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基于cytb和rag2基因探讨叶须鱼属分子系统进化关系
1
作者
陈鲆
曾如奎
+12 位作者
杨德英
哈西
罗文杰
徐丹
刘飞
秦云鑫
熊金鑫
丁文祥
黄俊杰
刘日
唐子婷
何智
严太明
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期140-148,共9页
【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化...
【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化系数和基因流等,分析种间进化关系和种内遗传多样性。【结果】叶须鱼属每个种的cytb序列单独聚为一支,表明cytb基因序列能将叶须鱼属5个种区分开;种间高度遗传分化(F_(st)>0.25),物种之间基因流较弱(Nm<1);修长叶须鱼遗传多样性水平最高,锥吻叶须鱼遗传多样性水平最低。基于rag2基因序列的分子系统发育进化树显示,修长叶须鱼和裸腹叶须鱼均单独聚为一支,为独立的种。【结论】cytb和rag2可作为叶须鱼属种间鉴定的分子标记基因,这为叶须鱼属物种的鉴定和系统分类奠定了基础,也为叶须鱼属鱼类保护措施的制定提供了遗传学依据。
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关键词
叶须鱼属
CYTB基因
rag2基因
系统发育关系
遗传多样性
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题名
基于cytb和rag2基因探讨叶须鱼属分子系统进化关系
1
作者
陈鲆
曾如奎
杨德英
哈西
罗文杰
徐丹
刘飞
秦云鑫
熊金鑫
丁文祥
黄俊杰
刘日
唐子婷
何智
严太明
机构
四川农业大学动物科技学院
长江上游鱼类资源与环境四川省野外科学观测研究站
雅砻江流域水电开发有限公司
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期140-148,共9页
基金
雅砻江流域水电开发有限公司资助(YLGZ-LHDA-ZD2022257)
国家自然科学基金(31972777)。
文摘
【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化系数和基因流等,分析种间进化关系和种内遗传多样性。【结果】叶须鱼属每个种的cytb序列单独聚为一支,表明cytb基因序列能将叶须鱼属5个种区分开;种间高度遗传分化(F_(st)>0.25),物种之间基因流较弱(Nm<1);修长叶须鱼遗传多样性水平最高,锥吻叶须鱼遗传多样性水平最低。基于rag2基因序列的分子系统发育进化树显示,修长叶须鱼和裸腹叶须鱼均单独聚为一支,为独立的种。【结论】cytb和rag2可作为叶须鱼属种间鉴定的分子标记基因,这为叶须鱼属物种的鉴定和系统分类奠定了基础,也为叶须鱼属鱼类保护措施的制定提供了遗传学依据。
关键词
叶须鱼属
CYTB基因
rag2基因
系统发育关系
遗传多样性
Keywords
Ptychobarbus
cytb
rag2
phylogenetic relationship
genetic diversity
分类号
Q341 [生物学—遗传学]
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于cytb和rag2基因探讨叶须鱼属分子系统进化关系
陈鲆
曾如奎
杨德英
哈西
罗文杰
徐丹
刘飞
秦云鑫
熊金鑫
丁文祥
黄俊杰
刘日
唐子婷
何智
严太明
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024
0
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