阿尔茨海默病肠道细菌和真菌菌群结构和组成改变研究

目的探讨阿尔茨海默病(AD)患者肠道细菌组和真菌组的变化特征及其与宿主应答的互作关系。方法收集AD患者(n=39)和健康者(n=39)粪便样本和空腹血清样本,提取样本总DNA,采用MiSeq高通量测序分析样本中细菌和真菌的组成,并采用人27细胞因子联合检测试剂盒检测血清细胞因子水平。结果AD患者肠道细菌菌群多样性(Shannon指数)和丰富度(Observed OTUs,Chao 1指数,ACE指数)显著下降(P<0.05),产丁酸菌中的粪杆菌属(Faecalibacterium)和罗氏菌属(Roseburia)相对丰度显著降低(P<0.05),而产乳酸菌中的双歧杆菌属(Bifidobacterium)和乳杆菌属(Lactobacillus)显著增加(P<0.05)。肠道真菌菌群结构差异无统计学意义(P>0.05),但菌群组成中克柔假丝酵母菌(Candida xylopsoci)和埃切假丝酵母菌(Candida etchellsii)相对丰度显著降低(P<0.05),而裂褶菌(Schizophyllum commune)和变色栓菌(Trametes versicolor)显著增加(P<0.05)。AD患者血清中IFN-γ,MIP-1α和MCP-1显著降低,而TNF-α和IP-10显著升高(P<0.05);网络互作分析发现,AD肠道关键功能细菌、真菌和炎症标志物的互作网络更为复杂。结论AD患者肠道细菌组和真菌组发生显著改变,并与外周炎症因子相关,这为探索AD发病新机制和早诊早治提供新的线索。

幽门螺杆菌感染对正常胃部菌群多样性和组成的影响

目的通过高通量测序分析,探讨幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)感染在正常胃部菌群多样性和组成中的差异。方法选择2017年10月-2018年1月在本院就诊的胃镜体检受试者40例,其中H.pylori阳性20例,阴性20例,均无阳性体征,收集胃液样本行胃部菌群MiSeq高通量测序分析。结果H.pylori感染组α-多样性指数Shannon(t=-6.690,P<0.001)和Simpson(t=-3.673,P=0.002)显著改变,显示胃部菌群多样性降低;菌群丰富度指数如PD Whole tree(t=-2.282,P=0.008),Chao1(t=-2.173,P=0.036)和Observed species(t=-2.627,P=0.012)在H.pylori阳性受试者中显著降低;β-多样性指数PCA分析可显著区分两组,结果显示H.pylori感染胃部菌群显著改变。LEfSe组成差异分析发现,胃部菌群组成亦发生了显著改变,H.pylori感染阳性组中变形菌门细菌显著升高,而厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门等显著降低;在属水平上,螺杆菌属(Helicobacter)、盐单胞菌属(Halomonas)、希瓦内拉菌属(Shewanella)和葡萄球菌属(Staphylococcus)等显著富集,而普氏菌属(Prevotella)、假单胞菌属(Pseudomonas)、芽胞杆菌属(Bacillus)等显著降低(LDA>2,P<0.05)。PiCRUSt菌群功能预测分析发现,H.pylori阳性的胃部菌群细菌分泌系统、脂多糖合成蛋白、脂多糖合成、细菌毒素、癌症信号通路的表达显著升高,而氨基酸代谢通路显著降低,这与胃癌的发生发展具有密切的联系。结论H.pylori感染是影响正常胃部菌群多样性和组成的重要因素,这些改变可能与胃癌发生发展及预后密切相关。

IgE介导牛乳蛋白过敏婴幼儿肠道菌群改变初探

目的应用高通量测序技术探讨IgE介导的牛乳蛋白过敏(cow′s milk protein allergy,CMA)婴幼儿肠道菌群结构和组成的变化。方法回顾性分析2012年6月-2013年6月入组食物过敏患儿,选择出IgE介导的CMA(IgE-CMA)患儿4例,非IgE介导的CMA(non-IgE-CMA)患儿4例,采集粪便样本进行454焦磷酸测序分析,血清样本进行细胞因子检测。结果与non-IgE-CMA患儿相比较,IgECMA患儿肠道菌群多样性Shannon指数(t=-2.996,P=0.010)和Simpson指数(t=-1.786,P=0.036)显著改变,菌群多样性下降,菌群丰富度指数ACE(t=0.406,P=0.021)显著升高。β-多样性PCA分析可显著区分两组,提示IgE-CMA患儿肠道菌群发生显著改变。LEfSe组成差异分析发现肠道菌群中硬壁菌门和拟杆菌门的改变与CMA的不同表型无关,IgE-CMA婴儿中链球菌、肠球菌、鞘氨醇单胞菌、双歧杆菌、罗思氏菌属、红球菌和梭菌属第Ⅺ簇等减少,而厌氧杆菌和狭义梭菌属增加,可用于鉴别诊断CMA表型。结论IgE可决定CMA患儿肠道菌群的改变,这为开展以肠道菌群为靶点的不同表型CMA诊疗提供了新策略。

肠道菌群与婴幼儿过敏性疾病

肠道菌群是一个被遗忘的＂器官＂,其在宿主消化营养免疫发育等诸多方面发挥着极为重要的作用。0～3岁是婴幼儿肠道菌群建立的关键时间窗,其与肠道免疫系统的成熟同步,是形成免疫耐受的关键时期,如果这一时期肠道菌群发生紊乱,可导致免疫耐受破坏,引起婴幼儿过敏性疾病。近年来流行病学调查和实验研究提示婴幼儿早期肠道菌群紊乱与过敏性疾病的发生发展密切相关,本研究就婴幼儿常见过敏性疾病如特应性皮炎、食物过敏、哮喘、过敏性鼻炎等与肠道菌群的相关性进行综述。