大鼠肝再生中环状RNA表达谱的变化及其对自噬的影响

目的探讨大鼠肝再生中环状RNA(circ RNA)的表达变化以及对自噬的影响。方法以60只大鼠2/3肝切除0 h、2 h、6 h、12 h、24 h、30 h、36 h、72 h、120 h和168 h后的再生肝circRNAs、微小RNAs(miRNAs)、mRNA的高通量测序数据为基础,分析其在肝再生中的表达变化,进一步用miRanda aug 2010软件预测circRNAmiRNA和miRNA-mRNA靶标关系,并根据基因功能→miRNA功能→circRNA功能反向推测得到支配大鼠肝脏自噬的肝再生相关circRNAs和miRNAs,并构建它们的相互作用网络。结果与肝再生自噬相关的circRNAs、miRNAs、mRNA分别有102、42、153种。利用生物信息学分析,发现44种circRNAs、13种miRNAs及17种mRNA之间有相互作用关系,并以此构建了它们的共表达网络。结论筛选出了与肝再生自噬相关的circRNAs、miRNAs和mRNA,并构建了相互作用网络图谱。