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伴有早发性高度近视的遗传性眼病基因型与表型研究
被引量:
1
1
作者
芮雪
任英华
+3 位作者
杨尚英
程婉玉
容维宁
盛迅伦
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期662-674,共13页
目的分析伴有早发性高度近视(eoHM)的遗传性眼病基因型及其与表型的关系。方法收集2019年1月至2020年6月于宁夏眼科医院就诊的伴有eoHM家系,详细询问并记录先证者及其家庭成员的病例资料,完善相关眼科检查。抽取患者及家属外周静脉血,...
目的分析伴有早发性高度近视(eoHM)的遗传性眼病基因型及其与表型的关系。方法收集2019年1月至2020年6月于宁夏眼科医院就诊的伴有eoHM家系,详细询问并记录先证者及其家庭成员的病例资料,完善相关眼科检查。抽取患者及家属外周静脉血,提取全基因组DNA,应用目标序列捕获测序技术对先证者进行致病基因突变筛查,对检测到的可疑致病位点进行Sanger验证及家系共分离分析。根据ACMG指南对新发现基因变异进行致病性评估。检索既往已报道的伴有eoHM的遗传性眼病原始文献。分析突变基因及临床表型的关系。结果共收集到伴有eoHM家系20个,其中8个家系检测到与遗传性眼病相关的致病性基因变异,8个先证者中诊断为家族性渗出性玻璃体视网膜病变2个,X-连锁隐性遗传视网膜色素变性、先天性静止性夜盲、Stickler综合征、全色盲、Leber先天性黑矇和回旋状脉络膜视网膜萎缩(GA)各1个。8个家系的先证者首诊年龄4~7岁,均诊断为高度近视,屈光度均≤-6.00 DS。基因检测8个家系的先证者分别携带FZD4基因杂合性变异c.313A>G(p.Met105Val)、TSPAN12基因变异c.14_(1)5insAAGA (p.Asp5fs*)、RPGR基因杂合性移码变异c.2234_(2)237del (p.Arg745fs*)、GPR179基因复合杂合性变异c.481C>T (p.Gln161Ter*)和c.355>T (p.Arg119Cys*)、COL2A1基因移码变异c.1659_(1)660insACGGTGACC CTGGCCGTCCTGG (p.Pro554fs*)、PDE6B复合杂合性变异c.1811C>T(p.Thr604Ile*)和c.967G>A (p.Gly323Ser)、GUCY2D基因复合杂合性变异c.604_(6)19delTCCACGGCACTCAGGG (p.Ser202fs*)和c.995G>C (p.Arg332P)、OAT基因纯合性变异c.772C>T (p.Pro241Leu),其中7个为新发现的突变位点。与既往文献相比,本研究详细分析了8个家系的临床及基因表型,为伴有eoHM的遗传性眼病的诊断提供依据。结论 eoHM与一些遗传性眼病密切相关,可能是儿童最早就诊的原因,也是临床医生发现潜在的遗传性眼部疾病的重要线索。建议对eoHM患儿进一步行眼科结构和功能的临床评估及遗传筛查。
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关键词
遗传性眼病
基因突变
早发性高度近视
RetNet
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职称材料
Hermansky-Pudlak综合征基因型和临床表型分析
2
作者
杨尚英
程婉玉
+1 位作者
张焱
盛迅伦
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期920-926,共7页
目的分析2个Hermansky-Pudlak综合征(HPS)家系的基因型及眼部和全身临床表型。方法采用家系调查研究方法,纳入2020年6月至2021年5月在宁夏回族自治区人民医院就诊的中国汉族和回族HPS家系各1个,收集先证者及其父母的临床资料,父母表型...
