高通量测序分析不同断奶时间对南方黄牛犊牛瘤胃细菌菌群的影响

本试验旨在研究不同断奶时间对南方黄牛犊牛瘤胃微生物多样性、物种丰度的影响。选用18头南方黄牛犊牛,依据出生体重相近原则随机分成对照组(NW,n=3)和早期断奶组(EW,n=15)。NW组不早期断奶;3个早期断奶组逐渐增加开食料、青饲料的饲喂量,当犊牛连续3 d每日进食固体饲料干物质分别达500 g(EW500,n=5)、750 g(EW750,n=5)和1 000 g(EW1000,n=5)时,停喂代乳粉。犊牛断奶后利用口腔取样装置获取瘤胃内容物样品,用Illumina-Mi Seq高通量测序技术分析瘤胃细菌结构和组成的变化。结果表明:NW组瘤胃细菌最多的是厚壁菌门(P<0.05);EW组拟杆菌门相对较高,EW750和EW1000组较NW组差异显著(P<0.05);瘤胃内细菌在属水平上普雷沃氏菌占比例较多,EW组的普雷沃氏菌较NW组有所增加(P>0.05),丁酸弧菌属和琥珀酸菌属均显著增加(P<0.05),但EW500、EW750和EW1000组间差异不显著(P>0.05);EW组分支杆菌属和颤螺菌属较NW组显著降低(P<0.05)。由此可见,早期断奶能显著影响犊牛瘤胃细菌多样性及物种丰度,但是不同早期断奶时间处理组之间差异不显著,从瘤胃微生物角度,推荐日采食固体饲料干物质达500 g时断奶。