山东省一起皮肤炭疽疫情来源炭疽芽胞杆菌的分子分型及基因溯源分析

目的对一起皮肤炭疽暴发疫情来源炭疽芽胞杆菌开展分子分型及基因溯源分析,为炭疽的有效防控提供重要的基础性数据。方法本研究对2021年山东省曹县一起炭疽疫情样本中分离的8株炭疽芽胞杆菌进行药物敏感性实验、MLVA-15和canSNP分型、全基因组测序(WGS)和SNPs分析。结果药敏结果显示,所有分离株耐药性一致。8株菌MLVA-15分型为同一基因型,该基因型在国内首次发现,命名为MLVA15-CHN77型;canSNP分型均为A.Br.001/002型。WGS结果分析显示,8株菌具有相同的耐药基因和毒力基因谱。SNPs分析显示,8株暴发菌株聚成一簇。结论基于全基因组序列的分型和溯源策略,是炭疽芽胞杆菌传统分型方法的必要补充。

2021年山东省菏泽市曹县一起皮肤炭疽疫情调查报告

目的分析山东省菏泽市曹县一起皮肤炭疽疫情的暴发原因与流行病学特征,为炭疽防控提供科学依据。方法采用现场流行病学调查方法,使用《炭疽流行病学个案调查表》,根据全民健保系统报告的炭疽疑似病例流行病学接触史及密切接触者进行个案调查(n=83)。采集病例皮肤焦痂涂抹物、病牛组织、屠宰场地土壤样本及屠宰器具涂抹物,分别进行Real-time PCR检测、病原菌分离培养。炭疽判定标准参照《炭疽诊断》(WS 283-2020)进行。结果本次疫情共发现皮肤炭疽病例13例,其中临床诊断病例12例,确诊1例(Real-time PCR检测阳性且分离出1株炭疽芽孢杆菌)。经流行病学调查确定,本次疫情传染源为病牛,传播途径为屠宰病牛、接触被污染的用具及相关牛产品,患者主要是从事牛屠宰或牛产品收售相关职业。实验室共收集样本84份,其中皮肤焦痂涂抹物13份、环境样本64份、牛肉样本7份。PCR检测结果阳性36份,阳性率为42.86%(36/84)。其中皮肤焦痂涂抹物标本阳性率为100.00%(13/13),环境样本阳性率为29.69%(19/64),牛肉样本阳性率为4/7。共分离到8株炭疽芽孢杆菌,其中环境标本6株、疑似病例1株、牛肉1株,总检出率为9.52%(8/84)。排查密接者83人,对涉疫的13个家庭用含氯消毒剂(5000 mg/L)进行喷洒消毒(200 ml/m^(2)),累计消毒涉疫家庭40户次,消毒面积约10765 m^(2),焚烧处理疑似污染衣物45件,对152件厨具进行了浸泡处理。结论屠宰染疫牛、接触被污染的用具及相关产品为本次皮肤炭疽暴发的主要原因。加强市场监管,深化畜间防疫,开展炭疽防治知识的宣传教育,增强从业人员的防病意识是预防炭疽发生的关键。

中国首起由SARS-CoV-2 VOC/Gamma引起的本土聚集性疫情溯源调查分析

目的对山东省威海荣成市报告一起新型冠状病毒肺炎疫情进行溯源调查。方法对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测阳性者及其密切接触者进行调查,对9株病毒毒株进行全基因组测序及遗传进化分析;从国内外两个源头,人、物和环境三个方面开展溯源调查。结果本次疫情累计报告15例无症状感染者,包括某水产品加工公司车间13例,感染率为21.67%(13/60);感染者的同村邻居2例(夫妻关系)。初次检出的6例感染者为从事清除鱿鱼内脏首道工序工人,首次咽拭子核酸检测Ct值为15~29,病毒载量高,疑为同源一次性暴露所致。9株病毒毒株全基因组序列高度同源,属于VOC/Gamma(P.1.15进化分支),与我国既往本土和输入病例均不同源;与智利上传的2021年5月5—26日采样的6条病毒序列高度同源。溯源结果显示,该公司近14日内使用过2021年5—6月在智利、阿根廷附近海域捕获的鱿鱼原材料;库存原材料、产品及其外包装多处采样核酸检测呈阳性。结论本次疫情是我国首起由SARS-CoV-2 VOC/Gamma引起的本土聚集性疫情,可能为南美洲地区2021年5—6月期间流行的VOC/Gamma通过冷冻鱿鱼传入我国。