目的分析2个Hermansky-Pudlak综合征(HPS)家系的基因型及眼部和全身临床表型。方法采用家系调查研究方法,纳入2020年6月至2021年5月在宁夏回族自治区人民医院就诊的中国汉族和回族HPS家系各1个,收集先证者及其父母的临床资料,父母表型均正常;完善相关眼科及全身检查。采用电子显微镜观察先证者血小板致密颗粒。采集受试者外周静脉血,提取DNA,应用全外显子组测序技术进行致病基因筛查,通过生物信息学分析得到候选致病变异位点。采用Sanger测序进行验证及家系共分离分析,确定致病性变异位点,并探讨HPS相关基因变异与临床特征的关系。结果家系1和家系2均符合常染色体隐性遗传模式。家系1有近亲结婚家族史,先证者面部皮肤、头发、眉毛、睫毛均无明显色素减退表现,双眼水平眼球震颤,外斜视,轻度视力损伤,虹膜萎缩、透光试验阳性,眼底呈橙色、色素缺失、黄斑发育不良,实验室检查凝血酶原时间延长,电子显微镜检查提示血小板致密颗粒大量减少。家系2先证者头发、眉毛呈棕黄色,重度视力损伤,虹膜色素正常,实验室检查凝血酶时间延长,其余特征与家系1先证者相似。全外显子组测序结果显示,在家系1先证者HPS3基因上检测到1个新的纯合变异c.2887G>T(p.E963X)。表型正常的父母各携带1个c.2887G>T(p.E963X)杂合变异。家系2先证者HPS5基因上检测到复合杂合变异:c.2952-2A>C剪接变异和杂合缺失(缺失3144 bp,位于chr11:18302108-18305251,exon22)。表型正常父母分别携带1个杂合变异。3种变异均为新发变异;根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,均为致病变异。结论2个家系分别为HPS-3型和HPS-5型,两型间存在一定的基因型与临床表型对应关系。
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关键词
Hermansky-Pudlak综合征
家系
基因检测
全外显子组测序
基因型
表现型
HPS3基因
HPS5基因
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职称材料
基于豆瓣影评的文本情感分析
被引量:
2
3
作者
李俊华
程婉玉
《汉江师范学院学报》
2021年第6期80-86,共7页
大数据时代产生了大量的文本数据,由于数据源的不同以及产生数据过程的复杂性,造成了大量的数据具有异质结构.将几种最新的机器学习方法与分层技术结合,针对具有异质结构的文本数据的算法.提高文本分类的精准率.实证数据分析表明我们提...
大数据时代产生了大量的文本数据,由于数据源的不同以及产生数据过程的复杂性,造成了大量的数据具有异质结构.将几种最新的机器学习方法与分层技术结合,针对具有异质结构的文本数据的算法.提高文本分类的精准率.实证数据分析表明我们提出的算法在提高分类精确度上有很显著的效果.
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关键词
文本数据
分类
机器学习
分层抽样
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职称材料
题名
伴有早发性高度近视的遗传性眼病基因型与表型研究
被引量:
1
1
作者
芮雪
任英华
杨尚英
程婉玉
容维宁
盛迅伦
机构
甘肃爱尔眼视光医院
宁夏回族自治区人民医院眼科
出处
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期662-674,共13页
基金
国家自然科学基金项目(81760180)
宁夏回族自治区东西科技合作项目(2017BY086)
宁夏回族自治区重点研发项目(2020BEG03047)。
文摘
目的分析伴有早发性高度近视(eoHM)的遗传性眼病基因型及其与表型的关系。方法收集2019年1月至2020年6月于宁夏眼科医院就诊的伴有eoHM家系,详细询问并记录先证者及其家庭成员的病例资料,完善相关眼科检查。抽取患者及家属外周静脉血,提取全基因组DNA,应用目标序列捕获测序技术对先证者进行致病基因突变筛查,对检测到的可疑致病位点进行Sanger验证及家系共分离分析。根据ACMG指南对新发现基因变异进行致病性评估。检索既往已报道的伴有eoHM的遗传性眼病原始文献。分析突变基因及临床表型的关系。结果共收集到伴有eoHM家系20个,其中8个家系检测到与遗传性眼病相关的致病性基因变异,8个先证者中诊断为家族性渗出性玻璃体视网膜病变2个,X-连锁隐性遗传视网膜色素变性、先天性静止性夜盲、Stickler综合征、全色盲、Leber先天性黑矇和回旋状脉络膜视网膜萎缩(GA)各1个。8个家系的先证者首诊年龄4~7岁,均诊断为高度近视,屈光度均≤-6.00 DS。基因检测8个家系的先证者分别携带FZD4基因杂合性变异c.313A>G(p.Met105Val)、TSPAN12基因变异c.14_(1)5insAAGA (p.Asp5fs*)、RPGR基因杂合性移码变异c.2234_(2)237del (p.Arg745fs*)、GPR179基因复合杂合性变异c.481C>T (p.Gln161Ter*)和c.355>T (p.Arg119Cys*)、COL2A1基因移码变异c.1659_(1)660insACGGTGACC CTGGCCGTCCTGG (p.Pro554fs*)、PDE6B复合杂合性变异c.1811C>T(p.Thr604Ile*)和c.967G>A (p.Gly323Ser)、GUCY2D基因复合杂合性变异c.604_(6)19delTCCACGGCACTCAGGG (p.Ser202fs*)和c.995G>C (p.Arg332P)、OAT基因纯合性变异c.772C>T (p.Pro241Leu),其中7个为新发现的突变位点。与既往文献相比,本研究详细分析了8个家系的临床及基因表型,为伴有eoHM的遗传性眼病的诊断提供依据。结论 eoHM与一些遗传性眼病密切相关,可能是儿童最早就诊的原因,也是临床医生发现潜在的遗传性眼部疾病的重要线索。建议对eoHM患儿进一步行眼科结构和功能的临床评估及遗传筛查。
