肝细胞癌相关固醇-O酰基转移酶1基因的生物信息学分析

目的使用生物信息学工具对肝细胞癌相关固醇-O酰基转移酶1(sterol O-acyltransferase 1,SOAT1)的结构、功能进行预测分析,以了解其作为S-Ⅲ亚型标记物以及治疗靶标的相关作用机制。方法使用NCBI、STRING、Protscale、SignalP、TMHMM、PSORT、SOPMA、SWISS-MODEL、NetNGlyc、NetOGlyc、Netphos、ProtParam等数据库或软件,对SOAT1的结构、功能、蛋白相互作用等进行预测分析。结果SOAT1编码的蛋白质为疏水性蛋白,稳定性较好,属于非经典途径蛋白,具有8个跨膜区域,主要分布于细胞膜。SOAT1在多种组织均有表达,但绝大多数位于肾上腺。具有多个磷酸化位点,主要参与胆固醇的合成以及分解代谢过程。结论通过生物信息学分析SOAT1的结构以及功能,发现SOAT1脂质的合成以及分解代谢途径发挥重要作用,脂质的表达与癌症的发展密切相关。因此可通过调节SOAT1基因的表达从而实现肝细胞癌的治疗。