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题名基于转录组测序的紫薇SSR特征分析
被引量:1
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作者
秦波
韦广绥
覃杰
孙开道
秦赐梅
刘昊
黄欣
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机构
广西壮族自治区林业科学研究院
广西壮族自治区国有高峰林场
广西壮族自治区国有黄冕林场
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出处
《湖南农业科学》
2023年第4期1-4,共4页
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基金
广西壮族自治区林业科学研究院基本科研业务费(林科202110号)
广西特色经济林培育与利用重点实验室自主课题(JA-22-01-04
JA-20-01-03)。
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文摘
以紫薇叶片为材料,通过Illumina Hiseq X Ten测序平台进行高通量测序,利用MISA软件分析转录组的SSR相关信息。结果表明:测序共获得31 461条Unigene序列,总长度34 408 463 bp,其中有5 617条Unigene序列含有SSR位点,共发现SSR位点6 761个,出现频率为21.49%,平均分布距离为5.09 kb;主要的优势重复类型为二核苷酸重复和三核苷酸重复,分别占总SSR的44.95%和36.41%;AG/CT和A/T为SSR优势重复基元,出现频率分别为40.23%(2 720个)和16.57%(1120个)。分析表明,紫薇转录组中SSR类型丰富、位点出现频率高、多态性潜力高,在紫薇种质遗传多样性研究、品种鉴定、杂种鉴定等方面具有应用价值。
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关键词
紫薇
转录组
SSR
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Keywords
Lagerstroemia indica
transcriptome
SSR
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分类号
Q754
[生物学—分子生物学]
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题名松材线虫病防控工作中存在的问题及其对策分析
被引量:3
- 2
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作者
秦赐梅
赵存庆
闻玉昌
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机构
广西壮族自治区国有黄冕林场
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出处
《南方农业》
2019年第8期17-18,共2页
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文摘
松材线虫病是目前世界上最具有危险性的森林病害,是我国松类树木中传染性速度最快的毁灭性病虫害。基于此,根据当前松材线虫在我国的分布的情况、传播途径以及蔓延特性等方面,主要分析了松材线虫的相关检测和防控形势,并针对存在的问题提出了相应的对策。
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关键词
松材线虫
检测
防控形势
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分类号
S763.18
[农业科学—森林保护学]
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题名桉树大径材培育技术研究概述
被引量:8
- 3
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作者
赵存庆
秦赐梅
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机构
广西壮族自治区国有黄冕林场
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出处
《南方农业》
2018年第36期61-62,共2页
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文摘
目前,我国的中、大径木材资源十分紧缺,桉树的大径材培育可以很好地缓解我国木材的需求问题,使我国减少对国外木材市场的依赖。基于此,围绕桉树大径材培育技术展开分析。
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关键词
桉树大径材
培育
技术
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分类号
S792.39
[农业科学—林木遗传育种]
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