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基于高通量测序的两种高寒草甸土壤原核生物群落特征研究
被引量:
17
1
作者
卢慧
赵珩
+4 位作者
盛玉钰
丛微
王秀磊
李迪强
张于光
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第22期8080-8087,共8页
土壤微生物在生态系统中具有重要的生态功能,研究青藏高原高寒草甸的土壤原核生物群落组成及其主要影响因子,对揭示青藏高原独特的微生物地理区系和预测全球环境变化的影响有重要意义。利用Illumina Miseq高通量测序技术,结合分子生态网...
土壤微生物在生态系统中具有重要的生态功能,研究青藏高原高寒草甸的土壤原核生物群落组成及其主要影响因子,对揭示青藏高原独特的微生物地理区系和预测全球环境变化的影响有重要意义。利用Illumina Miseq高通量测序技术,结合分子生态网络,对青藏高原高寒沼泽化草甸和高寒草甸的土壤原核生物的群落组成特征进行了分析。结果共检测到23145个OTUs,可分为2个古细菌类群和33个已知的细菌类群;其中变形菌门、酸杆菌门、放线菌门和拟杆菌门为土壤的优势菌群,相对丰度累计超过79%;高寒草甸原核生物的多样性高于高寒沼泽化草甸,两种草甸类型原核生物群落特征具有显著差异性(P<0.001)。分子生态网络分析表明,高寒草甸网络具有较长的平均路径距离和较高的模块性,使其比高寒沼泽化草甸网络更能抵抗外界环境变化,在应对气候变化时具有更高的稳定性;典范对应分析(CCA)和分子生态网络的分析结果均表明,土壤p H值是影响土壤原核生物群落特征的主要影响因子。综上所述,土壤微生物群落的组成变化对于评估其对全球气候变化的响应具有重要的指示作用,土壤原核生物群落特征在不同的高寒草甸土壤中具有显著差异,了解其变化规律和影响因子,能为高寒草甸生态系统的适应性管理和应对气候变化提供理论依据。
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关键词
青藏高原
高通量测序
原核生物群落
高寒草甸
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职称材料
神农架国家公园林线过渡带土壤真菌多样性
被引量:
15
2
作者
盛玉钰
丛静
+4 位作者
卢慧
杨开华
杨林森
王敏
张于光
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第15期5322-5330,共9页
林线过渡带是陆地生态系统对气候变化响应的敏感区域,研究林线过渡带土壤真菌的群落结构和形成机制,对于预测气候变化对土壤养分循环和维持陆地生态系统功能的影响具有重要意义。利用Illumina高通量测序技术分析了神农架国家公园林线上...
林线过渡带是陆地生态系统对气候变化响应的敏感区域,研究林线过渡带土壤真菌的群落结构和形成机制,对于预测气候变化对土壤养分循环和维持陆地生态系统功能的影响具有重要意义。利用Illumina高通量测序技术分析了神农架国家公园林线上下的灌木林和针叶林的土壤真菌群落结构和多样性。结果表明,在真菌物种组成上,两种植被类型的土壤优势菌门、属和种类不同,针叶林和灌木林的优势菌门分别是担子菌门(Basidiomycota)和接合菌门(Zygomycota)。除趋势对应分析(DCA)和不相似性检验(Dissimilarity test)表明两种林型的土壤真菌群落结构组成存在显著差异,且针叶林土壤真菌Shannon指数、Chao值和Richness指数均显著(P<0.05)高于灌木林。典范对应分析(CCA)和Mantel检验显示土壤真菌群落结构与土壤p H、植物多样性、土壤温度和土壤湿度存在显著相关性。因此,林线过渡带上下的土壤真菌群落结构和多样性存在显著差异,土壤p H、植物多样性、土壤湿度和土壤温度可能是影响土壤真菌群落结构的重要因素。
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关键词
土壤真菌群落
气候变化
灌木林
针叶林
Illumina测序
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职称材料
基于功能基因芯片技术的高寒草甸土壤微生物功能基因研究
被引量:
5
3
作者
卢慧
赵珩
+4 位作者
盛玉钰
丛微
王秀磊
李迪强
张于光
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期3031-3037,共7页
土壤微生物是陆地生态系统的重要组成部分,在生物地球化学循环和维持生态系统功能等方面发挥着极其重要的作用。研究青藏高原高寒草甸的土壤微生物功能基因及其主要影响因子,对了解青藏高原微生物的功能代谢潜力和预测青藏高原受全球变...
