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粗山羊草响应盐胁迫转录组分析
被引量:
2
1
作者
施田野
顾宇蓝
+7 位作者
张磊
尹华燕
唐恒
平艳飞
穆如宇
穆可卿
张文文
侯文倩
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第21期7015-7022,共8页
利用转录组测序(RNA-Seq)技术对粗山羊草‘AL8/78'在200 mmol/L NaCl人工模拟盐胁迫0h和96h进行了转录组分析。结果表明:盐胁迫处理下上调和下调表达的差异表达基因(DEGs)分别为546个和876个;GO富集分析发现,DEGs主要集中在代谢过...
利用转录组测序(RNA-Seq)技术对粗山羊草‘AL8/78'在200 mmol/L NaCl人工模拟盐胁迫0h和96h进行了转录组分析。结果表明:盐胁迫处理下上调和下调表达的差异表达基因(DEGs)分别为546个和876个;GO富集分析发现,DEGs主要集中在代谢过程、细胞过程、细胞连接、催化活性等生物过程;KEGG富集分析发现,DEGs主要富集在苯丙酮生物合成、类黄酮生物合成、植物激素信号转导等信号通路。通过对DEGs进行转录因子注释,共注释到41个转录因子,主要包括WRKY、MYB、bHLH、NAC和HSP等类型。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对DEGs进行了表达模式验证,发现其与RNA-Seq测序结果一致,证明了RNA-Seq结果的准确性。本研究为挖掘粗山羊草耐盐基因提供了理论基础。
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关键词
粗山羊草(Aegilops
tauschii)
盐胁迫
转录组
原文传递
题名
粗山羊草响应盐胁迫转录组分析
被引量:
2
1
作者
施田野
顾宇蓝
张磊
尹华燕
唐恒
平艳飞
穆如宇
穆可卿
张文文
侯文倩
机构
江苏师范大学生命科学学院
山东农业大学农学院
潍坊学院生物与农业工程学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第21期7015-7022,共8页
基金
江苏师范大学自然科学研究基金研究项目(18XLRX031,18XLRX030)资助。
文摘
利用转录组测序(RNA-Seq)技术对粗山羊草‘AL8/78'在200 mmol/L NaCl人工模拟盐胁迫0h和96h进行了转录组分析。结果表明:盐胁迫处理下上调和下调表达的差异表达基因(DEGs)分别为546个和876个;GO富集分析发现,DEGs主要集中在代谢过程、细胞过程、细胞连接、催化活性等生物过程;KEGG富集分析发现,DEGs主要富集在苯丙酮生物合成、类黄酮生物合成、植物激素信号转导等信号通路。通过对DEGs进行转录因子注释,共注释到41个转录因子,主要包括WRKY、MYB、bHLH、NAC和HSP等类型。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对DEGs进行了表达模式验证,发现其与RNA-Seq测序结果一致,证明了RNA-Seq结果的准确性。本研究为挖掘粗山羊草耐盐基因提供了理论基础。
关键词
粗山羊草(Aegilops
tauschii)
盐胁迫
转录组
Keywords
Aegilops tauschii
Salt stress
Transcriptome
分类号
S567.2 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
粗山羊草响应盐胁迫转录组分析
施田野
顾宇蓝
张磊
尹华燕
唐恒
平艳飞
穆如宇
穆可卿
张文文
侯文倩
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
原文传递
已选择
0
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参考文献
引证文献
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