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金黄色葡萄球菌青霉素结合蛋白PBPX基因的克隆与表达
被引量:
5
1
作者
李文通
盛佩群
+4 位作者
羊晓敏
陈逸璐
何文迪
夏佳音
陈新江
《生物技术》
CAS
2018年第5期425-427,454,共4页
[目的]对金黄色葡萄球菌一种新的青霉素结合蛋白(PBPX)进行原核表达,为新型抗菌药物设计提供参考数据。[方法]将ATCC25923基因组数据通过Blast进行比对,从中发现了一个含有PBP保守结构域的基因序列,命名为PBPX。PCR扩增PBPX基因,将扩增...
[目的]对金黄色葡萄球菌一种新的青霉素结合蛋白(PBPX)进行原核表达,为新型抗菌药物设计提供参考数据。[方法]将ATCC25923基因组数据通过Blast进行比对,从中发现了一个含有PBP保守结构域的基因序列,命名为PBPX。PCR扩增PBPX基因,将扩增产物酶切后与原核表达载体p ET-32a(+)连接,构建表达PBPX的重组质粒,将该重组质粒转化大肠杆菌TG1内,增菌培养后提取质粒,经PCR、双酶切鉴定后,再转化大肠杆菌BL21(DE3),对转化菌株诱导后进行10%SDS-PAGE分析。[结果]构建了表达载体p ET-32a(+)-PBPX,在37℃经异丙基-β-D硫代半乳糖苷(IPTG)诱导后获得表达,重组青霉素结合蛋白分子量为52. 2 k Da。[结论]PBPX基因成功克隆到表达载体内并获得了表达。
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关键词
金黄色葡萄球菌
青霉素结合蛋白
药物靶点
克隆
表达
原文传递
金黄色葡萄球菌前噬菌体PT1028ORF001基因的生物信息学分析及原核表达
被引量:
2
2
作者
何文迪
陈新江
+6 位作者
吴立山
盛佩群
吴玲净
陈逸璐
羊晓敏
吴佳艳
李文通
《生物技术》
CAS
2019年第4期336-342,共7页
[目的]对金黄色葡萄球菌前噬菌体的PT1028ORF001基因进行生物信息学分析,并进行原核表达,为金黄色葡萄球菌前噬菌体基因的功能研究提供参考数据。[方法]将金黄色葡萄球菌ATCC 25923菌株功能未知的基因通过BLAST比对,从中发现了一个噬菌...
[目的]对金黄色葡萄球菌前噬菌体的PT1028ORF001基因进行生物信息学分析,并进行原核表达,为金黄色葡萄球菌前噬菌体基因的功能研究提供参考数据。[方法]将金黄色葡萄球菌ATCC 25923菌株功能未知的基因通过BLAST比对,从中发现了一个噬菌体PT1028的基因序列,将该基因命名为PT1028ORF001。使用Protparam、Prot Comp9. 0、NCBI保守结构域数据库、TMpred、Net Phos 3. 1 Server、PSIPRED、SWISS-MODEL等在线生物信息软件,分析PT1028ORF001蛋白的理化性质、亚细胞定位、保守结构域、跨膜区域、磷酸化修饰位点、二级结构和三维结构。用自行设计的引物扩增PT1028ORF001基因,扩增产物经酶切回收后与原核表达载体p ET-32a相连接,构建重组表达质粒,将该重组质粒转化E. coli TG1内,经菌落PCR鉴定后,增菌培养并提取质粒,再转化E. coli BL21 (DE3),经IPTG诱导表达后进行SDS-PAGE检测分析。[结果]PT1028ORF001蛋白由569个氨基酸组成,相对分子质量为64 671. 34 Da,等电点为8. 07,负电荷氨基酸残基总数为71个,正电荷氨基酸总数为73个,分子式:C2894H4530N762O885S16,原子总数9087个,是一种稳定的亲水蛋白质,定位于细胞膜上,与功能未知的DUF927蛋白超家族具有高度同源性,第202-223、240-258位氨基酸分别形成一个典型的跨膜区,潜在的磷酸化修饰位点共71个,二级结构中ɑ螺旋占比最高(40. 60%),其次是无规则卷曲(39. 89%),三维空间结构与二级结构预测结果相符。成功构建了表达载体p ET-32a(+)-PT1028ORF001,经IPTG诱导后重组蛋白获得了表达,蛋白相对分子质量为82. 4 k Da。[结论]PT1028ORF001基因的生物信息学分析结果以及该基因的成功克隆与表达,为深入研究该蛋白及其他金黄色葡萄球菌前噬菌体基因的功能奠定了一定基础。
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关键词
金黄色葡萄球菌
前噬菌体
PT1028ORF001基因
PT1028ORF001蛋白
生物信息学
原核表达
原文传递
题名
金黄色葡萄球菌青霉素结合蛋白PBPX基因的克隆与表达
被引量:
5
1
作者
李文通
盛佩群
羊晓敏
陈逸璐
何文迪
夏佳音
陈新江
机构
宁波卫生职业技术学院医学技术学院
浙江医药高等专科学校制药工程学院
出处
《生物技术》
CAS
2018年第5期425-427,454,共4页
基金
宁波市教育科学规划重点课题(No.2018YZD035)
