大豆胞囊线虫相关G2-like转录因子生物信息学分析

G2-like转录因子在植物中广泛存在,是GARP转录因子超家族中重要成员之一,在叶绿体发育、果实生长、生物或非生物胁迫和植物衰老等方面均起重要作用。研究对大豆胞囊线虫3号生理小种胁迫下东农L-10(抗病)根部进行转录组测序,初步筛选得到8个与大豆胞囊线虫抗性相关G2-like转录因子,并通过在线软件对其作生物信息学分析。结果表明,G2-like家族成员中8个G2-like转录因子均定位于细胞核,为亲水性蛋白;蛋白质二级结构大多以无规则卷曲为主;Gl GLK-3含有与大豆生长发育及逆境胁迫密切相关顺式作用元件。GlGLK-1、GlGLK-2、GlGLK-5和GlGLK-7与拟南芥ATGLK1和ATGLK2亲缘关系最近,预示其在功能上相似性。