3643例合肥地区住院儿童13种呼吸道病原体的流行病学分析

目的了解分析合肥地区住院儿童13种呼吸道病原体感染情况。方法选取2020年9月至2023年9月安徽省立医院感染病院呼吸道病毒检测标本3643例,采用多重反转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术扩增了解13种呼吸道感染病毒:甲型流感病毒(InfA)、甲型流感病毒H1N1病毒(H1N1)、甲型流感病毒H3N2(H3N2)、副流感病毒(HPIV)、偏肺病毒(HMPV)、肺炎支原体(MP)、呼吸道合胞病毒(HRSV)、腺病毒(HADV)、鼻病毒(HRV)、博卡病毒(Boca)、衣原体(Ch)、乙型流感病毒(InfB)和冠状病毒(HCOV)的流行病学特点。结果3643例标本中阳性标本共计2222例,阳性率为60.99%,354例为混合病毒感染,多重感染阳性率为9.72%,1868例为单一病毒感染(除InfA未检出外),阳性率为51.27%。1299例男性呼吸道病毒检测阳性(60.96%),923例女性呼吸道病毒检测阳性(61.04%),男女患儿感染的阳性率差异无统计学意义,感染患者主要集中于<1岁组(61.94%)。春季以HRV检出为主(20.50%),夏季以MP和HRV检出为主(24.79%和12.39%),秋季以HRSV和MP检出为主(15.09%和14.30%),HRSV在冬季检出率最高(19.05%)。结论呼吸道病毒感染在合肥住院儿童中非常普遍,近年来MP、HRV和HRSV是非常突出的呼吸道感染的重要病原体,呼吸道病毒感染与患儿年龄和季节分布有关,这些发现可能为合肥住院儿童呼吸道易感染患者的临床诊断治疗及合理用药提供有力的证据。

靶向捕获测序技术和宏基因组二代测序技术检测肺泡灌洗液中结核分枝杆菌的诊断价值

目的:探讨靶向捕获测序技术和宏基因组二代测序技术在疑似肺结核患者肺泡灌洗液标本中,对结核分枝杆菌的诊断价值。方法:回顾性分析2023年6月至2024年3月间,以安徽省立医院感染病院结核病院区收治的117例疑似肺结核患者的肺泡灌洗液作为研究样本,对其进行宏基因组二代测序、靶向捕获测序、GeneXpert MTB/RIF(以下简称“Xpert”)、涂片及培养,分析结核分枝杆菌检出情况,评价宏基因组测序和靶向测序两种方法对肺结核的检测效能。结果:117名疑似肺结核患者中,最终确诊为肺结核的患者为71例(60.68%),非肺结核患者46例(39.32%)。采用宏基因组二代测序、靶向捕获测序、涂片+培养、涂片+培养+Xpert四种检测方法的敏感度分别为77.46%(55/71)、76.06%(54/71)、34.29%(24/70)、54.93%(39/71),特异度分别为100.00%(46/46)、95.65%(44/46)、95.65%(44/46)、95.65%(44/46),阳性预测值分别为100.00%(55/55)、96.43%(54/56)、92.31%(24/26)、95.12%(39/41),阴性预测值分别为74.19%(46/62)、72.13%(44/61)、48.89%(44/90)、57.89%(44/76),符合率分别为86.32%(101/117)、83.76%(98/117)、58.62%(68/116)、70.94%(83/117),约登指数分别为0.77、0.72、0.30、0.51。宏基因组二代测序与靶向捕获测序检出结核分枝杆菌RPM值分别为0.22(0.02,1.95)和28.54(1.65,138.16),差异有统计学意义(Z=6.338,P<0.05)。靶向捕获测序检测利福平、氟喹诺酮、异烟肼耐药基因结果与表型耐药的符合率为100.00%。结论:宏基因组二代测序技术与靶向捕获测序技术在肺结核诊断中较传统检测方法都有着较好的诊断效能;同时靶向捕获测序技术还可以进行耐药位点检测,为临床用药提供参考。