应用生物信息学筛选结直肠癌Hub基因及验证

目的通过运用生物信息学分析,筛选出与结直肠癌相关的差异表达基因(Differentially Expressed genes,DEGs),并验证其生物学功能。方法云浮市人民医院检验科从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载结直肠癌芯片数据GSE 21815、GSE 31905、GSE 35279资料,应用GEO2R语言进行处理得出结直肠癌和正常结直肠组织之间的差异表达基因,并通过生物信息学工具DAVID、STRING、Cytoscape构建差异表达基因的蛋白互作网络,筛选Hub基因,应用基因本体论(Gene Ontology,GO)、基因百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析筛选出的Hub基因的生物功能,并利用MiRDB工具找出可能调控Hub基因的miRNA,并于2017—2022年8月收集30例结直肠癌组织和30例正常结直肠组织样本,通过实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)验证。结果经生物学信息分析和蛋白质相互作用网络图分析催产素受体基因、基质金属蛋白酶11基因、间质上皮转化因子基因、基质金属蛋白酶7基因、激肽释放酶8基因、激肽释放酶10基因为结直肠癌组织发生发展的关键Hub基因。结直肠癌组织中基质金属蛋白酶11基因(4.38±1.58)、间质上皮转化因子基因(2.69±0.29)、基质金属蛋白酶7基因(0.88±0.14)、激肽释放酶8基因(11.09±3.90)、激肽释放酶10基因mRNA(7.88±2.20)的表达,显著高于正常结直肠组织组织,差异有统计学意义(t=9.605、25.339、26.376、9.541、3.726,P均<0.001)。结论结直肠癌组织中基质金属蛋白酶11基因、间质上皮转化因子基因、基质金属蛋白酶7基因、激肽释放酶8基因、激肽释放酶10基因异常表达,可能参与结直肠癌发生过程,有望为后续结直肠癌基础研究及临床诊疗提供依据。

IL-37b基因克隆及其真核的表达载体构建

目的克隆IL-37b编码区基因,并构建其真核表达载体。方法通过RT-PCR扩增IL-37b编码区基因,DNA测序鉴定后,将阳性克隆提取质粒,通过酶切连接将目的片段定向克隆至真核表达载体pcDNA 3.1,通过菌落PCR和DNA测序等进行鉴定。结果凝胶电泳显示RT-PCR扩增出1条大小约650 bp特异条带,DNA测序结果显示获取了大小为654 bp的IL-37b编码区基因。PCR和DNA测序对所构建的真核表达载体鉴定结果表明IL-37b编码区基因正确插入真核表达载体pcDNA3.1。结论成功克隆了IL-37b编码区基因,并成功构建其真核表达载体,为下一步IL-37b生物学作用的深入研究奠定了基础。

云浮地区1983例新生儿耳聋基因筛查结果分析

目的分析云浮地区新生儿耳聋基因突变特点,为云浮地区的遗传性耳聋防治提供依据。方法收集该院2019年1月至2021年3月共1983例新生儿足跟血斑点标本,采用PCR+导流杂交法对4个常见耳聋基因[GJB2、SLC26A4、GJB3、线粒体DNA(mtDNA)]13个突变位点(GJB2:235delc、299delAT、176del16、35delG、155delTCTG;SLC26A4:IVS7-2A>G、1229C>T、2168A>G;GJB3:538C>T;mtDNA:12SrRNA1555A>G、12SrRNA1494C>T、tRNA7445A>G、tRNA12201T>C)进行检测,分析耳聋基因筛查结果。结果1983例新生儿4个常见耳聋基因突变携带率为2.72%(54/1983)。不同性别新生儿基因突变携带率(男婴2.45%,女婴3.06%)比较,差异无统计学意义(P>0.05)。GJB2、SLC26A4、GJB3、mtDNA基因携带率分别为1.51%(30/1983),0.96%(19/1983),0.10%(2/1983)和0.15%(3/1983),4个耳聋基因之间比较差异有统计学意义(χ^(2)=40.320,P<0.001)。13个基因位点突变频率以GJB2235delC(33.33%)最高,SLC26A4 IVS7-2A>G(25.93%)次之,mtDNA 12SrRNA1494C>T和mtDNA tRNA12201T>C未检出。54例耳聋基因突变新生儿中有34例完成听力筛查,其中32例为双耳均通过听力筛查。结论云浮地区新生儿遗传性耳聋基因以GJB2基因携带为主,基因位点突变频率以GJB2235delC最高,SLC26A4 IVS7-2A>G次之。同一地区不同基因突变携带率有所不同,不同地区相同基因突变位点的携带各有特点,需要根据当地突变特点采取合适的防治措施。

急性脑梗死患者血清Hcy、hs–CRP检测的临床价值

目的:探讨急性脑梗死患者血清同型半胱氨酸(Hcy)及超敏C–反应蛋白(hs–CRP)检测的临床价值。方法:选取云浮市人民医院2016年1月至2018年1月收治的急性脑梗死患者90例作为观察组,同期选取在本院行健康体检的健康人60例为对照组,两组均行血清Hcy及hs–CRP检测,对两组检查结果进行比较。结果:观察组患者Hcy及hs–CRP水平均明显高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);且观察组中不同程度梗死患者的Hcy及hs–CRP水平比较,差异具有统计学意义(P<0.05);不同梗死灶面积患者Hcy及hs–CRP水平比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:血清Hcy及hs–CRP检测可为急性脑梗死患者的病情判定提供实验室依据。

血清iPTH联合钙磷测定在慢性肾功能衰竭中的应用价值

目的:探讨分析血清全段甲状旁腺激素(iPTH)联合钙磷测定在慢性肾功能衰竭(CRF)患者中的应用效果。方法:选取云浮市人民医院2016年6月至2017年12月接受治疗的96例CRF患者,根据患者病程将54例患者分入CRF早期组,将42例患者分入终末期肾病组,同时再选择42例健康人员分入对照组,检测三组研究对象的血钙、血磷,以及血清iPTH水平的状况。结果:CRF早期组患者的血钙、血磷与对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05),但CRF早期组血清iPTH与对照组比较,差异具有统计学意义(P<0.05);终末期肾病组患者血钙比CRF早期组和对照组低,而iPTH水平要明显高于CRF早期组与对照组,组间比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:采用血清iPTH测定可以反映CRF患者的肾功能进展过程;联合钙磷测定,则对CRF患者的早期治疗具有显著的应用价值。