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基于转录组测序的温带臭虫SSR和SNP位点分析
被引量:
10
1
作者
李敏
王青
+2 位作者
陈晨
付艺杰
石太瑞
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2019年第4期52-57,共6页
[目的]温带臭虫( Cimex lectularius )是世界性分布的吸血性寄生虫,主要靠吸食人血为生。探究温带臭虫转录组SSR和SNP分布规律,可为后期温带臭虫的SSR和SNP分子标记开发、遗传多样性分析以及遗传图谱构建等研究奠定基础。[方法]以转录...
[目的]温带臭虫( Cimex lectularius )是世界性分布的吸血性寄生虫,主要靠吸食人血为生。探究温带臭虫转录组SSR和SNP分布规律,可为后期温带臭虫的SSR和SNP分子标记开发、遗传多样性分析以及遗传图谱构建等研究奠定基础。[方法]以转录组数据为基础,利用软件msatcommander v0.8.2和SOAPsnp v1.03系统分析了SSR 和SNP 位点多态性和分布特征。[结果]温带臭虫转录组数据的25 468条unigene中含有4 758个SSR位点,分布在4 171 unigene序列中。其中单核苷酸重复的次数最多,共有2 795个,占总数的58.74%,其次是三核苷酸重复和二核苷酸重复分别是984个(20.68%)和764个(16.06%),四核苷酸重复有195个(4.10%),而五、六核苷酸重复最少,仅出现20次(0.42%)。在温带臭虫的SSR位点中,共出现30个重复基元,其中优势的重复基元类型是A/T,共有 2 757 个,其次是AT/AT,有474个,ATT/AAT有342个。在25 468个unigene中共发现76 562个simple SNPs,其中转换类型46 634个,占60.91%,颠换类型29 928个,占39.09%。碱基转换类型比例高于颠换类型。6种单碱基变异类型中,C-T发生频率最高,比例为30.69%,其次为A-G,比例为30.22%。[结论]温带臭虫转录组中SSR和SNP位点数量多,出现频率高,且类型丰富。
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关键词
温带臭虫
转录组
微卫星
单核苷酸多态性
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职称材料
儿童文学创作论片
2
作者
石太瑞
《创作与评论》
CSSCI
北大核心
1996年第6期17-20,共4页
儿童文学创作论片石太瑞我国儿童文学的发展碰上了千载难逢的好机遇:党中央高度重视儿童文学,中共中央总书记江泽民同志发出了抓好“长篇小说、电影电视、儿童文学创作”三大件的指示之后,1995年8月26日又与李鹏总理分别致信...
儿童文学创作论片石太瑞我国儿童文学的发展碰上了千载难逢的好机遇:党中央高度重视儿童文学,中共中央总书记江泽民同志发出了抓好“长篇小说、电影电视、儿童文学创作”三大件的指示之后,1995年8月26日又与李鹏总理分别致信上海美术出版社和浙江人民美术出版社...
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关键词
儿童文学作品
儿童文学创作
儿童文学作家
创作论
少年儿童
社会主义
教育主义
文学精品
“儿童反儿童化”
机遇和挑战
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职称材料
四月八圆舞曲(外二首)
3
作者
石太瑞
《民族论坛》
北大核心
1998年第4期37-37,共1页
关键词
圆舞曲
节日
湖南省
还没有
脚印
目标
副主席
平日
到达
纪念
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职称材料
风的季节
4
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
2002年第21期31-,共1页
~~
关键词
私奔
季节
大地
悬崖
筑巢
永久
白鹤
果实
欲望
上游
原文传递
面对大山
5
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1999年第9期24-24,共1页
关键词
大山
行程
悬崖
民间
密林
过错
演出
燕子
开花
装入
原文传递
月色荷塘
6
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1999年第12期15-15,共1页
关键词
荷花
季节
竹林
鸟声
红泥
西边
污泥
东边
风尘
自身
原文传递
台湾纪行(三首)
7
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1998年第11期65-66,共2页
关键词
台湾
相思树
唐诗宋词
张大千
引人入胜
同乡会
麻辣味
地图
台北
半个世纪
原文传递
永州怀古(二首)
8
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1997年第4期53-54,共2页
关键词
永州八记
柳宗元
流放地
潇水
湘南
柳氏
指印
竹笠
不适宜
重镇
原文传递
湘西之恋(三首)
9
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1992年第7期45-46,共2页
关键词
王秋赦
秦书田
李国香
一对夫妻
扫过
卫生部门
哭嫁
说爱
三村
原文传递
南方
10
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1996年第1期40-40,共1页
关键词
甘蔗
稻谷
桔桔
菠萝
金黄
成熟
流蜜
竹笛
原文传递
湘西之恋(二首)
11
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1990年第8期34-35,共2页
~~
关键词
屈子
千里路
天问
德夯风景区
于溪
木楼
原文传递
寻找故事(二首)
12
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1993年第11期13-14,共2页
~~
关键词
坎坎坷坷
锈迹斑斑
十年
那西
桐木
原文传递
风的季节(外一首)
13
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
2003年第7期28-28,共1页
关键词
外一首
一朵花
原文传递
日月潭(外一首)
14
作者
石太瑞
《诗刊》
北大核心
2000年第10期35-35,共1页
关键词
外一首
日月潭
原文传递
牧草青青
15
作者
石太瑞
《人民文学》
北大核心
1990年第5期44-44,共1页
关键词
大树下
原文传递
高原的歌者
16
作者
石太瑞
《民族文学》
2014年第11期81-84,共4页
他不是高原人,而是高原的歌者。 他歌唱雪山,歌唱草原,歌唱飞翔的雄鹰,歌唱奔驰的骏马。他用诗描绘一幅幅边疆风情画,唱响一首首雪域儿女的心灵曲。 他,就是著名土家族诗人汪承栋。 汪承栋出生于湖南湘西酉水河畔不远处的一个土家山...
