中药组成分资源和实验数据库研究

目前已有的中药数据库缺乏中药组成分资源间的有效关联和实验支持。为此,针对植物类中药组成分,设计了一个面向组成分的资源和实验数据库。首先抽取关键的资源和实验数据,将其分为资源数据、实验能力数据和实验数据;然后定义各类数据内的实体以及实体间的关系,构建资源和实验统一数据模型;最后基于此模型实现了基于Web的中药组成分资源和实验数据库。测试实验表明,该数据库能有效地管理中药组成分资源和支持基于相关资源的实验。

基于分组贝叶斯排序的药物-靶标关系预测

基于贝叶斯排序的药物-靶标关系预测已经取得较好效果,但忽略了同一靶标的药物间的关联关系,从而影响精度。针对此问题,提出了一种新方法——基于分组贝叶斯排序的药物-靶标关系预测。在该方法中,根据与特定靶标存在相互作用的药物间具有相似性的现实,引入分组策略使这些相似药物间产生互动,并推导出基于分组策略的理论模型。该方法在五个公开数据集上与五种典型方法进行对比,产生的结果均优于所对比的方法。

漫谈生物的发光

发光生物的分布具有发光能力的生物,在大自然中分布很广,其中少数为一些细菌和真菌,大多数是存在于动物界的一些物种。细菌中的发光细菌(luminous bacteria),主要是海产的发光性水生微生物(plankton),目前已知的发光细菌,不下百十种之多,其中具有显著发光现象的有:磷光假单胞菌(photobacterium phosphoreum)、费氏无色菌(A chromobacter fisheri)、磷光弧菌(Vibrio phosphorescens)和发光杆菌(Bacillus photogenus)。这些发光细菌,除了常常引起夜间海面发光外,还由于它们的孳生繁殖,成为被污染的死鱼、水产加工品、尸肉在黑暗中发光的原因。在缺少冷藏设备的过去年代,