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“夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组特征与系统进化的关系
1
作者
王宁
彭晗琪
+2 位作者
高常哲
程羽珩
吕大兵
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CSCD
北大核心
2023年第6期699-707,717,共10页
目的测定具有“夜逸蚴”特征的日本血吸虫线粒体全基因组序列,并探讨其与大陆其他日本血吸虫地域株的系统进化关系,为后续进行种群遗传结构与遗传多样性研究提供新的数据。方法2020年于安徽省石台县现场采集钉螺,实验室内分离感染性钉螺...
目的测定具有“夜逸蚴”特征的日本血吸虫线粒体全基因组序列,并探讨其与大陆其他日本血吸虫地域株的系统进化关系,为后续进行种群遗传结构与遗传多样性研究提供新的数据。方法2020年于安徽省石台县现场采集钉螺,实验室内分离感染性钉螺,逸出的尾蚴以腹部贴片法感染ICR小鼠,灌注法获取肝门静脉和肠系膜静脉处虫体,随机抽样进行测序。使用血液/组织基因组DNA提取试剂盒提取血吸虫DNA,采用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行双末端测序,采用GetOrganelle软件组装线粒体基因组,使用MEGA 11软件分析线粒体基因组结构特征与碱基组成。选择已发表的中国地区17个日本血吸虫线粒体基因组序列,采用最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建系统进化树。结果安徽省石台县分离的“夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组全长14085 bp(GenBank登录号:ON637109),编码36个基因,由12个蛋白编码基因(PCG),22个tRNA基因和2个rRNA基因组成。线粒体基因组A+T含量为71.35%,存在基因重叠区2处、基因间隔区29处;在22个tRNA基因中,除trnaC和trnaS1基因缺失二氢尿嘧啶(DHU)臂外,其余均能形成典型三叶草二级结构。蛋白编码基因中,cytb、nad4、nad2和nad6基因的终止密码子为TAA,不同于以TAG为终止密码子的中国其他地域株。基于NJ法和ML法构建的系统进化树具有相似的拓扑结构,石台县“夜逸蚴”日本血吸虫分离株单独成一支;中国台湾血吸虫株与中国大陆其他地域株分离,形成一支。结论安徽省石台地区的日本血吸虫分离株其终止密码子与中国其他地域株存在差异,线粒体基因组的系统进化地位分析,与其他地域株亲缘关系较远,遗传差异较大。
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关键词
线粒体基因组
序列分析
系统进化关系
日本血吸虫
夜逸蚴特征
原文传递
一豆类加工厂库藏进口豆类孳生螨类情况调查
被引量:
1
2
作者
蒋峰
程羽珩
+2 位作者
赵亚男
柴强
李朝品
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2021年第1期76-78,82,共4页
目的调查某豆类加工厂库藏进口豆类孳生螨的群落结构及生物多样性。方法采集一豆类加工厂库藏进口黄豆和豌豆的碎屑与地面灰尘混合物各10份,每份10 g,进行螨的分离、鉴定和计数,并计算其生态参数。结果黄豆和豌豆样品螨检出率分别为70%...
目的调查某豆类加工厂库藏进口豆类孳生螨的群落结构及生物多样性。方法采集一豆类加工厂库藏进口黄豆和豌豆的碎屑与地面灰尘混合物各10份,每份10 g,进行螨的分离、鉴定和计数,并计算其生态参数。结果黄豆和豌豆样品螨检出率分别为70%和80%。共检获螨12种719只,隶属7科7属,平均孳生密度为3.6只/g。库藏进口黄豆和豌豆孳生螨类的群落结构及多样性较一致,但黄豆中物种丰富度、物种多样性和物种均匀度均略高于豌豆,豌豆中物种优势度指数高于黄豆。结论库藏进口黄豆和豌豆孳生螨类种数较多,孳生密度高,需要加强对库藏豆类螨污染的防制。
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关键词
螨
库藏豆类
群落结构
多样性
原文传递
2004-2019年苏州市吴中区日本血吸虫病疫情监测分析
被引量:
2
3
作者
周支军
顾漫漫
+3 位作者
华雪涛
程羽珩
王宁
吕大兵
《热带医学杂志》
CAS
2023年第7期1024-1029,共6页
目的了解苏州市吴中区血吸虫病传播阻断后疫情现状和变化趋势,为制定和完善血吸虫病监测方案提供依据。方法按照全国血吸虫病疫情监测方案对吴中区血吸虫病疫情进行监测,采取单纯随机抽样方法对吴中区各乡镇常住居民和流动人群,开展血...
