保定市1株新型HIV-1重组毒株的近似全长基因组鉴定分析

目的对保定市新发现的1株pol区不能明确分型的HIV-1毒株(BD226AJ)进行近似全长基因组扩增,并分析其亚型、重组模式和基因特点。方法提取患者血浆中HIV-1RNA并逆转录为cDNA,使用近末端稀释法分2段对其进行近似全长基因组扩增并测序。使用jpHMM和SimPlot 3.5软件对近似全长基因组序列进行重组模式和重组断点分析,采用MEGA 6.0软件分片段构建Neighbor-joining系统进化树进一步确认重组断点的准确性。构建该近似全长基因组序列及各亚型片段Neighbor-joining系统进化树,分析该毒株的亲本来源。结果经过近似全长基因组扩增、测序、序列拼接后,获得1条长度为8830 bp的HIV-1近似全长基因组序列。重组分析结果显示,该序列是由CRF01_AE和B亚型重组形成的,其近似全长基因组序列被3个断点分成了4个亚型片段,分别为ICRF01_AE(HXB2,823—4224 nt)、Ⅱ_(B)(HXB2,4225—5991 nt)、ⅢCRF01_AE(HX B2,5992—9295 nt)、ⅣB(HXB2,9296—9406 nt)。各亚型基因片段的系统进化树分析进一步表明该序列的可能亲本来源为CRF01_AE和B亚型。HIV BLAST的结果显示,该序列与CRF112_01B的相似性为96%,系统进化树分析进一步验证该序列与北京市男男性行为者(men who have sex with men,MSM)中的CRF112_01B序列聚集。结论本研究在保定市MSM人群中发现了1例由CRF01_AE和B亚型重组的新型重组毒株CRF112_01B,提示HIV-1CRF112_01B已通过MSM人群传入河北,并开始在保定市传播,因此加强该亚型或者类似新型毒株的监测,对有关部门采取针对性防控措施和遏制新型重组毒株在本地区的传播和流行具有重要意义。

CHB患者血清25(OH)D 3水平与肝脏炎症活动度及纤维化程度的相关性分析

目的分析慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)炎症活动度及肝纤维化程度与血清25羟维生素D 3[25(OH)D 3]水平的相关性。方法分析本院2018年5月至2020年4月收治的153例CHB患者的临床资料,检测其肝纤维化标志物透明质酸(hualuronic acid,HA)、层黏连蛋白(laminin,LN)、Ⅲ型前胶原(procollagen III,PCⅢ)、IV型胶原(collage typeⅣ,CIV),对患者的肝纤维化进行分期(SO~S4期),按照患者炎症活动度与肝纤维化程度分组,检测血清25(OH)D 3并比较分析。采用Pearson分析患者血清25(OH)D 3与炎症活动度及肝纤维化的相关性。结果患者血清25(OH)D 3水平指标随着炎症活动度升高而呈现下降趋势,不同炎症活动度患者的血清25(OH)D 3水平差异具有统计学意义(P<0.05);肝纤维化指标HA、LN、PCIII、与CIV随着肝纤维化程度水平升高,随着肝纤维化程度升高患者血清25(OH)D 3水平降低,差异具有统计学意义(P<0.05);血清25(OH)D 3水平与CHB炎症活动度(r=-0.772)、肝纤维化程度(r=-0.727)均显著相关(P<0.05)。结论CHB患者血清25(OH)D 3水平与炎症活动度及肝纤维化程度呈负相关,25(OH)D 3水平降低提示患者体内炎症活动加剧、肝纤维化程度加重。

