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乳腺癌标志物影响卵丘细胞基因表达的生物信息学分析
1
作者
桑茜
白莹莹
+3 位作者
张圣杰
张同浩
穆志威
谌馥佳
《安阳工学院学报》
2023年第2期103-110,共8页
为探讨乳腺癌患者大概率患有不孕症的情况,本研究应用生物信息学方法来研究乳腺癌标志物对卵丘细胞基因表达的影响。从NCBI的GEO数据库下载有关乳腺癌标志物的基因芯片数据库和卵丘细胞基因表达的基因芯片数据库。利用在线GEO2R筛选出2...
为探讨乳腺癌患者大概率患有不孕症的情况,本研究应用生物信息学方法来研究乳腺癌标志物对卵丘细胞基因表达的影响。从NCBI的GEO数据库下载有关乳腺癌标志物的基因芯片数据库和卵丘细胞基因表达的基因芯片数据库。利用在线GEO2R筛选出2个数据库的差异基因,在EXCEL表格中进行筛选,对2个结果作韦恩图获得2个数据库差异基因的交集,利用DAVID6.8数据库对差异基因进行GO功能分析和KEGG通路分析,运用String-db数据库构建蛋白之间的相互作用图(PPI),导入Cytoscape3.6.1软件获取关键靶基因。本文通过生物信息学方法从不同角度揭示有关乳腺癌标志物对卵丘细胞差异基因表达的影响,为人类乳腺癌患者生育能力的提高带来新思路。
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关键词
生物信息学
乳腺癌标志物
卵丘细胞
差异表达蛋白
关键靶基因
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职称材料
题名
乳腺癌标志物影响卵丘细胞基因表达的生物信息学分析
1
作者
桑茜
白莹莹
张圣杰
张同浩
穆志威
谌馥佳
机构
安阳工学院
黄淮学院
出处
《安阳工学院学报》
2023年第2期103-110,共8页
基金
河南省科技厅科技攻关项目(202102310479,222102110180)。
文摘
为探讨乳腺癌患者大概率患有不孕症的情况,本研究应用生物信息学方法来研究乳腺癌标志物对卵丘细胞基因表达的影响。从NCBI的GEO数据库下载有关乳腺癌标志物的基因芯片数据库和卵丘细胞基因表达的基因芯片数据库。利用在线GEO2R筛选出2个数据库的差异基因,在EXCEL表格中进行筛选,对2个结果作韦恩图获得2个数据库差异基因的交集,利用DAVID6.8数据库对差异基因进行GO功能分析和KEGG通路分析,运用String-db数据库构建蛋白之间的相互作用图(PPI),导入Cytoscape3.6.1软件获取关键靶基因。本文通过生物信息学方法从不同角度揭示有关乳腺癌标志物对卵丘细胞差异基因表达的影响,为人类乳腺癌患者生育能力的提高带来新思路。
关键词
生物信息学
乳腺癌标志物
卵丘细胞
差异表达蛋白
关键靶基因
Keywords
Bioinformatics
breast cancer markers
cumulus cells
differentially expressed genes
key target gene
分类号
Q28 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乳腺癌标志物影响卵丘细胞基因表达的生物信息学分析
桑茜
白莹莹
张圣杰
张同浩
穆志威
谌馥佳
《安阳工学院学报》
2023
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