目的了解苏州市吴中区血吸虫病传播阻断后疫情现状和变化趋势,为制定和完善血吸虫病监测方案提供依据。方法按照全国血吸虫病疫情监测方案对吴中区血吸虫病疫情进行监测,采取单纯随机抽样方法对吴中区各乡镇常住居民和流动人群,开展血清学间接血凝试验法(IHA)检测,血检阳性者进一步粪检(尼龙绢袋集卵孵化法或改良加藤氏法),同时对重点人群进行粪检。对2004-2019年查治病、查灭螺等数据进行分析,在此基础上进行疫情预测。结果2004-2019年共检测185815人次,未发现血吸虫病例。其中,2011-2019年血清学共检查本地人群52087人次,血检阳性率为0.301%(157/52087);流动人群20479人次,血检阳性率为0.542%(111/20479);2004-2019年间人群血检阳性率呈上升趋势,差异有统计学意义(Z=3.869,P<0.001);粪检3519人次,均阴性。共查螺3700.870 hm^(2),有螺面积25.790 hm^(2),总体有上升趋势,以山区环境为主,主要分布在光福、东山、金庭等乡镇。共查螺55371框,有螺框出现率为4.089%(2264/55371),各年间呈下降趋势,且差异有统计学意义(Z=-2.836,P=0.005)。查获活螺7900只,活螺密度0.143只/框,有下降趋势;解剖钉螺8574只,未发现阳性钉螺。药物灭螺90.906 hm^(2),无显著变化趋势。2020-2024年血清阳性率、有螺框出现率和活螺密度的5年预测值分别为0.616%、0.884%和0.082只/框,各年有螺面积预测值分别为15.028、6.296、13.004、7.852和11.809 hm^(2)。结论当地无血吸虫病疫情,且无阳性钉螺,但有螺面积波动较大,建议加强钉螺监测。
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关键词
血吸虫病
螺情监测
间接血凝试验法
原文传递
2004—2021年苏州市高新区血吸虫病疫情监测分析
被引量:
3
4
作者
归国平
程羽珩
+3 位作者
郭锋
胡燕红
吕大兵
施雯慧
《上海预防医学》
CAS
2023年第9期857-862,共6页
【目的】分析江苏省苏州市高新区2004—2021年血吸虫病疫情监测数据,为完善血吸虫病消除策略提供依据。【方法】根据《苏州市血吸虫病、寄生虫病和地方病防治工作意见》和《苏州市血吸虫病、寄生虫病和地方病预防与控制工作技术方案》对...
【目的】分析江苏省苏州市高新区2004—2021年血吸虫病疫情监测数据,为完善血吸虫病消除策略提供依据。【方法】根据《苏州市血吸虫病、寄生虫病和地方病防治工作意见》和《苏州市血吸虫病、寄生虫病和地方病预防与控制工作技术方案》对2004—2021年血吸虫病人群病情、螺情等进行监测,用Mann-Kendall方法和Joinpoint回归方法分析疫情指标(血清学阳性率、有螺框出现率等)变化趋势,用时间序列分析(指数平滑模型)进行螺情预测。【结果】2004—2021年血吸虫病血清学检查共73680人次,阳性率为0.084%,各年阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=70.73,P<0.05),但阳性率无变化趋势;粪检3053人次,未检出阳性。共查出有螺面积70.11 hm^(2),有螺面积呈下降趋势(Z=-1.97,P<0.05);共查螺30093框,有螺框出现率为19.038%,各年有螺框出现率差异有统计学意义(χ^(2)=7203.09,P<0.05)且呈下降趋势(Z=-2.05,P<0.05);查获活螺26296只,活螺密度为0.874只·框-1,活螺密度呈下降趋势(Z=-2.35,P<0.05);共解剖钉螺12391只,未发现阳性钉螺。药物灭螺面积264.60 hm^(2),无变化趋势;环境改造灭螺面积27.77 hm^(2),呈下降趋势(Z=-2.44,P<0.05)。据预测,2022—2026年有螺框出现率和活螺密度较平稳,但有螺面积波动较大且有增加趋势。【结论】该地无血吸虫病本地病例,未检出阳性钉螺,血吸虫病防治成果得到有效巩固,但有螺面积波动较大且有增加趋势,应做好当地钉螺长期监测工作。
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关键词
血吸虫病
钉螺
Mann-Kendall分析
Joinpoint回归模型
疫情预测
苏州市高新区
原文传递
题名
“夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组特征与系统进化的关系
1
作者
王宁
彭晗琪
高常哲
程羽珩
吕大兵
机构
苏州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
出处
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CSCD
北大核心
2023年第6期699-707,717,共10页
基金
国家自然科学基金(81971957)。
文摘
