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基于网络药理学和分子对接技术探究黄芪-地黄药对治疗糖尿病的作用机制
1
作者
李杜廉
陶晓静
程辉标
《广西医学》
CAS
2023年第19期2379-2384,2398,共7页
目的 基于网络药理学和分子对接技术探究黄芪-地黄药对治疗糖尿病的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台及中医药整合药理学研究平台分别筛选得到黄芪、地黄的活性化学成分,再利用SwissTargetPrediction数据库获取活性化...
目的 基于网络药理学和分子对接技术探究黄芪-地黄药对治疗糖尿病的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台及中医药整合药理学研究平台分别筛选得到黄芪、地黄的活性化学成分,再利用SwissTargetPrediction数据库获取活性化学成分的作用靶点。通过GeneCard?数据库、DisGeNET数据库检索糖尿病相关靶点。将上述靶点取交集,利用STRING平台和Cytoscape软件构建交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络以筛选出核心靶点。运用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点-疾病网络以筛选核心活性化学成分。采用Metascape软件对交集靶点进行功能富集分析和通路富集分析。采用AutoDock Tools 1.5.7软件对核心活性化学成分与核心靶点进行分子对接分析。结果 共筛选到12个地黄活性化学成分和13个黄芪活性化学成分,活性化学成分的作用靶点582个,糖尿病相关靶点1 646个,交集靶点176个。黄芪-地黄药对治疗糖尿病的核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT)1、肿瘤坏死因子(TNF)、GAPDH、表皮生长因子受体(EGFR)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC),核心活性化学成分为3,9-di-O-美迪紫檀素、华良姜素、京尼平苷、异鼠李素、山柰酚、槲皮素。交集靶点涉及对激素的反应、对无机物的反应、细胞对含氮化合物的反应等生物过程,涉及膜筏、膜微区、细胞质的核周区域等细胞组分,涉及以醇基为受体的磷酸转移酶活性、蛋白激酶活性、激酶活性等分子功能,以及涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/AKT信号通路、胰岛素信号通路、胰岛素抵抗、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(AGE)-糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、TNF信号通路、低氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等信号通路。分子对接结果显示,所有核心活性化学成分与核心靶点均结合良好。结论 黄芪-地黄药对的3,9-di-O-美迪紫檀素、华良姜素、京尼平苷、异鼠李素、山柰酚、槲皮素等活性化学成分可能通过作用于AKT1、TNF、GAPDH、EGFR和SRC等靶点,调控PI3K/AKT信号通路、胰岛素信号通路、胰岛素抵抗、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路等,从而发挥治疗糖尿病的作用。
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关键词
糖尿病
黄芪
地黄
药对
作用机制
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接技术探究黄芪-地黄药对治疗糖尿病的作用机制
1
作者
李杜廉
陶晓静
程辉标
机构
柳州市中医医院(柳州市壮医医院)药学部
广西壮族自治区卫生健康委员会办公室
出处
《广西医学》
CAS
2023年第19期2379-2384,2398,共7页
基金
广西中医药大学自然科学研究项目(2020QN022)。
文摘
目的 基于网络药理学和分子对接技术探究黄芪-地黄药对治疗糖尿病的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台及中医药整合药理学研究平台分别筛选得到黄芪、地黄的活性化学成分,再利用SwissTargetPrediction数据库获取活性化学成分的作用靶点。通过GeneCard?数据库、DisGeNET数据库检索糖尿病相关靶点。将上述靶点取交集,利用STRING平台和Cytoscape软件构建交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络以筛选出核心靶点。运用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点-疾病网络以筛选核心活性化学成分。采用Metascape软件对交集靶点进行功能富集分析和通路富集分析。采用AutoDock Tools 1.5.7软件对核心活性化学成分与核心靶点进行分子对接分析。结果 共筛选到12个地黄活性化学成分和13个黄芪活性化学成分,活性化学成分的作用靶点582个,糖尿病相关靶点1 646个,交集靶点176个。黄芪-地黄药对治疗糖尿病的核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT)1、肿瘤坏死因子(TNF)、GAPDH、表皮生长因子受体(EGFR)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC),核心活性化学成分为3,9-di-O-美迪紫檀素、华良姜素、京尼平苷、异鼠李素、山柰酚、槲皮素。交集靶点涉及对激素的反应、对无机物的反应、细胞对含氮化合物的反应等生物过程,涉及膜筏、膜微区、细胞质的核周区域等细胞组分,涉及以醇基为受体的磷酸转移酶活性、蛋白激酶活性、激酶活性等分子功能,以及涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/AKT信号通路、胰岛素信号通路、胰岛素抵抗、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(AGE)-糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、TNF信号通路、低氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等信号通路。分子对接结果显示,所有核心活性化学成分与核心靶点均结合良好。结论 黄芪-地黄药对的3,9-di-O-美迪紫檀素、华良姜素、京尼平苷、异鼠李素、山柰酚、槲皮素等活性化学成分可能通过作用于AKT1、TNF、GAPDH、EGFR和SRC等靶点,调控PI3K/AKT信号通路、胰岛素信号通路、胰岛素抵抗、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路等,从而发挥治疗糖尿病的作用。
关键词
糖尿病
黄芪
地黄
药对
作用机制
网络药理学
分子对接
Keywords
Diabetes mellitus
Hedysarum multijugum
Rehmanniae radix praeparata
Drug pair
Mechanism
Network pharmacology
Molecular docking
分类号
R587.1 [医药卫生—内分泌]
R28 [医药卫生—中药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接技术探究黄芪-地黄药对治疗糖尿病的作用机制
李杜廉
陶晓静
程辉标
《广西医学》
CAS
2023
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