关键词
遗传性眼病
基因突变
早发性高度近视
RetNet
Keywords
Hereditary eye diseases
Mutation
Early onset high myopia
RetNet
分类号
R778.11 [医药卫生—眼科]
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职称材料
题名
Hermansky-Pudlak综合征基因型和临床表型分析
2
作者
杨尚英
程婉玉
张焱
盛迅伦
机构
宁夏回族自治区人民医院
宁夏医科大学科技中心电镜室
甘肃爱尔眼视光医院
出处
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期920-926,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81760180)
宁夏自治区重点研发项目(2021BEG02045)。
文摘
目的分析2个Hermansky-Pudlak综合征(HPS)家系的基因型及眼部和全身临床表型。方法采用家系调查研究方法,纳入2020年6月至2021年5月在宁夏回族自治区人民医院就诊的中国汉族和回族HPS家系各1个,收集先证者及其父母的临床资料,父母表型均正常;完善相关眼科及全身检查。采用电子显微镜观察先证者血小板致密颗粒。采集受试者外周静脉血,提取DNA,应用全外显子组测序技术进行致病基因筛查,通过生物信息学分析得到候选致病变异位点。采用Sanger测序进行验证及家系共分离分析,确定致病性变异位点,并探讨HPS相关基因变异与临床特征的关系。结果家系1和家系2均符合常染色体隐性遗传模式。家系1有近亲结婚家族史,先证者面部皮肤、头发、眉毛、睫毛均无明显色素减退表现,双眼水平眼球震颤,外斜视,轻度视力损伤,虹膜萎缩、透光试验阳性,眼底呈橙色、色素缺失、黄斑发育不良,实验室检查凝血酶原时间延长,电子显微镜检查提示血小板致密颗粒大量减少。家系2先证者头发、眉毛呈棕黄色,重度视力损伤,虹膜色素正常,实验室检查凝血酶时间延长,其余特征与家系1先证者相似。全外显子组测序结果显示,在家系1先证者HPS3基因上检测到1个新的纯合变异c.2887G>T(p.E963X)。表型正常的父母各携带1个c.2887G>T(p.E963X)杂合变异。家系2先证者HPS5基因上检测到复合杂合变异:c.2952-2A>C剪接变异和杂合缺失(缺失3144 bp,位于chr11:18302108-18305251,exon22)。表型正常父母分别携带1个杂合变异。3种变异均为新发变异;根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,均为致病变异。结论2个家系分别为HPS-3型和HPS-5型,两型间存在一定的基因型与临床表型对应关系。
关键词
Hermansky-Pudlak综合征
家系
基因检测
全外显子组测序
基因型
表现型
HPS3基因
HPS5基因
Keywords
Hermansky-Pudlak syndrome
Pedigree
Genetic testing
Whole exome sequencing
Genotype
Phenotype
HPS3 gene
HPS5 gene
分类号
R596.1 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
基于豆瓣影评的文本情感分析
被引量:
2
3
作者
李俊华
程婉玉
机构
汉江师范学院数学与计算机科学学院
武汉大学数学与统计学院
出处
《汉江师范学院学报》
2021年第6期80-86,共7页
基金
湖北省教育厅科学研究基金项目“基于KwMO扩展的统计分布研究”(项目编号:B2021286)
湖北省教育厅科学技术研究计划青年人才项目“超网络的建模及重构研究”(项目编号:Q20203103)
文摘
大数据时代产生了大量的文本数据,由于数据源的不同以及产生数据过程的复杂性,造成了大量的数据具有异质结构.将几种最新的机器学习方法与分层技术结合,针对具有异质结构的文本数据的算法.提高文本分类的精准率.实证数据分析表明我们提出的算法在提高分类精确度上有很显著的效果.
关键词
文本数据
分类
机器学习
分层抽样
Keywords
text data
classify
machine learning
stratified sample
分类号
O213 [理学—概率论与数理统计]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
伴有早发性高度近视的遗传性眼病基因型与表型研究
芮雪
任英华
杨尚英
程婉玉
容维宁
盛迅伦
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
Hermansky-Pudlak综合征基因型和临床表型分析
杨尚英
程婉玉
张焱
盛迅伦
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
3
基于豆瓣影评的文本情感分析
李俊华
程婉玉
《汉江师范学院学报》
2021
2
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职称材料
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引证文献
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