目的测定具有“夜逸蚴”特征的日本血吸虫线粒体全基因组序列,并探讨其与大陆其他日本血吸虫地域株的系统进化关系,为后续进行种群遗传结构与遗传多样性研究提供新的数据。方法2020年于安徽省石台县现场采集钉螺,实验室内分离感染性钉螺,逸出的尾蚴以腹部贴片法感染ICR小鼠,灌注法获取肝门静脉和肠系膜静脉处虫体,随机抽样进行测序。使用血液/组织基因组DNA提取试剂盒提取血吸虫DNA,采用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行双末端测序,采用GetOrganelle软件组装线粒体基因组,使用MEGA 11软件分析线粒体基因组结构特征与碱基组成。选择已发表的中国地区17个日本血吸虫线粒体基因组序列,采用最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建系统进化树。结果安徽省石台县分离的“夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组全长14085 bp(GenBank登录号:ON637109),编码36个基因,由12个蛋白编码基因(PCG),22个tRNA基因和2个rRNA基因组成。线粒体基因组A+T含量为71.35%,存在基因重叠区2处、基因间隔区29处;在22个tRNA基因中,除trnaC和trnaS1基因缺失二氢尿嘧啶(DHU)臂外,其余均能形成典型三叶草二级结构。蛋白编码基因中,cytb、nad4、nad2和nad6基因的终止密码子为TAA,不同于以TAG为终止密码子的中国其他地域株。基于NJ法和ML法构建的系统进化树具有相似的拓扑结构,石台县“夜逸蚴”日本血吸虫分离株单独成一支;中国台湾血吸虫株与中国大陆其他地域株分离,形成一支。结论安徽省石台地区的日本血吸虫分离株其终止密码子与中国其他地域株存在差异,线粒体基因组的系统进化地位分析,与其他地域株亲缘关系较远,遗传差异较大。
关键词
线粒体基因组
序列分析
系统进化关系
日本血吸虫
夜逸蚴特征
Keywords
Mitochondrial genome
Sequence analysis
Phylogenetic relationship
Schistosoma japonicum
Nocturnal cercarial emergence
分类号
R383.24 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
一豆类加工厂库藏进口豆类孳生螨类情况调查
被引量:
1
2
作者
蒋峰
程羽珩
赵亚男
柴强
李朝品
机构
皖南医学院医学寄生虫学教研室
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2021年第1期76-78,82,共4页
基金
国家自然科学基金项目(No.81270091)。
文摘
目的调查某豆类加工厂库藏进口豆类孳生螨的群落结构及生物多样性。方法采集一豆类加工厂库藏进口黄豆和豌豆的碎屑与地面灰尘混合物各10份,每份10 g,进行螨的分离、鉴定和计数,并计算其生态参数。结果黄豆和豌豆样品螨检出率分别为70%和80%。共检获螨12种719只,隶属7科7属,平均孳生密度为3.6只/g。库藏进口黄豆和豌豆孳生螨类的群落结构及多样性较一致,但黄豆中物种丰富度、物种多样性和物种均匀度均略高于豌豆,豌豆中物种优势度指数高于黄豆。结论库藏进口黄豆和豌豆孳生螨类种数较多,孳生密度高,需要加强对库藏豆类螨污染的防制。
关键词
螨
库藏豆类
群落结构
多样性
Keywords
Mites
stored beans
community structure
diversity
分类号
R384.4 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
2004-2019年苏州市吴中区日本血吸虫病疫情监测分析
被引量:
2
3
作者
周支军
顾漫漫
华雪涛
程羽珩
王宁
吕大兵
机构
苏州市吴中区疾病预防控制中心
苏州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
出处
《热带医学杂志》
CAS
2023年第7期1024-1029,共6页
基金
国家自然科学基金(81971957)
苏州市科技发展项目(民生科技)(SS2019044)
文摘
目的了解苏州市吴中区血吸虫病传播阻断后疫情现状和变化趋势,为制定和完善血吸虫病监测方案提供依据。方法按照全国血吸虫病疫情监测方案对吴中区血吸虫病疫情进行监测,采取单纯随机抽样方法对吴中区各乡镇常住居民和流动人群,开展血清学间接血凝试验法(IHA)检测,血检阳性者进一步粪检(尼龙绢袋集卵孵化法或改良加藤氏法),同时对重点人群进行粪检。对2004-2019年查治病、查灭螺等数据进行分析,在此基础上进行疫情预测。结果2004-2019年共检测185815人次,未发现血吸虫病例。其中,2011-2019年血清学共检查本地人群52087人次,血检阳性率为0.301%(157/52087);流动人群20479人次,血检阳性率为0.542%(111/20479);2004-2019年间人群血检阳性率呈上升趋势,差异有统计学意义(Z=3.869,P<0.001);粪检3519人次,均阴性。共查螺3700.870 hm^(2),有螺面积25.790 hm^(2),总体有上升趋势,以山区环境为主,主要分布在光福、东山、金庭等乡镇。共查螺55371框,有螺框出现率为4.089%(2264/55371),各年间呈下降趋势,且差异有统计学意义(Z=-2.836,P=0.005)。查获活螺7900只,活螺密度0.143只/框,有下降趋势;解剖钉螺8574只,未发现阳性钉螺。药物灭螺90.906 hm^(2),无显著变化趋势。2020-2024年血清阳性率、有螺框出现率和活螺密度的5年预测值分别为0.616%、0.884%和0.082只/框,各年有螺面积预测值分别为15.028、6.296、13.004、7.852和11.809 hm^(2)。结论当地无血吸虫病疫情,且无阳性钉螺,但有螺面积波动较大,建议加强钉螺监测。
