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题名桔梗根系响应元宝枫凋落叶的转录组分析
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作者
冯超群
阮坤非
师劭彤
李森
程少颖
刘忠华
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机构
北京林业大学生物科学与技术学院
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出处
《西北植物学报》
CAS
2024年第12期1900-1914,共15页
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基金
国家林业和草原局项目(DNA-2021)
北京市园林绿化局计划项目(2021-STBHXFC-04-11)
榆林市榆阳区林业局项目(2024XHFW049,2024XHFW059)。
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文摘
【目的】探究北京地区元宝枫凋落叶对桔梗药用活性成分积累的影响,通过转录组测序揭示桔梗根部活性成分合成的分子机制。【方法】利用Illumina对桔梗根部进行转录组测序,分析萜类、类黄酮和苯丙烷类次生代谢产物合成通路中的基因表达变化。【结果】共检测到15727个SSR位点。发现753个DEGs注释到GO数据库的三大分类中,314个DEGs注释到KEGG数据库的105个代谢通路中。与对照组相比,分别有17,7,26个DEGs参与萜类、类黄酮和苯丙烷类化合物的生物合成。【结论】萜类和苯丙烷合成途径的DEGs主要上调表达,类黄酮合成途径的DEGs普遍下调表达。推测萜类和苯丙烷类物质合成上升,类黄酮合成下降。获得了桔梗根部的全部转录组信息,并初步预测了桔梗萜类、类黄酮以及苯丙烷类合成可能的调控通路。
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关键词
桔梗
元宝枫
转录组
差异表达基因(DEG)
次生代谢产物
合成调控
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Keywords
Platycodon grandiflorum
Acer truncatum
transcriptome
differentially expressed genes(DEG)
secondary metabolites
synthetic regulation
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分类号
Q946
[生物学—植物学]
S567.239
[农业科学—中草药栽培]
S792.35
[农业科学—林木遗传育种]
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