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双硫死亡相关LncRNA的胃癌预后模型构建与验证
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作者 凤亮 曹志国 +3 位作者 石小琪 张启坤 陈昌裕 余昌俊 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第8期1429-1439,共11页
目的 基于二硫化物应激导致的新型细胞死亡类型,探究与其相关的长链非编码RNA(LncRNA)在胃癌中的作用,建立双硫死亡相关的胃癌预后模型,为胃癌治疗的预后情况评估提供新的方式。方法 使用公开数据库TCGA获得胃癌与正常组织样本的转录组... 目的 基于二硫化物应激导致的新型细胞死亡类型,探究与其相关的长链非编码RNA(LncRNA)在胃癌中的作用,建立双硫死亡相关的胃癌预后模型,为胃癌治疗的预后情况评估提供新的方式。方法 使用公开数据库TCGA获得胃癌与正常组织样本的转录组数据,并通过Pearson分析与LASSO-Cox回归分析挑选双硫死亡相关LncRNA。基于上述LncRNA构建出相关的胃癌预后模型,并通过功能富集分析、肿瘤微环境和免疫细胞浸润分析、药物敏感性分析、定量逆转录PCR(RT-qPCR)等进行验证。结果 本研究识别出400个双硫死亡相关的LncRNA,并筛选出其中5个构建预后模型,用于评估胃癌患者的预后情况。模型在验证中显示,高风险评分组的生存期明显短于低风险评分组(P<0.05)。此外,预后模型的预测能力(AUC=0.725)优于仅依据年龄和性别等基本特征进行预测。双硫死亡相关LncRNA在正常组织与胃癌组织中的表达水平存在显著差异(P<0.001)。结论 该研究构建的双硫死亡相关LncRNA预后模型可以用于评估胃癌患者的预后情况和肿瘤微环境,为胃癌新的免疫治疗策略提供潜在的靶点和理论基础。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 细胞死亡 胃癌
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孟德尔随机化研究免疫表型与胆囊炎间的因果关系
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作者 凤亮 石小琪 余昌俊 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2024年第5期0121-0125,共5页
胆囊炎是一种常见的消化系统疾病,与显著的炎症反应相关。尽管免疫细胞在胆囊炎的进展中起着关键作用,但关于特定免疫表型与胆囊炎间的因果关系的研究还是较为有限。本研究旨在通过孟德尔随机化方法探索这些免疫表型与胆囊炎间的因果联... 胆囊炎是一种常见的消化系统疾病,与显著的炎症反应相关。尽管免疫细胞在胆囊炎的进展中起着关键作用,但关于特定免疫表型与胆囊炎间的因果关系的研究还是较为有限。本研究旨在通过孟德尔随机化方法探索这些免疫表型与胆囊炎间的因果联系。方法 本研究基于IEU OpenGWAS项目数据库获取免疫表型及胆囊炎的样本信息,使用R语言的TwoSampleMR包进行双样本孟德尔随机化分析。分析结果通过逆方差加权法、加权众数法、加权中位数法、MR-Egger法和简单模型进行进一步验证。结果 本研究筛选出了7种免疫表型与胆囊炎发病显著相关(Pfdr<0.05)。CD127?CD8br T细胞、CD28?CD8br T细胞上CD127表达水平、CD80单核细胞、CD33br-HLA-DR+髓样细胞上CD45表达水平是胆囊炎的危险因素。CD28+ CD45RA+ CD8br T细胞、CD28?CD4?CD8?T细胞、HLA-DR+ CD4+T细胞的CD3水平是胆囊炎的保护因素。我们还发现了胆囊炎对4种免疫细胞具有因果作用。胆囊炎可导致CD20?B细胞的表达水平上升。还可以导致CD33+HLA DR+髓样细胞、单核细胞和粒细胞上的CD11c表达水平下降。结论 本研究通过MR分析全面评估了731种免疫细胞与胆囊炎之间的密切联系,这为今后探究胆囊炎的发病机制及治疗方法提供新的思路。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 胆囊炎 免疫表型
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肠道菌群与放射性肠炎的相互作用及研究进展
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作者 石小琪 汪红艳 《国际肿瘤学杂志》 CAS 2023年第4期244-247,共4页
放疗是腹部及盆腔肿瘤的重要治疗方法,但其不良反应放射性肠炎的发生率较高。腹部及盆腔放疗可诱导肠道隐窝细胞凋亡、破坏肠道屏障、改变肠道菌群组成,肠道菌群失调可加重放射性肠炎。粪便菌群移植及使用益生菌、益生元、抗生素等可调... 放疗是腹部及盆腔肿瘤的重要治疗方法,但其不良反应放射性肠炎的发生率较高。腹部及盆腔放疗可诱导肠道隐窝细胞凋亡、破坏肠道屏障、改变肠道菌群组成,肠道菌群失调可加重放射性肠炎。粪便菌群移植及使用益生菌、益生元、抗生素等可调节肠道菌群,是预防和治疗放射性肠炎的有效方法。 展开更多
关键词 胃肠道微生物组 肠炎 放射疗法
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