基于乳腺癌ChIP-seq数据的p53抑癌机制研究

采用生物信息学方法分析野生型p53乳腺癌MCF7细胞的Ch IP-seq(染色质免疫共沉淀-测序)数据,以揭示p53的抑癌分子机制。从NCBI下载的编号为GSE47041的Ch IP-seq数据来源于三组试验,分别为:未经处理的乳腺癌MCF7细胞对照(NS_input),Nutlin-3a(一种MDM2拮抗剂)处理的MCF7细胞对照(S_input)和Nutlin-3a刺激MCF7细胞后加入p53抗体的实验组(S_p53)。Ch IP获得的DNA数据的测序平台为Illumina Hi Seq 2000。利用Bowtie参照人基因组hg19进行序列比对;利用MACS进行峰信号检测,并利用自定义软件筛选p53可能的靶基因;利用DAVID在线工具对靶基因进行通路富集分析;最后利用STRING构建蛋白互作网络。研究共得到50个p53的靶基因,其中8个靶基因(CDKN1A、BBC3、BAX、DDB2、MDM2、CCNG1、XPC和PCNA)分别富集到p53信号转导通路和核苷酸切除修复通路两个通路上。在得到的由19个靶基因构成的蛋白质相互作用网络中,连通度最高的前5个基因分别是PCNA、MDM2、REV3L、CDKN1A和BAX。研究中采用的分析Ch IP-seq数据的方法能有效揭示野生型p53乳腺癌MCF7细胞中Nutlin-3a激活的p53的抑癌分子机制。

百合新品种‘初夏’

‘初夏’百合是以亚洲百合杂种系黄色花品种‘金角’（Golden Horn）为母本,以亚洲百合杂种系橙色花品种‘布鲁内诺’（Brunello）为父本,杂交选育而成。切花生产日数短,丰花。株高65-70cm,花径16-17cm。花橙色,无斑点,花丝和花柱橙色,花粉黑褐色。三倍体,生长强健,抗逆性强,适宜中国华东地区栽培。

亚洲百合杂交新品种‘雨荷’

‘雨荷’是以二倍体亚洲百合‘金角’（Golden Horn）为母本,四倍体亚洲百合‘布鲁内罗’（Brunello）为父本,杂交选育而成的三倍体新品种。花橙红色,有少量紫褐色斑点,花瓣肥厚。花丝和花柱橙色,花粉黑褐色。株高75－80cm,花径14－15cm。生长强健,抗逆性强,适宜中国华东地区栽培。