基于转录组测序的藏猪睾丸组织性成熟相关基因鉴定

【目的】基于转录组测序分析筛选出藏猪睾丸组织中的性成熟相关基因,为提高藏猪的繁殖育种性能提供参考依据。【方法】以性成熟前(2月龄)和性成熟后(24月龄)的藏公猪为研究对象,通过人工阉割法采集藏猪睾丸组织进行转录组测序,依据错误发现率(FDR)<0.05且|log_(2)FoldChange|>1的标准筛选差异表达基因(DEGs),综合GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析筛选出藏公猪性成熟相关候选基因,并通过实时荧光定量PCR验证转录组测序结果的准确性。【结果】经转录组测序,从性成熟前后藏猪睾丸组织样品中筛选出5929个DEGs,其中有3822个DEGs呈上调表达、2107个DEGs呈下调表达。筛选获得的5929个DEGs主要注释到生精过程、纤毛运动、鞭毛精子运动、运动纤毛、精子主块、精子顶囊、动力蛋白轻链结合、动态蛋白中间链结合等与精子发生和精子运动等有关的GO功能条目;KEGG信号通路富集分析发现,DEGs主要富集于受体相互作用通路、轴突引导通路、神经活性配体—受体相互作用通路、钙信号通路等;综合DEGs的GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析结果,共筛选出9个与藏公猪性成熟相关的基因,分别是BAX、DMRT1、FSHR、IGF1R、IZUMO1、LYZL4、LYZL6、SYCP3和TNP2。实时荧光定量PCR检测结果显示,BAX、DMRT1、FSHR、IGF1R等4个基因在性成熟后藏猪睾丸组织中的相对表达量较性成熟前呈明显的下降趋势,且下降幅度均在50%以上;IZUMO1、LYZL4、LYZL6、SYCP3、TNP2等5个基因的相对表达量较性成熟前上升了1.07~30.25倍,其中IZUMO1、LYZL4和LYZL6基因的上升倍数达极显著水平(P<0.01),与转录组测序结果基本一致。【结论】基于转录组测序分析从藏猪睾丸组织中筛选获得9个与性成熟相关的DEGs,即BAX、DMRT1、FSHR、IGF1R、IZUMO1、LYZL4、LYZL6、SYCP3和TNP2,可作为研究藏猪繁殖育种能力的主要候选基因。

猪源芽孢杆菌的分离鉴定及其生物学特性研究

为了分离出潜在的猪源益生芽孢杆菌并探究其益生作用以期获得几株优良的芽孢杆菌菌株用于生产实践。试验采用仔猪粪便为原料,通过菌落形态观察、革兰氏染色、生理生化性质鉴定和16S rDNA序列分析、开展生物学特性分析、进行体外抑菌、药敏和淀粉酶、蛋白酶及纤维素酶活性测定等试验,对用营养琼脂固体培养基分离筛选出的两株菌株进行了研究。经过16S rDNA序列分析,确定培养得到的两株细菌为芽孢杆菌(Bacillus haynesii和Bacillus aerius),Bacillus aerius对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的生长繁殖没有明显的抑制作用;在试验所用到的十种药物中,这两株菌除了对红霉素不敏感外,对其余九种药物均有一定的敏感性;在酶活性试验中,两株菌的蛋白酶和淀粉酶活性比较强,纤维素酶的活性较弱。试验结果表明,这两株芽孢杆菌具有进一步研究并作为益生菌株开发利用的潜能。