浙江医药高等专科学校校级科研项目(No.ZPCSR2016008)
文摘
[目的]对金黄色葡萄球菌一种新的青霉素结合蛋白(PBPX)进行原核表达,为新型抗菌药物设计提供参考数据。[方法]将ATCC25923基因组数据通过Blast进行比对,从中发现了一个含有PBP保守结构域的基因序列,命名为PBPX。PCR扩增PBPX基因,将扩增产物酶切后与原核表达载体p ET-32a(+)连接,构建表达PBPX的重组质粒,将该重组质粒转化大肠杆菌TG1内,增菌培养后提取质粒,经PCR、双酶切鉴定后,再转化大肠杆菌BL21(DE3),对转化菌株诱导后进行10%SDS-PAGE分析。[结果]构建了表达载体p ET-32a(+)-PBPX,在37℃经异丙基-β-D硫代半乳糖苷(IPTG)诱导后获得表达,重组青霉素结合蛋白分子量为52. 2 k Da。[结论]PBPX基因成功克隆到表达载体内并获得了表达。
关键词
金黄色葡萄球菌
青霉素结合蛋白
药物靶点
克隆
表达
Keywords
Staphylococcus aureus
penicillin - binding protein
drug target
cloning
expression
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
金黄色葡萄球菌前噬菌体PT1028ORF001基因的生物信息学分析及原核表达
被引量:
2
2
作者
何文迪
陈新江
吴立山
盛佩群
吴玲净
陈逸璐
羊晓敏
吴佳艳
李文通
机构
宁波卫生职业技术学院医学技术学院
宁波美康盛德医学检验所有限公司
出处
《生物技术》
CAS
2019年第4期336-342,共7页
基金
浙江省教育科学规划课题(2019SCG114)
宁波市教育科学规划重点课题(2018YZD035)
浙江医药高等专科学校校级科研项目(ZPCSR2016008)
文摘
[目的]对金黄色葡萄球菌前噬菌体的PT1028ORF001基因进行生物信息学分析,并进行原核表达,为金黄色葡萄球菌前噬菌体基因的功能研究提供参考数据。[方法]将金黄色葡萄球菌ATCC 25923菌株功能未知的基因通过BLAST比对,从中发现了一个噬菌体PT1028的基因序列,将该基因命名为PT1028ORF001。使用Protparam、Prot Comp9. 0、NCBI保守结构域数据库、TMpred、Net Phos 3. 1 Server、PSIPRED、SWISS-MODEL等在线生物信息软件,分析PT1028ORF001蛋白的理化性质、亚细胞定位、保守结构域、跨膜区域、磷酸化修饰位点、二级结构和三维结构。用自行设计的引物扩增PT1028ORF001基因,扩增产物经酶切回收后与原核表达载体p ET-32a相连接,构建重组表达质粒,将该重组质粒转化E. coli TG1内,经菌落PCR鉴定后,增菌培养并提取质粒,再转化E. coli BL21 (DE3),经IPTG诱导表达后进行SDS-PAGE检测分析。[结果]PT1028ORF001蛋白由569个氨基酸组成,相对分子质量为64 671. 34 Da,等电点为8. 07,负电荷氨基酸残基总数为71个,正电荷氨基酸总数为73个,分子式:C2894H4530N762O885S16,原子总数9087个,是一种稳定的亲水蛋白质,定位于细胞膜上,与功能未知的DUF927蛋白超家族具有高度同源性,第202-223、240-258位氨基酸分别形成一个典型的跨膜区,潜在的磷酸化修饰位点共71个,二级结构中ɑ螺旋占比最高(40. 60%),其次是无规则卷曲(39. 89%),三维空间结构与二级结构预测结果相符。成功构建了表达载体p ET-32a(+)-PT1028ORF001,经IPTG诱导后重组蛋白获得了表达,蛋白相对分子质量为82. 4 k Da。[结论]PT1028ORF001基因的生物信息学分析结果以及该基因的成功克隆与表达,为深入研究该蛋白及其他金黄色葡萄球菌前噬菌体基因的功能奠定了一定基础。
关键词
金黄色葡萄球菌
前噬菌体
PT1028ORF001基因
PT1028ORF001蛋白
生物信息学
原核表达
Keywords
Staphylococcus aureus
prophage
PT1028ORF001 gene
PT1028ORF001 protein
bioinformatics analysis
prokaryotic expression
分类号
R378.11 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
金黄色葡萄球菌青霉素结合蛋白PBPX基因的克隆与表达
李文通
盛佩群
羊晓敏
陈逸璐
何文迪
夏佳音
陈新江
《生物技术》
CAS
2018
5
原文传递
2
金黄色葡萄球菌前噬菌体PT1028ORF001基因的生物信息学分析及原核表达
何文迪
陈新江
吴立山
盛佩群
吴玲净
陈逸璐
羊晓敏
吴佳艳
李文通
《生物技术》
CAS
2019
2
原文传递
已选择
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