HBcrAg、HBsAg对CHB患者肝组织炎症程度和纤维化程度的预测价值

目的分析慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者治疗前肝炎核心相关抗原(hepatitis B core-related antigen,HBcrAg)与乙型肝炎表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBsAg)对肝组织炎症程度与纤维化程度的预测价值,及采用恩替卡韦治疗后不同炎症程度与纤维化程度HBcrAg、HBsAg变化情况。方法回顾性分析我院2018年12月至2020年1月收治的CHB患者150例作为研究对象。根据其肝脏活检结果对其肝组织炎症程度与纤维化程度进行划分,采用受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)分析HBcrAg、HBsAg对肝脏炎症程度及纤维化程度的预测价值。所有患者均接受恩替卡韦治疗,观察不同炎症程度与纤维化程度患者治疗前、治疗12周、24周、48周时HBcrAg、HBsAg变化。结果根据广义估计方程分析显示,不同炎症程度及不同纤维化患者在组别及时点因素中,差异具有统计学意义(P<0.05)。其中治疗48周时HBcrAg、HBsAg水平显著低于治疗前、治疗12周、治疗24周,差异具有统计学意义(P<0.05);治疗24周显著低于治疗12周、治疗前,差异具有统计学意义(P<0.05);治疗12周显著低于治疗前,差异具有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析显示,HBcrAg、HBsAg预测G3患者的AUC分别为0.653、0.757;两项联合预测G3患者的AUC为0.879;HBcrAg、HBsAg预测S3患者的AUC分别为0.669、0.647;两项项联合预测S3患者的AUC为0.824。结论CHB患者接受恩替卡韦治疗后HBcrAg、HBsAg表达水平显著下降。HBcrAg、HBsAg对预测CHB患者肝组织炎症程度与肝纤维化程度具有一定价值。

25(OH)D_(3)与肝脏炎症分期和抗病毒疗效的相关性分析

目的探讨慢性乙型肝炎(CHB)患者血清25-羟基维生素D_(3)[25(OH)D_(3)]水平与抗病毒疗效及肝脏炎症分期的关系。方法选取120例CHB患者,根据治疗方式分为辅助治疗组(65例)、常规治疗组(55例)。采用Scheuer评分系统判定肝脏炎症分期,其中G1期12例、G2期54例、G3期39例、G4期15例。采用Pearson相关分析或Spearman相关分析评估各项指标之间的相关性。结果常规治疗组与辅助治疗组治疗12周乙型肝炎病毒(HBV)DNA和乙型肝炎e抗原(HBeAg)的转阴率差异均无统计学意义(P>0.05),治疗24周HBV DNA和HBeAg的转阴率差异均有统计学意义(P<0.05)。辅助治疗组与常规治疗组治疗前血清25(OH)D_(3)水平差异无统计学意义(P>0.05),治疗24周后2个组血清25(OH)D_(3)水平均显著高于治疗前(P<0.01),且辅助治疗组高于常规治疗组(P<0.001)。血清γ-干扰素(INF-γ)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平随CHB患者肝脏炎症分期的升高而升高(P<0.05),血清25(OH)D_(3)水平随肝脏炎症分期的升高而降低(P<0.05)。Spearman相关分析结果显示,25(OH)D_(3)水平与肝脏炎症分期呈负相关(r=-0.715,P<0.001);Pearson相关分析结果显示,25(OH)D_(3)与IL-6、TNF-α均呈负相关(r值分别为-0.262、-0.216,P<0.05),与INF-γ无相关性(r=-0.053,P>0.05)。结论CHB患者血清25(OH)D_(3)水平与肝脏炎症分期、抗病毒疗效有关。

保定市新诊断HIV感染者整合酶抑制剂原发耐药分析

目的了解保定地区2020年新报告人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染者整合酶抑制剂(integrase inhibitors,INIs)原发耐药情况,为治疗提供参考依据。方法收集保定市人民医院2020年1月至2020年12月经本市疾控新确证的未接受过含整合酶抑制剂(INIs)抗病毒治疗的96例HIV-1感染者的外周血样本,采用In-House方法,对血浆样本进行pol基因区扩增并测序,将拼接好的序列提交至美国斯坦福大学的HIV耐药数据库,分析整合酶(IN)区耐药突变位点及耐药程度。结果由于样本质量问题,扩增失败13例,共获得83份样本的HIV-1 pol区基因片段,基因亚型包括CRF01_AE 45例(54.2%),B亚型13例(15.7%),B+C亚型10例(12.0%),CRF07_BC 11例(13.3%),C亚型2例(2.4%),CRF55_01B 1例(1.2%),A亚型1例(1.2%)。8例存在IN区耐药突变位点,其中6例表现出对INIs耐药,INIs原发耐药率为7.2%,全部INIs耐药毒株均属于交叉耐药。其中IN区主要突变位点R263K、G140S、S147SG、E138A;IN区次要突变位点H51Y、A128AT、S153SF、A49AG、P145P、Q146QL,引起了拉替拉韦(Raltegravir,RAL)、埃替格韦(Elvitegravir,EVG)、多替拉韦(Dolutegravir,DTG)、贝克他韦(Bictegravir,BIC)四种INIs不同程度的耐药。结论保定地区新诊断HIV-1感染者中,存在原发性INIs基因突变,INIs原发耐药率为7.2%,应加强IN区耐药监测,合理调整INIs的用药方案。