高危急性髓系白血病异基因造血干细胞移植后复发的防治

急性髓系白血病(AML)是一组高度异质性的克隆性疾病,化学药物治疗和造血干细胞移植均为治疗AML的方法。对于高危AML患者而言,异基因造血干细胞移植为治疗该疾病的有效手段,但部分AML患者造血干细胞移植后仍可能面临疾病复发的问题,大多数复发患者再行化学药物治疗、二次移植等的效果不佳,是导致患者异基因造血干细胞移植后死亡的主要原因。因此,加强对异基因造血干细胞移植后AML患者的随访,并采取一些合适的手段预防移植后复发显得尤为重要。本文就高危AML患者异基因造血干细胞移植后复发的监测、药物治疗和细胞治疗进行综述,以期为改善高危AML患者异基因造血干细胞移植预后提供参考。

急性髓系白血病关键基因的筛选及功能验证

目的基于生物信息学方法筛选急性髓系白血病(AML)发生、发展及预后相关的关键基因,并对其所涉及的功能进行分析。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载AML患者芯片表达谱GSE84881数据集,包含19例AML样本和4例正常组织样本。利用GEO在线分析工具GEO2R筛选差异表达基因。利用DAVID在线网站对差异表达基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;使用STRING在线数据库对差异表达基因进行蛋白质互作网络(PPI)分析,并利用Cytoscape软件筛选得到关键基因;利用加权基因共表达网络分析工具(WGCNA)构建共表达网络得到中心基因。利用联川生物云平台构建韦恩图,将PPI中的关键基因和中心基因进行交叉,获得真正的关键基因。从GEO数据库下载并分析人体组织的转录组测序(RNA-seq)数据集GSE2191和GSE90062,验证筛选出来的关键基因。利用GEPIA数据库中的数据,采用Kaplan-Meier法分析关键基因对AML总生存(OS)的影响。结果GSE84881数据集中共识别出247个差异表达基因,包括112个上调基因和135个下调基因。GO富集分析结果显示,247个差异表达基因在生物学过程(BP)中主要富集在信号转导和细胞增殖的调控,在细胞成分(CC)中主要富集在细胞质和外泌体,在分子功能(MF)中主要富集在蛋白质结合和钙离子结合。进一步KEGG通路富集分析结果显示,247个差异表达基因主要参与NOD样受体信号通路和白细胞介素17(IL-17)信号通路。PPI中得到12个关键基因,利用WGCNA软件包从GSE84881数据集筛选13个中心基因,取交集得到1个真正的关键基因EGF。Kaplan-Meier法分析表明,EGF高表达组AML患者较EGF低表达组OS降低,差异有统计学意义(P=0.044)。结论EGF可能是AML诊断、治疗的靶点,以及AML临床治疗和预后预测的潜在生物标志物。