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叶艺兰CcMYB24基因克隆及生物信息学分析 被引量:1
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作者 晏创 程隆杰 +3 位作者 武佳美 赵一燃 李枝林 王玉英 《北方园艺》 CAS 北大核心 2023年第18期70-78,共9页
以叶艺兰(Cymbidium tracyanum var.‘huanghua’×C.iridioides D.Don.‘Yeyi’)为试材,以课题组前期获得的叶艺兰上调表达CcMYB24基因的EST序列为基础,采用PCR技术扩增全长,并进行生物信息学分析和亚细胞定位,研究了CcMYB24基因功... 以叶艺兰(Cymbidium tracyanum var.‘huanghua’×C.iridioides D.Don.‘Yeyi’)为试材,以课题组前期获得的叶艺兰上调表达CcMYB24基因的EST序列为基础,采用PCR技术扩增全长,并进行生物信息学分析和亚细胞定位,研究了CcMYB24基因功能,以期为植物MYB24的结构与功能利用提供参考依据。结果表明:CcMYB24基因全长908 bp,编码301个氨基酸,生物信息学分析预测CcMYB24蛋白是偏碱性、不稳定、亲水、非跨膜的非分泌蛋白;CcMYB24氨基酸序列具有1个特定匹配的保守MYB蛋白DNA结合域,且含有2个R结构,属于R2R3-MYBs家族;亚细胞定位结果显示CcMYB24蛋白定位在细胞核上。系统进化树表明,其与建兰(Cymbidium ensifolium)亲缘关系最近,与建兰CeRAX2-like同源性最高,为95.99%。因CcMYB24基因属于R2R3-MYBs家族,推测CcMYB24转录因子可能发挥着与R2R3-MYB转录因子相似的作用。 展开更多
关键词 叶艺兰 CcMYB24基因 序列分析 亚细胞定位
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叶艺兰CcMYB8基因克隆及生物信息学分析 被引量:1
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作者 姚红旭 李枝林 +3 位作者 赵一燃 程隆杰 杨昊楠 王玉英 《北方园艺》 CAS 北大核心 2021年第18期75-80,共6页
以叶艺兰(Cymbidium tracyanum var.‘huanghua’×C.iridioides D.Don.‘Yeyi’)叶片为试材,通过PCR技术,克隆CcMYB8基因全长,对其序列进行生物信息学、氨基酸同源性和亲缘关系分析,研究CcMYB8基因的功能,以期为揭示R2R3-MYB亚家... 以叶艺兰(Cymbidium tracyanum var.‘huanghua’×C.iridioides D.Don.‘Yeyi’)叶片为试材,通过PCR技术,克隆CcMYB8基因全长,对其序列进行生物信息学、氨基酸同源性和亲缘关系分析,研究CcMYB8基因的功能,以期为揭示R2R3-MYB亚家族转录因子调控叶艺兰斑形成的机理研究奠定基础。结果表明:叶艺兰CcMYB8基因编码不稳定亲水性蛋白,具2个SANT保守结构域,全长为657 bp、编码219个氨基酸、分子量为24.974 kDa;与墨兰高度同源,其相似性达99.54%;系统进化树结果也表明,其与墨兰的亲缘关系最近;因此表明叶艺兰CcMYB8基因功能与该物种的相似或相同。 展开更多
关键词 叶艺兰 转录因子 MYB8 序列分析 同源性
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