TLR2对胶质母细胞瘤的预后价值和体外作用

目的探究TCGA数据库中TLR2基因在胶质母细胞瘤(GBM)中的预后价值,并明确该基因对胶质母细胞瘤细胞LN229的体外作用。方法从TCGA数据库中获取169例胶质母细胞瘤患者的临床信息和肿瘤样本的转录组数据,通过Kaplan-Meier生存曲线分析评估TLR2基因在GBM患者中的预后作用。构建TLR2敲减的人胶质母细胞瘤LN229细胞系,通过RT-qPCR和Western Blot验证。通过CCK8、克隆形成、细胞划痕、Transwell小室法,检测敲减TLR2对LN229细胞的增殖、克隆形成、迁移、侵袭能力的影响。结果与正常样本相比,TLR2在GBM患者样本中表达增高。生存分析结果显示,TLR2高表达组患者总生存期显著低于低表达组患者(总生存期中位值333 d vs.402 d,P<0.05)。RT-qPCR和Western Blot结果显示,TLR2敲减的人胶质母细胞瘤LN229细胞系成功构建。与转染si-control的LN229胶质瘤细胞相比,转染si-TLR2的LN229胶质瘤细胞增殖能力明显降低(P<0.05)。与转染si-control的LN229胶质瘤细胞相比,转染si-TLR2的LN229胶质瘤细胞克隆形成数明显降低(P<0.05)。转染si-TLR2的LN229细胞迁移能力明显低于转染si-control的LN229胶质瘤细胞(P<0.05)。转染si-TLR2的LN229细胞侵袭能力明显低于转染si-control的LN229胶质瘤细胞(P<0.05)。结论本研究通过数据挖掘发现TLR2表达与胶质母细胞瘤患者的预后显著相关,通过实验验证敲减TLR2有效抑制LN229细胞的增殖、迁移、侵袭和克隆形成能力,上述发现将为胶质母细胞瘤预后判断和靶向治疗提供新的潜在靶点。

虚实结合的教学模式在生物化学实验教学中的应用

目的:探讨虚实结合的教学模式在生物化学实验教学中的应用效果。方法:选取精神医学本科专业2018级学生156人为对照组,2019级学生149人为试验组,对照组采用传统教学,试验组采用虚实结合的教学模式。结果:试验组的实验课成绩显著高于对照组,试验组90%以上学生自我评价自主学习、综合设计、动手操作、分析问题、批判性思维五方面能力显著提高。结论:虚实结合的实验教学模式既弥补了传统生物化学实验教学的局限性,又有效提高了学生学习质量。

基于ESTIMATE算法探究TCGA数据库免疫相关基因在乳腺癌中的预后价值

目的根据ESTIMATE算法探究TCGA数据库中免疫相关基因在乳腺癌中的预后价值。方法从TCGA数据库获取606例乳腺癌患者的临床信息和肿瘤样本的转录组数据,采用edgeR方法对转录组数据进行差异表达分析,通过ESTIMATE算法筛选出基于免疫分数或间质分数高低分组的差异表达基因;使用R软件绘制差异表达基因的聚类分析热图;使用韦恩图对基于免疫分数和间质分数得到的差异表达基因进行交集分析;运用STRING数据库,搜索并预测表达显著差异基因编码蛋白质之间的相互作用;通过单因素Cox回归分析评估差异表达基因的预后作用;运用DAVID数据库对差异表达基因进行GO富集分析以及KEGG通路富集分析。结果生存分析结果显示,高免疫分数组患者的总生存期中位值943天,而低分组患者总生存期中位值860天,显著高分组患者总生存期显著高于低分组患者(P<0.05);而间质分数与乳腺癌患者总生存期之间无差异(P>0.05)。进一步对免疫分数高分组和低分组患者表达上调的951个差异表达基因进行生存分析,发现160个基因与乳腺癌患者的总生存期显著相关;对上述160个基因进行蛋白质互作分析,富集出与乳腺癌患者总生存率呈正相关的CTLA4、CD8A、CD19、CD27、CD2、IL2、GZMB、IL2RB、CD3E、CD40LG等基因。对上述160个基因进行GO富集和KEGG通路分析,结果显示免疫功能相关信号通路T细胞受体信号通路、造血细胞系、T细胞活化等通路显著富集。结论本研究发现160个具有预后价值的免疫分数相关基因,免疫分数与乳腺癌患者的总生存期、预后改善相关,将为乳腺癌预后判断和靶向治疗提供新的潜在靶点。

新型多金属氧酸盐药物{BiW_(8)O_(30)}对肝癌SK-HEP-1细胞的抑制作用

目的:研究新型多金属氧酸盐药物{BiW_(8)O_(30)}对体外培养的肝癌细胞的作用及其机制。方法:体外培养人肝癌细胞SKHEP-1,实验组分别给予50、100、200、400μmol/L的{BiW_(8)O_(30)}药液,对照组给予正常培养液,培养24和48 h后检测相应指标。采用细胞增殖实验检测细胞存活率并计算{BiW_(8)O_(30)}对SK-HEP-1细胞的半数抑制浓度(IC_(50));细胞集落形成实验检测集落形成数;划痕实验检测划痕愈合率;Transwell实验检测侵袭细胞数变化;荧光染色分析药物对细胞凋亡的影响。结果:与对照组比较,50、100、200、400μmol/L的{BiW_(8)O_(30)}处理24 h后,SK-HEP-1细胞存活率分别降低了29.98%、51.29%、65.81%、83.59%(P<0.01),48 h后分别降低了31.57%、66.23%、81.88%、83.97%(P<0.01);IC_(50)分别为24 h时(102.07±1.38)μmol/L,48 h时(74.68±0.91)μmol/L;50、100、200μmol/L的{BiW_(8)O_(30)}处理2周后,SK-HEP-1细胞的集落形成数分别降低了28.57%、63.27%、90.82%(P<0.01);50、100、200μmol/L的{BiW_(8)O_(30)}处理24 h后,SK-HEP-1细胞的划痕愈合率分别降低了8.47%、70.59%、80.83%(P<0.01),48 h后分别降低了19.56%、65.98%、75.49%(P<0.01);SK-HEP-1的侵袭细胞数在24 h后分别降低了27.74%、45.51%、68.77%(P<0.01),48 h后分别降低了47.03%、72.20%、84.07%(P<0.01)。荧光染色后观察发现{BiW_(8)O_(30)}处理后的肝癌细胞皱缩,细胞核固缩、碎裂,出现凋亡小体。结论:新型多金属氧酸盐药物{BiW_(8)O_(30)}通过抑制肝癌SK-HEP-1细胞的增殖、集落形成、迁移和侵袭能力以及诱导细胞凋亡发挥体外抗肿瘤作用。