降糖甲治疗2型糖尿病的机制研究

基于生物信息学、网络药理学和分子对接技术探讨降糖甲颗粒(JTJ)治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制。通过TCMSP、Uniprot数据库、swisstarget和SEA数据库筛选降糖甲颗粒的活性化合物和作用靶点,从GEO数据库获取T2DM患者组胰岛样本和非T2DM患者组胰岛样本数据,利用R语言limma包筛选差异表达基因,二者取交集得到JTJ-T2DM共有靶点。通过Cytoscape3.9.1绘制JTJ-T2DM-靶点网络图,利用STRING数据库、Cytoscape3.9.1的cytoHubb插件制作JTJ-T2DM共有靶点的PPI网络图并获取关键靶点(Hubs)。利用DAVID平台对JTJ-T2DM共有靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,对共有靶点有差异表达并进行ROC分析,最后通过DS BIOVIA软件进行分子对接验证。结果显示,最终获得41个JTJ活性化合物,909个药物作用靶点,2952个T2DM靶点,JTJ-T2DM交集靶点160个,Hubs 12个;GO及KEGG富集分析结果显示,JTJ主要参与细胞凋亡等过程,调控MAPK及AGE-RAGE等信号通路而治疗T2DM;差异表达结果显示,MAPK14、PRKCZ、PTPN11具有显著差异表达且诊断价值高;分子对接结果显示(+)-丁香树脂醇-O-β-D-葡萄糖苷与LCK和PTPN11亲和力最强,蒙花苷与PRKCZ亲和力最强。本研究初步揭示了降糖甲颗粒治疗2型糖尿病的作用机制,为其治疗2型糖尿病提供充分、可靠的理论依据。

葛根素调控铁死亡干预肝细胞癌的机制研究

目的:探讨葛根素调控铁死亡干预肝细胞癌的作用机制。方法:通过网络药理学、生物信息学和分子对接等方法对葛根素-铁死亡-肝细胞癌共同作用靶点进行综合分析。结果:交集靶点为PTGS2、AKR1C3、JUN、PLIN2、ALB;其中有4个关键靶点(AKR1C3、ALB、PTGS2、JUN)能与葛根素结合,差异表达结果表明均有显著差异,进一步通过THPA验证在人类正常组织和癌症组织之间的表达结果具有一致性,临床相关性分析表明四者均有突出临床意义。生存分析曲线表明,10年生存预后分析中AKR1C3具有显著生存意义(P<0.05),ALB、PTGS2、JUN生存意义较差(P>0.05);ROC曲线显示AKR1C3的预测能力有较高准确性(AUC=0.945,CI=0.922~0.968)。免疫浸润分析可知,AKR1C3表达与巨噬细胞等细胞浸润呈正相关,而与CD4+T细胞负相关。结论:葛根素可能通过靶向作用于AKR1C3基因调控铁死亡干预肝细胞癌。

熊胆逐瘀片治疗DR的物质基础及作用机制

目的:旨在探讨熊胆逐瘀片(XDZYP)治疗糖尿病视网膜病变(Diabetic Retinopathy, DR)的物质基础及作用机制。方法:通过Symmap、Swiss Target Prediction检索XDZYP的成分及靶点;通过CTD及DisGeNET检索DR靶点;两者靶点取交集,构建中药-成分-靶点网络;蛋白-蛋白互作聚焦20个枢纽靶点;将枢纽靶点进行GO、KEGG富集分析以及转录因子预测及分子对接。结果:获得XDZYP活性成分105个,靶点112个,其中20个枢纽靶点主要参与血管内皮生长因子产生,调控TNF、AGE-RAGE、细胞凋亡通路,还可被CSRNP1、NFKB2等转录因子调控,其中靶向结合化合物的有:IL4-水杨酸,STAT3/IL6-杨梅酮,CHUK/PARA-槲皮素,TGFB1-丹参素,MYC-丹参酮IIA,TNF-胆酸等。结论:XDZYP主要通过槲皮素、杨梅酮、水杨酸、丹参素等靶向IL4、IL6、PPARA、CHUK等参与TNF、AGE-RAGE、细胞凋亡通路而治疗DR。