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烟草酪氨酸转氨酶基因家族分析
被引量:
3
1
作者
赵影影
王姗姗
+9 位作者
张剑锋
金立锋
陈霞
魏攀
王中
郑庆霞
许
亚
龙
祁超亚
位芳
王燃
《烟草科技》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1-8,共8页
为揭示烟草酪氨酸转氨酶(Tyrosine aminotransferase,TAT)基因家族的遗传特征和功能,利用生物信息学对不同烟草品种中该基因家族进行鉴定和分析。结果表明,普通烟草中存在4个TATs基因,林烟草和绒毛状烟草中各有3个TATs基因。亚家族Ⅰ中T...
为揭示烟草酪氨酸转氨酶(Tyrosine aminotransferase,TAT)基因家族的遗传特征和功能,利用生物信息学对不同烟草品种中该基因家族进行鉴定和分析。结果表明,普通烟草中存在4个TATs基因,林烟草和绒毛状烟草中各有3个TATs基因。亚家族Ⅰ中TATs基因的编码序列在1 263~1 338 bp,编码404~445个氨基酸,蛋白质分子量为42.81~49.64 k D,均为不含跨膜结构域的稳定蛋白。亚家族Ⅱ中TATs蛋白均为不稳定蛋白。除NtabTAT4外,其余TATs基因均含有7个外显子和6个内含子。烟草TATs蛋白可分为两类:Group Ⅰ和Group Ⅱ。qPCR分析表明,NtabTATs在普通烟草K326的根、茎、叶和花中都有表达。
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关键词
烟草
酪氨酸转氨酶
基因家族
进化分析
下载PDF
职称材料
普通烟草DHQ-SDH基因家族分析
被引量:
1
2
作者
张林
王中
+11 位作者
李正风
韦凤杰
贾云祯
张其东
汪洪焦
魏攀
谢小东
金立锋
李锋
祁超亚
张小全
王燃
《烟草科技》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期1-8,共8页
为明确DHQ-SDH基因在普通烟草中的功能,用拟南芥DHQ-SDH基因检索烟草基因组数据库,获得普通烟草DHQ-SDHs基因。利用生物信息学分析了Nt DHQ-SDHs的基因结构、蛋白质特征、启动子顺式作用元件和基因进化,用q PCR检测了Nt DHQ-SDHs的组织...
为明确DHQ-SDH基因在普通烟草中的功能,用拟南芥DHQ-SDH基因检索烟草基因组数据库,获得普通烟草DHQ-SDHs基因。利用生物信息学分析了Nt DHQ-SDHs的基因结构、蛋白质特征、启动子顺式作用元件和基因进化,用q PCR检测了Nt DHQ-SDHs的组织特异性表达。结果表明:普通烟草中有8个DHQ-SDHs基因。Nt DHQ-SDHs的编码序列在1 248~1 608 bp之间,编码415~535个氨基酸,蛋白质分子量为45.13~58.22 k D,均为稳定蛋白。Nt DHQ-SDHs的外显子和内含子数量相对保守,均含有8~10个外显子和7~9个内含子。基序组成和进化分析发现,8个Nt DHQ-SDHs被分为2个亚家族,分别来源于普通烟草的两个祖先种(林烟草和绒毛状烟草)。Nt DHQ-SDHs在普通烟草根、茎、叶和顶芽中都有表达。
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关键词
普通烟草
DHQ-SDH基因
基因家族
进化分析
基因表达
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职称材料
题名
烟草酪氨酸转氨酶基因家族分析
被引量:
3
1
作者
赵影影
王姗姗
张剑锋
金立锋
陈霞
魏攀
王中
郑庆霞
许
亚
龙
祁超亚
位芳
王燃
机构
郑州大学生命科学学院
中国烟草总公司郑州烟草研究院
出处
《烟草科技》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1-8,共8页
基金
中国烟草总公司烟草基因组计划重大专项项目"基于基因组编辑技术的烟草重要基因功能研究"[110201501015(JY-02)]
文摘
为揭示烟草酪氨酸转氨酶(Tyrosine aminotransferase,TAT)基因家族的遗传特征和功能,利用生物信息学对不同烟草品种中该基因家族进行鉴定和分析。结果表明,普通烟草中存在4个TATs基因,林烟草和绒毛状烟草中各有3个TATs基因。亚家族Ⅰ中TATs基因的编码序列在1 263~1 338 bp,编码404~445个氨基酸,蛋白质分子量为42.81~49.64 k D,均为不含跨膜结构域的稳定蛋白。亚家族Ⅱ中TATs蛋白均为不稳定蛋白。除NtabTAT4外,其余TATs基因均含有7个外显子和6个内含子。烟草TATs蛋白可分为两类:Group Ⅰ和Group Ⅱ。qPCR分析表明,NtabTATs在普通烟草K326的根、茎、叶和花中都有表达。
关键词
烟草
酪氨酸转氨酶
基因家族
进化分析
Keywords
Tobacco
Tyrosine aminotransferase (TAT)
Gene family
Phylogenetic analysis
分类号
TS413 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
普通烟草DHQ-SDH基因家族分析
被引量:
1
2
作者
张林
王中
李正风
韦凤杰
贾云祯
张其东
汪洪焦
魏攀
谢小东
金立锋
李锋
祁超亚
张小全
王燃
机构
河南农业大学烟草学院
中国烟草总公司郑州烟草研究院
云南中烟工业有限责任公司
河南省烟草公司
出处
《烟草科技》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期1-8,共8页
基金
河南省科技攻关项目"基于原生质体再生技术的CRISPR/Cas9技术体系构建"(172102110153)
文摘
为明确DHQ-SDH基因在普通烟草中的功能,用拟南芥DHQ-SDH基因检索烟草基因组数据库,获得普通烟草DHQ-SDHs基因。利用生物信息学分析了Nt DHQ-SDHs的基因结构、蛋白质特征、启动子顺式作用元件和基因进化,用q PCR检测了Nt DHQ-SDHs的组织特异性表达。结果表明:普通烟草中有8个DHQ-SDHs基因。Nt DHQ-SDHs的编码序列在1 248~1 608 bp之间,编码415~535个氨基酸,蛋白质分子量为45.13~58.22 k D,均为稳定蛋白。Nt DHQ-SDHs的外显子和内含子数量相对保守,均含有8~10个外显子和7~9个内含子。基序组成和进化分析发现,8个Nt DHQ-SDHs被分为2个亚家族,分别来源于普通烟草的两个祖先种(林烟草和绒毛状烟草)。Nt DHQ-SDHs在普通烟草根、茎、叶和顶芽中都有表达。
关键词
普通烟草
DHQ-SDH基因
基因家族
进化分析
基因表达
Keywords
Nicotiana tabacum
DHQ-SDH gene
Gene family
Phylogenetic analysis
Gene expression
分类号
TS413 [农业科学—烟草工业]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烟草酪氨酸转氨酶基因家族分析
赵影影
王姗姗
张剑锋
金立锋
陈霞
魏攀
王中
郑庆霞
许
亚
龙
祁超亚
位芳
王燃
《烟草科技》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
下载PDF
职称材料
2
普通烟草DHQ-SDH基因家族分析
张林
王中
李正风
韦凤杰
贾云祯
张其东
汪洪焦
魏攀
谢小东
金立锋
李锋
祁超亚
张小全
王燃
《烟草科技》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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职称材料
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