组蛋白去乙酰化酶11在肺鳞癌中的表达及预后意义

背景肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)是非小细胞肺癌的主要亚型。既往研究已经揭示了肺鳞状细胞癌中多种基因和通路的改变。然而,针对肺鳞状细胞癌的靶向治疗迄今未成功,且治疗方案有限。因此,寻找新的靶点以改善肺鳞状细胞癌患者的生存预后至关重要。目的探究组蛋白去乙酰化酶11(histone deacetylase 11,HDAC11)在肿瘤组织中的表达与LUSC患者临床病理特征的关系及其对预后的影响。方法选取2009年5月—2014年1月在空军军医大学唐都医院确诊的LUSC患者,收集LUSC组织及邻近正常组织样本,使用免疫组织化学染色法分析组织中HDAC11表达。随访患者的生存情况,分析HDAC11表达与LUSC患者总生存期(overall survival,OS)关系。使用GEPIA 2数据库中LUSC资料进一步验证HDAC11基因与生存及预后的联系,并对相关基因和蛋白进行分析。结果共纳入77例LUSC患者,病理组织分析发现HDAC11在LUSC组织中的表达高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。随访截至2022年11月1日,50例患者死亡,中位OS为2.4年。高表达HDAC11的LUSC患者中位生存期更短[1.9(95%CI:1.7~3.3)年vs 3.2(95%CI:2.7~4.0)年],Cox回归分析显示HDAC11高表达是患者不良预后的独立关联因素(HR=2.275,95%CI:1.256~4.120,P=0.007)。来源于GEPIA 2数据库LUSC病例的生存分析也证实了HDAC11表达与患者OS(HR=1.709,95%CI:1.525~1.956)关联。此外,在GEPIA 2数据库中本课题组识别了与HDAC11表达相似的基因,这些基因涉及细胞迁移、运输等生理过程,并与STAT3、MDM2等癌基因存在显著关联,提示HDAC11可能通过调控这些基因影响肿瘤发生。结论HDAC11的高表达与LUSC患者的不良预后相关,有望成为LUSC患者全新的治疗靶点和疗效评判标准。

酸性核磷蛋白32A作为癌症中潜在的预后和免疫治疗生物标志物的泛癌分析研究

目的:评估酸性核磷蛋白32A(ANP32A)与多种类型人类癌症的生存预后和免疫学调控的相关性。方法:ANP32A的差异表达分析基于基因型组织表达(GTEx)、癌症细胞系百科全书(CCLE)和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库的数据。采用COX回归检验和Kaplan-Meier检验进行预后分析,Spearman检验进行相关分析。利用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)来富集相关信号通路。免疫组化(IHC)染色和蛋白免疫印记(western blot,WB)检测ANP32A和RNA结合蛋白人抗原R(HuR)在非小细胞肺癌中的表达,并分析两者之间的相关性。结果:在多种癌症中,肿瘤组织中的ANP32A表达明显高于正常组织,COX回归分析显示约10种癌症的ANP32A表达与预后有显著相关性,其中7种癌症类型中ANP32A高表达与不良总生存期相关,包括急性髓性白血病、肾上腺皮质癌和急性淋巴细胞白血病缓解期等。然而,在多形性低级别胶质瘤、肾透明细胞癌和胸腺瘤这3种癌症中,ANP32A高表达时患者预后良好。进一步分析表明,ANP32A表达与多种免疫检查点和免疫相关基因显著相关。此外,ANP32A与肿瘤微环境中免疫细胞浸润、RNA修饰、基因组异质性和肿瘤干性也存在密切关系。GO和KEGG分析显示,ANP32A参与调控信使RNA剪接加工、核糖核蛋白复合体生物发生和组蛋白修饰等信号通路。IHC数据表明在非小细胞肺癌中ANP32A和HuR的表达呈正相关,WB结果证实ANP32A能够诱导人非小细胞肺癌A549细胞系中HuR的表达,提示ANP32A可能通过调控HuR参与信使RNA剪接加工等生理过程。结论:ANP32A是一种新型肿瘤预后预测因子,并在肿瘤免疫细胞浸润、RNA修饰、基因组异质性、肿瘤干性和信使RNA剪接加工等方面发挥重要免疫学调控作用。

野生型胃肠道间质瘤的研究进展

胃肠道间质瘤(GIST)是最常见的消化道间叶组织来源肿瘤,约10%的GIST患者分子检测无KIT/PDGFRA基因突变,称为野生型GIST。根据是否有琥珀酸脱氢酶B(SDHB)表达缺失,野生型GIST可分为SDH缺陷型和非SDH缺陷型,SDH缺陷型包括无综合征相关性、Carney三联征相关性及Carney-stratakis综合征相关性GIST;非SDH缺陷型包括BRAF突变、Ⅰ型神经纤维瘤病相关性、K/N-RAS突变及四重野生型GIST等。野生型GIST的发生发展、临床病理特征和治疗原则均与KIT或PDGFRA突变的GIST有较大差异。本文就野生型GIST的分子机制和临床诊疗进展做一综述。

基于Oncomine和TCGA数据库分析GABRE在结肠癌组织中的表达及生物学意义

目的:通过挖掘Oncomine和TCGA等数据库信息分析GABRE基因在结肠癌中的表达及其生物学意义。方法:利用Oncomine、TCGA数据库分析GABRE基因在结肠癌组织中的表达及其与患者预后的关系;运用TargetScan、starBase、mirDIP和miRWalk寻找靶向GABRE基因的上游miRNA,并分析其在结肠癌中的表达及其与预后的关系。进一步利用LinkedOmics数据库寻找GABRE共表达基因,并进行GO富集分析及KEGG通路分析。结果:数据库数据分析显示,GABRE在结肠癌组织中高表达且预示着患者预后较差(均P<0.05)。韦恩图显示,hsa-miR-370-3p靶向GABRE,并在正常组织中的表达显著升高(P<0.01)。GABRE基因与OGT、FAM156A基因等表达呈正相关(P<0.05),与ATP5A1、MPDU1基因等表达呈负相关(P<0.05)。GO生物功能及KEGG通路富集分析提示,GABRE基因可能参与蛋白脱烷基化和周期蛋白依赖性蛋白激酶活性调节等生物学过程,并在牛磺酸代谢和NF-κB信号通路等方面富集。结论:GABRE基因在结肠癌患者中高表达且预示着患者预后较差,提示该基因是结肠癌的诊断和治疗的潜在新靶点。