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题名叶艺兰CcMYB24基因克隆及生物信息学分析
被引量:1
- 1
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作者
晏创
程隆杰
武佳美
赵一燃
李枝林
王玉英
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机构
云南农业大学园林园艺学院
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出处
《北方园艺》
CAS
北大核心
2023年第18期70-78,共9页
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基金
云南省基础研究资助项目(202001AT070101)
云南省创新团队资助项目(202105AE160012)。
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文摘
以叶艺兰(Cymbidium tracyanum var.‘huanghua’×C.iridioides D.Don.‘Yeyi’)为试材,以课题组前期获得的叶艺兰上调表达CcMYB24基因的EST序列为基础,采用PCR技术扩增全长,并进行生物信息学分析和亚细胞定位,研究了CcMYB24基因功能,以期为植物MYB24的结构与功能利用提供参考依据。结果表明:CcMYB24基因全长908 bp,编码301个氨基酸,生物信息学分析预测CcMYB24蛋白是偏碱性、不稳定、亲水、非跨膜的非分泌蛋白;CcMYB24氨基酸序列具有1个特定匹配的保守MYB蛋白DNA结合域,且含有2个R结构,属于R2R3-MYBs家族;亚细胞定位结果显示CcMYB24蛋白定位在细胞核上。系统进化树表明,其与建兰(Cymbidium ensifolium)亲缘关系最近,与建兰CeRAX2-like同源性最高,为95.99%。因CcMYB24基因属于R2R3-MYBs家族,推测CcMYB24转录因子可能发挥着与R2R3-MYB转录因子相似的作用。
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关键词
叶艺兰
CcMYB24基因
序列分析
亚细胞定位
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Keywords
Cymbidium with variegated leaf
CcMYB24 gene
sequence analysis
subcellular localization
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分类号
S682.31
[农业科学—观赏园艺]
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题名叶艺兰CcMYB8基因克隆及生物信息学分析
被引量:1
- 2
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作者
姚红旭
李枝林
赵一燃
程隆杰
杨昊楠
王玉英
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机构
云南农业大学园林园艺学院
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出处
《北方园艺》
CAS
北大核心
2021年第18期75-80,共6页
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基金
云南省科技计划重点资助项目(2018BB010)
云南省科技厅面上资助项目(2018FB070,202001AT070101)
+2 种基金
昆明市科学技术局重点资助项目(2015-1-N-00984)
云南农业大学自然科学青年科研基金资助项目(2016ZR10)
国家观赏园艺工程技术研究中心云南省花卉育种重点实验室开放基金资助项目(FKL-201602)。
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文摘
以叶艺兰(Cymbidium tracyanum var.‘huanghua’×C.iridioides D.Don.‘Yeyi’)叶片为试材,通过PCR技术,克隆CcMYB8基因全长,对其序列进行生物信息学、氨基酸同源性和亲缘关系分析,研究CcMYB8基因的功能,以期为揭示R2R3-MYB亚家族转录因子调控叶艺兰斑形成的机理研究奠定基础。结果表明:叶艺兰CcMYB8基因编码不稳定亲水性蛋白,具2个SANT保守结构域,全长为657 bp、编码219个氨基酸、分子量为24.974 kDa;与墨兰高度同源,其相似性达99.54%;系统进化树结果也表明,其与墨兰的亲缘关系最近;因此表明叶艺兰CcMYB8基因功能与该物种的相似或相同。
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关键词
叶艺兰
转录因子
MYB8
序列分析
同源性
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Keywords
Cymbidium with variegated leaf
transcription factor
MYB8
sequence analysis
homology
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分类号
S682.31
[农业科学—观赏园艺]
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