情的关系研究

目的:研究医学生的依恋模式及其与心理弹性和共情的关系。方法:采用关系问卷、心理弹性量表和中文版人际反应指针量表对甘肃省某医学院校400名医学生进行问卷调查。结果:(1)与舍友关系、对自己外表的满意程度、是否谈过恋爱和有无特长这些因素与依恋类型显著相关;(2)安全型依恋医学生的心理弹性得分明显高于其他依恋类型,倾注型依恋医学生的共情得分明显高于回避型依恋医学生。结论:依恋模式与多种因素有关,安全型依恋医学生的心理弹性最好,倾注型依恋医学生的共情能力好于回避型依恋医学生。

IPv6云平台助力生物医药人工智能教学竞赛

C6C IPv6 IaaS云服务器可以提供足够多的IPv6地址,根据用户需求弹性提供硬件配置,并通过网页提供简易的可视化界面,可以让课堂内容变得更加丰富。随着科学技术的进步,人们已经进入到到人工智能与大数据的时代。在这个时代,云计算仍然起着核心作用,尤其是优质的云计算服务平台如C6C IPv6 Iaa S云服务平台,可以高效处理人工智能计算和大数据问题。伴随着IPv4地址的耗尽,IPv6在云服务器平台建设中起到了重要的作用,基于一个全球单播的IPv6地址又可以组建内网,这样就会有更充足的网络地址来部署云服务器,进而更好地满足目前人工智能和大数据的运算需求。

基于云计算的糖尿病受体与药物的分子动力学模拟

针对传统生物医药学实验在进行糖尿病药物设计时的周期长、计算资源分散等问题,提出了采用高性能计算云的方式,将计算作为一种服务提供给用户,为开展分子动力学模拟等计算密集型任务提供可靠的解决方案。首先,利用分子可视化软件(VMD)构建两种人类胰高血糖素样肽-1受体蛋白(GLP-1R)分子体系;其次,以阿里云云计算平台为依托,采用分子动力学模拟计算软件(NAMD)对两种分子进行模拟计算,通过结果数据中的一系列相关性能指标对当下主流的同构、异构架构云主机的扩展瓶颈进行分析比较;最后,可视化两种分子的运动过程。理论分析和模拟计算的结果表明,异构计算优势较为明显,有20余倍的加速;但由于CPU与GPU、GPU之间的通信开销和负载不均衡等原因,使其扩展受到限制。实验观察到了GLP-1R受体和配体相互结合时精细动态相互作用的运动过程。该模拟结果不仅对研究者采用高性能计算云开展大规模分子模拟有一定的借鉴,而且对设计具有靶向性的II型糖尿病药物也有参考价值。

橡胶沥青应力吸收层在盐通高速公路上的应用研究

反射裂缝是我国沥青路面的主要病害。橡胶沥青应力吸收层是预防反射裂缝的重要措施之一。文章通过疲劳试验、剪切性能试验对橡胶沥青应力吸收层的路用性能进行了评价,并通过连盐高速试验路的铺筑,研究了橡胶沥青应力吸收层的施工工艺,对施工中存在地问题进行了分析,并提出了相应的解决办法。

VP3 G–H环中氨基酸突变对O型口蹄疫病毒生物学特性的影响

【目的】为了研究O型口蹄疫病毒VP3 G–H环中氨基酸突变对其生物学特性的影响。【方法】借助口蹄疫病毒反向遗传操作技术平台拯救出2株定点突变体rHNV3174Y和rHND3173N+V3174E+N3179C。进行蚀斑形成试验、一步生长曲线的绘制、TCID50和LD50的测定、间接免疫荧光与激光共聚焦显微镜检测。【结果】结果显示,与骨架病毒rHN相比,虽然rHNV3174Y和rHND3173N+V3174E+N3179C对BHK-21细胞的感染性及其蚀斑表型和复制动力学无显著性差异;但rHNV3174Y和rHND3173N+V3174E+N3179C对乳鼠的致病力明显减弱,且均获得了小窝蛋白介导侵染CHO-K1细胞的能力。【结论】VP3上第3174位特征性氨基酸突变影响O型口蹄疫病毒感染宿主细胞的毒力及其内吞作用路径,这有助于我们认知VP3 G-H环在口蹄疫病毒粒子立体空间构象中潜在的作用。