他不是高原人,而是高原的歌者。 他歌唱雪山,歌唱草原,歌唱飞翔的雄鹰,歌唱奔驰的骏马。他用诗描绘一幅幅边疆风情画,唱响一首首雪域儿女的心灵曲。 他,就是著名土家族诗人汪承栋。 汪承栋出生于湖南湘西酉水河畔不远处的一个土家山寨。1950年冬正在县城师范学院读书的他,听从抗美援朝的召唤,毅然弃学从军。他没被派往前线,而是被分配到军分区文工队任创作员,还要兼任演员,在歌剧《白毛女》里,他出演过穆仁智。
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关键词
酉水
土家山寨
湖南湘西
风情画
湖南省作家协会
文学梦
诗的女神
长篇叙事诗
中央民族歌舞团
《诗刊》
原文传递
澧源渡
17
作者
石太瑞
《诗刊》
1978年第8期52-52,共1页
关键词
渡口
红军
原文传递
梭镖歌电影《枫树湾》主题歌
18
作者
石太瑞
白诚仁
谭志斌
《人民音乐》
1976年第4期35-37,共3页
原文传递
题名
基于转录组测序的温带臭虫SSR和SNP位点分析
被引量:
10
1
作者
李敏
王青
陈晨
付艺杰
石太瑞
机构
太原师范学院生物系
山西农业大学农学院
出处
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2019年第4期52-57,共6页
基金
国家自然科学基金(31501840)
山西农业大学博士后科学基金(134845)
+1 种基金
山西省高等学校科技创新项目(2017169)
国家级大学生创新创业项目(2017361)
文摘
[目的]温带臭虫( Cimex lectularius )是世界性分布的吸血性寄生虫,主要靠吸食人血为生。探究温带臭虫转录组SSR和SNP分布规律,可为后期温带臭虫的SSR和SNP分子标记开发、遗传多样性分析以及遗传图谱构建等研究奠定基础。[方法]以转录组数据为基础,利用软件msatcommander v0.8.2和SOAPsnp v1.03系统分析了SSR 和SNP 位点多态性和分布特征。[结果]温带臭虫转录组数据的25 468条unigene中含有4 758个SSR位点,分布在4 171 unigene序列中。其中单核苷酸重复的次数最多,共有2 795个,占总数的58.74%,其次是三核苷酸重复和二核苷酸重复分别是984个(20.68%)和764个(16.06%),四核苷酸重复有195个(4.10%),而五、六核苷酸重复最少,仅出现20次(0.42%)。在温带臭虫的SSR位点中,共出现30个重复基元,其中优势的重复基元类型是A/T,共有 2 757 个,其次是AT/AT,有474个,ATT/AAT有342个。在25 468个unigene中共发现76 562个simple SNPs,其中转换类型46 634个,占60.91%,颠换类型29 928个,占39.09%。碱基转换类型比例高于颠换类型。6种单碱基变异类型中,C-T发生频率最高,比例为30.69%,其次为A-G,比例为30.22%。[结论]温带臭虫转录组中SSR和SNP位点数量多,出现频率高,且类型丰富。
关键词
温带臭虫
转录组
微卫星
单核苷酸多态性
Keywords
Cimex lectularius
Transcriptome
Simple sequencerepeat
Single nucleotide polymorphism
分类号
Q968.9 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
儿童文学创作论片
2
作者
石太瑞
出处
《创作与评论》
CSSCI
北大核心
1996年第6期17-20,共4页
文摘
儿童文学创作论片石太瑞我国儿童文学的发展碰上了千载难逢的好机遇:党中央高度重视儿童文学,中共中央总书记江泽民同志发出了抓好“长篇小说、电影电视、儿童文学创作”三大件的指示之后,1995年8月26日又与李鹏总理分别致信上海美术出版社和浙江人民美术出版社...