关键词
血吸虫病
螺情监测
间接血凝试验法
Keywords
Schistosomiasis
Snail monitoring
Indirect haemagglutination test
分类号
R532.21 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
2004—2021年苏州市高新区血吸虫病疫情监测分析
被引量:
3
4
作者
归国平
程羽珩
郭锋
胡燕红
吕大兵
施雯慧
机构
苏州市高新区(虎丘区)疾病预防控制中心
苏州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
国家卫生健康委计划生育药具不良反应监测中心/江苏省卫生健康发展研究中心
出处
《上海预防医学》
CAS
2023年第9期857-862,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81971957)
国家卫生健康委计划生育药具不良反应监测中心/江苏省卫生健康发展研究中心开放课题(JSHD2021037)。
文摘
【目的】分析江苏省苏州市高新区2004—2021年血吸虫病疫情监测数据,为完善血吸虫病消除策略提供依据。【方法】根据《苏州市血吸虫病、寄生虫病和地方病防治工作意见》和《苏州市血吸虫病、寄生虫病和地方病预防与控制工作技术方案》对2004—2021年血吸虫病人群病情、螺情等进行监测,用Mann-Kendall方法和Joinpoint回归方法分析疫情指标(血清学阳性率、有螺框出现率等)变化趋势,用时间序列分析(指数平滑模型)进行螺情预测。【结果】2004—2021年血吸虫病血清学检查共73680人次,阳性率为0.084%,各年阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=70.73,P<0.05),但阳性率无变化趋势;粪检3053人次,未检出阳性。共查出有螺面积70.11 hm^(2),有螺面积呈下降趋势(Z=-1.97,P<0.05);共查螺30093框,有螺框出现率为19.038%,各年有螺框出现率差异有统计学意义(χ^(2)=7203.09,P<0.05)且呈下降趋势(Z=-2.05,P<0.05);查获活螺26296只,活螺密度为0.874只·框-1,活螺密度呈下降趋势(Z=-2.35,P<0.05);共解剖钉螺12391只,未发现阳性钉螺。药物灭螺面积264.60 hm^(2),无变化趋势;环境改造灭螺面积27.77 hm^(2),呈下降趋势(Z=-2.44,P<0.05)。据预测,2022—2026年有螺框出现率和活螺密度较平稳,但有螺面积波动较大且有增加趋势。【结论】该地无血吸虫病本地病例,未检出阳性钉螺,血吸虫病防治成果得到有效巩固,但有螺面积波动较大且有增加趋势,应做好当地钉螺长期监测工作。
关键词
血吸虫病
钉螺
Mann-Kendall分析
Joinpoint回归模型
疫情预测
苏州市高新区
Keywords
schistosomiasis
Oncomelania snail
Mann-Kendall analysis
Joinpoint regression model
endemic prediction
Suzhou New District
分类号
R18 [医药卫生—流行病学]
R532.21 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
“夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组特征与系统进化的关系
王宁
彭晗琪
高常哲
程羽珩
吕大兵
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
2
一豆类加工厂库藏进口豆类孳生螨类情况调查
蒋峰
程羽珩
赵亚男
柴强
李朝品
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2021
1
原文传递
3
2004-2019年苏州市吴中区日本血吸虫病疫情监测分析
周支军
顾漫漫
华雪涛
程羽珩
王宁
吕大兵
《热带医学杂志》
CAS
2023
2
原文传递
4
2004—2021年苏州市高新区血吸虫病疫情监测分析
归国平
程羽珩
郭锋
胡燕红
吕大兵
施雯慧
《上海预防医学》
CAS
2023
3
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