土壤微生物是陆地生态系统的重要组成部分,在生物地球化学循环和维持生态系统功能等方面发挥着极其重要的作用。研究青藏高原高寒草甸的土壤微生物功能基因及其主要影响因子,对了解青藏高原微生物的功能代谢潜力和预测青藏高原受全球变化的影响具有重要意义。本研究选择三江源地区高寒沼泽化草甸和高寒草甸这两种草甸类型土壤微生物为对象,利用微生物功能基因芯片(GeoChip4.0)技术开展微生物功能基因多样性研究。结果表明:两种草甸样地共检测到各类型功能基因45818个,涉及到16类微生物介导的关键生物过程;除趋势对应分析和不相似性检验结果均表明,不同草甸类型的微生物功能基因结构有明显差异;检测到土壤微生物参与的所有碳代谢过程和关键的氮循环过程,高寒沼泽化草甸比高寒草甸具有较高的碳降解相关功能基因和氮素基因丰度和代谢潜力,但两种草甸类型的土壤有机碳和全氮含量相对稳定;典范对应分析结果表明,土壤p H值和土壤含水量是影响微生物功能基因结构的主要因素。综上,本研究结果有助于了解环境变化对高寒草地生态系统结构和功能的影响,可为高寒草地生态系统的保护和管理提供科学依据。
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关键词
土壤微生物群落
功能基因芯片
功能基因
高寒草甸
原文传递
青海三江源高寒草甸土壤微生物功能多样性的海拔分布
被引量:
2
4
作者
盛玉钰
卢慧
+4 位作者
喻海茫
丛静
王秀磊
刘晓
张于光
《现代生物医学进展》
CAS
2018年第1期37-42,107,共7页
本研究以空间替代时间的方法,在青海三江源国家级自然保护区,以每隔200 m-300 m的海拔差异,从海拔3220 m(S1)到4790 m(S6)共设立6个海拔梯度的高寒草甸土壤样地为研究对象,利用Biolog生态板法研究了不同海拔土壤微生物碳源利用功能多样...
本研究以空间替代时间的方法,在青海三江源国家级自然保护区,以每隔200 m-300 m的海拔差异,从海拔3220 m(S1)到4790 m(S6)共设立6个海拔梯度的高寒草甸土壤样地为研究对象,利用Biolog生态板法研究了不同海拔土壤微生物碳源利用功能多样性分布特征,试图分析海拔变化对多样性分布特征的影响及其响应。结果表明,随着海拔的升高,微生物群落碳源利用功能多样性指数整体呈现先下降后上升的趋势,与AWCD变化趋势一致;DCA分析显示不同海拔土壤微生物对碳源代谢结构有一定的空间差异;不同海拔梯度的土壤微生物对6类碳源的利用程度存在差异,其中多聚化合物为优势碳源;从CCA和Partial mantel分析得知,土壤微生物群落的碳源利用功能多样性的海拔分布格局与海拔高度、全磷含量、有效磷含量呈显著相关关系,而与植物多样性没有相关性。了解不同海拔下土壤微生物对碳源利用强度,可为揭示三江源的微生物过程提供基础数据。
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关键词
三江源
Biolog生态板
功能多样性
海拔梯度
原文传递
题名
基于高通量测序的两种高寒草甸土壤原核生物群落特征研究
被引量:
17
1
作者
卢慧
赵珩
盛玉钰
丛微
王秀磊
李迪强
张于光
机构
中央民族大学生命与环境科学学院
中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所
出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第22期8080-8087,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31370145,31670614)
国家科技部自然保护区生物保本资源共享子平台项目(2005DKA21404).
