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锦绣黄桃漆酶基因PpLAC7的克隆、亚细胞定位及表达分析
1
作者
龚意辉
张灿美
+4 位作者
周桂花
陈玫羽
谭倩
皮水勤
曾永贤
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024年第5期72-79,共8页
为克隆锦绣黄桃漆酶基因PpLAC7序列,分析PpLAC7基因序列信息及其在果肉褐变中的作用。以锦绣黄桃为试材,采用同源克隆方法从锦绣黄桃中获得漆酶基因PpLAC7的cDNA序列。采用生物信息学软件对PpLAC7基因的启动子元件、蛋白质理化性质、蛋...
为克隆锦绣黄桃漆酶基因PpLAC7序列,分析PpLAC7基因序列信息及其在果肉褐变中的作用。以锦绣黄桃为试材,采用同源克隆方法从锦绣黄桃中获得漆酶基因PpLAC7的cDNA序列。采用生物信息学软件对PpLAC7基因的启动子元件、蛋白质理化性质、蛋白质二级、三级结构、系统发育进化树和同源氨基酸序列比对进行分析。此外还对PpLAC7基因进行亚细胞定位以及在果肉褐变过程中的表达规律进行了分析。生物信息学分析表明,PpLAC7的启动子区域含有光响应元件、茉莉酸响应元件、干旱响应元件、种子特异性调控等元件。PpLAC7基因全长为1692 bp,其蛋白质共编码563个氨基酸,分子质量为61.867 ku,总原子数为8621个,亲水系数为-0.028,理论等电点为5.95,不稳定指数为36.48,脂溶性指数为87.26。PpLAC7蛋白的α-螺旋、延长链、β-转角、无规则卷曲分别占氨基酸总数的14.74%,28.77%,6.22%,50.27%。进化树结果显示,PpLAC7基因与苹果MdLAC7基因具有较高的同源性,PpLAC7基因的氨基酸序列同样含有3个典型的铜离子结构域。亚细胞定位结果表明,PpLAC7定位于内质网。PpLAC7基因在锦绣黄桃果肉褐变过程中呈大量上调表达。结合锦绣黄桃果肉褐变指数与PpLAC7表达量的关系,推测PpLAC7可能在锦绣黄桃果肉褐变过程中起重要的作用。
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关键词
锦绣黄桃
PpLAC7基因
果肉褐变
基因克隆
生物信息学分析
亚细胞定位
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职称材料
题名
锦绣黄桃漆酶基因PpLAC7的克隆、亚细胞定位及表达分析
1
作者
龚意辉
张灿美
周桂花
陈玫羽
谭倩
皮水勤
曾永贤
机构
湖南人文科技学院农业与生物技术学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024年第5期72-79,共8页
基金
湖南省自然科学区域联合基金项目(2024JJ7235)。
文摘
为克隆锦绣黄桃漆酶基因PpLAC7序列,分析PpLAC7基因序列信息及其在果肉褐变中的作用。以锦绣黄桃为试材,采用同源克隆方法从锦绣黄桃中获得漆酶基因PpLAC7的cDNA序列。采用生物信息学软件对PpLAC7基因的启动子元件、蛋白质理化性质、蛋白质二级、三级结构、系统发育进化树和同源氨基酸序列比对进行分析。此外还对PpLAC7基因进行亚细胞定位以及在果肉褐变过程中的表达规律进行了分析。生物信息学分析表明,PpLAC7的启动子区域含有光响应元件、茉莉酸响应元件、干旱响应元件、种子特异性调控等元件。PpLAC7基因全长为1692 bp,其蛋白质共编码563个氨基酸,分子质量为61.867 ku,总原子数为8621个,亲水系数为-0.028,理论等电点为5.95,不稳定指数为36.48,脂溶性指数为87.26。PpLAC7蛋白的α-螺旋、延长链、β-转角、无规则卷曲分别占氨基酸总数的14.74%,28.77%,6.22%,50.27%。进化树结果显示,PpLAC7基因与苹果MdLAC7基因具有较高的同源性,PpLAC7基因的氨基酸序列同样含有3个典型的铜离子结构域。亚细胞定位结果表明,PpLAC7定位于内质网。PpLAC7基因在锦绣黄桃果肉褐变过程中呈大量上调表达。结合锦绣黄桃果肉褐变指数与PpLAC7表达量的关系,推测PpLAC7可能在锦绣黄桃果肉褐变过程中起重要的作用。
关键词
锦绣黄桃
PpLAC7基因
果肉褐变
基因克隆
生物信息学分析
亚细胞定位
Keywords
Jinxiu yellow peach
PpLAC7 gene
Flesh browning
Gene cloning
Bioinformatics analysis
Subcellular localization
分类号
S662 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
锦绣黄桃漆酶基因PpLAC7的克隆、亚细胞定位及表达分析
龚意辉
张灿美
周桂花
陈玫羽
谭倩
皮水勤
曾永贤
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024
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