关键词
儿童文学作品
儿童文学创作
儿童文学作家
创作论
少年儿童
社会主义
教育主义
文学精品
“儿童反儿童化”
机遇和挑战
分类号
I207.8 [文学—中国文学]
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职称材料
题名
四月八圆舞曲(外二首)
3
作者
石太瑞
机构
中国作协
出处
《民族论坛》
北大核心
1998年第4期37-37,共1页
关键词
圆舞曲
节日
湖南省
还没有
脚印
目标
副主席
平日
到达
纪念
分类号
I227 [文学—中国文学]
下载PDF
职称材料
题名
风的季节
4
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
2002年第21期31-,共1页
文摘
~~
关键词
私奔
季节
大地
悬崖
筑巢
永久
白鹤
果实
欲望
上游
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
面对大山
5
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
1999年第9期24-24,共1页
关键词
大山
行程
悬崖
民间
密林
过错
演出
燕子
开花
装入
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
月色荷塘
6
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
1999年第12期15-15,共1页
关键词
荷花
季节
竹林
鸟声
红泥
西边
污泥
东边
风尘
自身
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
台湾纪行(三首)
7
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
1998年第11期65-66,共2页
关键词
台湾
相思树
唐诗宋词
张大千
引人入胜
同乡会
麻辣味
地图
台北
半个世纪
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
永州怀古(二首)
8
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
1997年第4期53-54,共2页
关键词
永州八记
柳宗元
流放地
潇水
湘南
柳氏
指印
竹笠
不适宜
重镇
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
湘西之恋(三首)
9
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
1992年第7期45-46,共2页
关键词
王秋赦
秦书田
李国香
一对夫妻
扫过
卫生部门
哭嫁
说爱
三村
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
南方
10
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
1996年第1期40-40,共1页
关键词
甘蔗
稻谷
桔桔
菠萝
金黄
成熟
流蜜
竹笛
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
湘西之恋(二首)
11
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
1990年第8期34-35,共2页
文摘
~~
关键词
屈子
千里路
天问
德夯风景区
于溪
木楼
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
寻找故事(二首)
12
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
1993年第11期13-14,共2页
文摘
~~
关键词
坎坎坷坷
锈迹斑斑
十年
那西
桐木
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
风的季节(外一首)
13
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
2003年第7期28-28,共1页
关键词
外一首
一朵花
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
日月潭(外一首)
14
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
北大核心
2000年第10期35-35,共1页
关键词
外一首
日月潭
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
牧草青青
15
作者
石太瑞
出处
《人民文学》
北大核心
1990年第5期44-44,共1页
关键词
大树下
分类号
I27 [文学—中国文学]
原文传递
题名
高原的歌者
16
作者
石太瑞
机构
中国作家协会
出处
《民族文学》
2014年第11期81-84,共4页
文摘
他不是高原人,而是高原的歌者。 他歌唱雪山,歌唱草原,歌唱飞翔的雄鹰,歌唱奔驰的骏马。他用诗描绘一幅幅边疆风情画,唱响一首首雪域儿女的心灵曲。 他,就是著名土家族诗人汪承栋。 汪承栋出生于湖南湘西酉水河畔不远处的一个土家山寨。1950年冬正在县城师范学院读书的他,听从抗美援朝的召唤,毅然弃学从军。他没被派往前线,而是被分配到军分区文工队任创作员,还要兼任演员,在歌剧《白毛女》里,他出演过穆仁智。
关键词
酉水
土家山寨
湖南湘西
风情画
湖南省作家协会
文学梦
诗的女神
长篇叙事诗
中央民族歌舞团
《诗刊》
分类号
I267 [文学—中国文学]
原文传递
题名
澧源渡
17
作者
石太瑞
出处
《诗刊》
1978年第8期52-52,共1页
关键词
渡口
红军
分类号
I227 [文学—中国文学]
原文传递
题名
梭镖歌电影《枫树湾》主题歌
18
作者
石太瑞
白诚仁
谭志斌
出处
《人民音乐》
1976年第4期35-37,共3页
分类号
J60 [艺术—音乐]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序的温带臭虫SSR和SNP位点分析
李敏
王青
陈晨
付艺杰
石太瑞
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2019
10
下载PDF
职称材料
2
儿童文学创作论片
石太瑞
《创作与评论》
CSSCI
北大核心
1996
0
下载PDF
职称材料
3
四月八圆舞曲(外二首)
石太瑞
《民族论坛》
北大核心
1998
0
下载PDF
职称材料
4
风的季节
石太瑞
《诗刊》
北大核心
2002
0
原文传递
5
面对大山
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1999
0
原文传递
6
月色荷塘
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1999
0
原文传递
7
台湾纪行(三首)
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1998
0
原文传递
8
永州怀古(二首)
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1997
0
原文传递
9
湘西之恋(三首)
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1992
0
原文传递
10
南方
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1996
0
原文传递
11
湘西之恋(二首)
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1990
0
原文传递
12
寻找故事(二首)
石太瑞
《诗刊》
北大核心
1993
0
原文传递
13
风的季节(外一首)
石太瑞
《诗刊》
北大核心
2003
0
原文传递
14
日月潭(外一首)
石太瑞
《诗刊》
北大核心
2000
0
原文传递
15
牧草青青
石太瑞
《人民文学》
北大核心
1990
0
原文传递
16
高原的歌者
石太瑞
《民族文学》
2014
0
原文传递
17
澧源渡
石太瑞
《诗刊》
1978
0
原文传递
18
梭镖歌电影《枫树湾》主题歌
石太瑞
白诚仁
谭志斌
《人民音乐》
1976
0
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