文摘
土壤微生物在生态系统中具有重要的生态功能,研究青藏高原高寒草甸的土壤原核生物群落组成及其主要影响因子,对揭示青藏高原独特的微生物地理区系和预测全球环境变化的影响有重要意义。利用Illumina Miseq高通量测序技术,结合分子生态网络,对青藏高原高寒沼泽化草甸和高寒草甸的土壤原核生物的群落组成特征进行了分析。结果共检测到23145个OTUs,可分为2个古细菌类群和33个已知的细菌类群;其中变形菌门、酸杆菌门、放线菌门和拟杆菌门为土壤的优势菌群,相对丰度累计超过79%;高寒草甸原核生物的多样性高于高寒沼泽化草甸,两种草甸类型原核生物群落特征具有显著差异性(P<0.001)。分子生态网络分析表明,高寒草甸网络具有较长的平均路径距离和较高的模块性,使其比高寒沼泽化草甸网络更能抵抗外界环境变化,在应对气候变化时具有更高的稳定性;典范对应分析(CCA)和分子生态网络的分析结果均表明,土壤p H值是影响土壤原核生物群落特征的主要影响因子。综上所述,土壤微生物群落的组成变化对于评估其对全球气候变化的响应具有重要的指示作用,土壤原核生物群落特征在不同的高寒草甸土壤中具有显著差异,了解其变化规律和影响因子,能为高寒草甸生态系统的适应性管理和应对气候变化提供理论依据。
关键词
青藏高原
高通量测序
原核生物群落
高寒草甸
Keywords
Qinghai-Tibetan Plateau
high-throughput sequencing
prokaryotic community
alpine meadow
分类号
S812.2 [农业科学—草业科学]
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职称材料
题名
神农架国家公园林线过渡带土壤真菌多样性
被引量:
15
2
作者
盛玉钰
丛静
卢慧
杨开华
杨林森
王敏
张于光
机构
中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林生态环境重点实验室
青岛大学附属医院
中央民族大学生命与环境科学学院
神农架国家公园管理局神农架金丝猴保育生物学湖北省重点实验室
出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第15期5322-5330,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31670614
31370145)
文摘
林线过渡带是陆地生态系统对气候变化响应的敏感区域,研究林线过渡带土壤真菌的群落结构和形成机制,对于预测气候变化对土壤养分循环和维持陆地生态系统功能的影响具有重要意义。利用Illumina高通量测序技术分析了神农架国家公园林线上下的灌木林和针叶林的土壤真菌群落结构和多样性。结果表明,在真菌物种组成上,两种植被类型的土壤优势菌门、属和种类不同,针叶林和灌木林的优势菌门分别是担子菌门(Basidiomycota)和接合菌门(Zygomycota)。除趋势对应分析(DCA)和不相似性检验(Dissimilarity test)表明两种林型的土壤真菌群落结构组成存在显著差异,且针叶林土壤真菌Shannon指数、Chao值和Richness指数均显著(P<0.05)高于灌木林。典范对应分析(CCA)和Mantel检验显示土壤真菌群落结构与土壤p H、植物多样性、土壤温度和土壤湿度存在显著相关性。因此,林线过渡带上下的土壤真菌群落结构和多样性存在显著差异,土壤p H、植物多样性、土壤湿度和土壤温度可能是影响土壤真菌群落结构的重要因素。
关键词
土壤真菌群落
气候变化
灌木林
针叶林
Illumina测序
Keywords
soil fungal community
climate change
shrub forest
coniferous forest
Illumina sequencing
分类号
S714.3 [农业科学—林学]
下载PDF
职称材料
题名
基于功能基因芯片技术的高寒草甸土壤微生物功能基因研究
被引量:
5
3
作者
卢慧
赵珩
盛玉钰
丛微
王秀磊
李迪强
张于光
机构
中央民族大学生命与环境科学学院
中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局生物多样性保护重点实验室
出处
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期3031-3037,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31370145和31670614)
国家科技部自然保护区生物保本资源共享子平台项目(2005DKA21404)资助
文摘
土壤微生物是陆地生态系统的重要组成部分,在生物地球化学循环和维持生态系统功能等方面发挥着极其重要的作用。研究青藏高原高寒草甸的土壤微生物功能基因及其主要影响因子,对了解青藏高原微生物的功能代谢潜力和预测青藏高原受全球变化的影响具有重要意义。本研究选择三江源地区高寒沼泽化草甸和高寒草甸这两种草甸类型土壤微生物为对象,利用微生物功能基因芯片(GeoChip4.0)技术开展微生物功能基因多样性研究。结果表明:两种草甸样地共检测到各类型功能基因45818个,涉及到16类微生物介导的关键生物过程;除趋势对应分析和不相似性检验结果均表明,不同草甸类型的微生物功能基因结构有明显差异;检测到土壤微生物参与的所有碳代谢过程和关键的氮循环过程,高寒沼泽化草甸比高寒草甸具有较高的碳降解相关功能基因和氮素基因丰度和代谢潜力,但两种草甸类型的土壤有机碳和全氮含量相对稳定;典范对应分析结果表明,土壤p H值和土壤含水量是影响微生物功能基因结构的主要因素。综上,本研究结果有助于了解环境变化对高寒草地生态系统结构和功能的影响,可为高寒草地生态系统的保护和管理提供科学依据。
关键词
土壤微生物群落
功能基因芯片
功能基因
高寒草甸
Keywords
soil microbial community
GeoChip
functional gene
alpine meadow.
分类号
S812.2 [农业科学—草业科学]
原文传递
题名
青海三江源高寒草甸土壤微生物功能多样性的海拔分布
被引量:
2
4
作者
盛玉钰
卢慧
喻海茫
丛静
王秀磊
刘晓
张于光
机构
中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林生态环境重点实验室
中央民族大学生命与环境科学学院
湖南省长沙县职业中专学校
青岛大学附属医院
出处
《现代生物医学进展》
CAS
2018年第1期37-42,107,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31370145
31670614)
国家自然保护区生物标本资源共享子平台(2005DKA21404)
文摘
本研究以空间替代时间的方法,在青海三江源国家级自然保护区,以每隔200 m-300 m的海拔差异,从海拔3220 m(S1)到4790 m(S6)共设立6个海拔梯度的高寒草甸土壤样地为研究对象,利用Biolog生态板法研究了不同海拔土壤微生物碳源利用功能多样性分布特征,试图分析海拔变化对多样性分布特征的影响及其响应。结果表明,随着海拔的升高,微生物群落碳源利用功能多样性指数整体呈现先下降后上升的趋势,与AWCD变化趋势一致;DCA分析显示不同海拔土壤微生物对碳源代谢结构有一定的空间差异;不同海拔梯度的土壤微生物对6类碳源的利用程度存在差异,其中多聚化合物为优势碳源;从CCA和Partial mantel分析得知,土壤微生物群落的碳源利用功能多样性的海拔分布格局与海拔高度、全磷含量、有效磷含量呈显著相关关系,而与植物多样性没有相关性。了解不同海拔下土壤微生物对碳源利用强度,可为揭示三江源的微生物过程提供基础数据。
关键词
三江源
Biolog生态板
功能多样性
海拔梯度
Keywords
Sanjiangyuan
Biolog Eco-Plates
Functional diversity
Altitudinal gradient
分类号
Q938.13 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高通量测序的两种高寒草甸土壤原核生物群落特征研究
卢慧
赵珩
盛玉钰
丛微
王秀磊
李迪强
张于光
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
17
下载PDF
职称材料
2
神农架国家公园林线过渡带土壤真菌多样性
盛玉钰
丛静
卢慧
杨开华
杨林森
王敏
张于光
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
15
下载PDF
职称材料
3
基于功能基因芯片技术的高寒草甸土壤微生物功能基因研究
卢慧
赵珩
盛玉钰
丛微
王秀磊
李迪强
张于光
《生态学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
5
原文传递
4
青海三江源高寒草甸土壤微生物功能多样性的海拔分布
盛玉钰
卢慧
喻海茫
丛静
王秀磊
刘晓
张于光
《现代生物医学进展》
CAS
2018
2
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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