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题名巨桉EgrDREB2A基因结构及表达特性分析
被引量:7
- 1
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作者
魏晓玲
程龙军
窦锦青
徐凤华
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机构
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地
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出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期80-89,共10页
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基金
国家"863"项目子项目"白桦
桉树等分子育种与品种创制"(2011AA100202)
国家自然科学基金项目"巨桉锌指结构蛋白基因EgrZPCT在抗冷胁迫中功能和调控机制研究"(31270657)
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文摘
【目的】从低温条件下巨桉mRNA抑制消减杂交(SSH)文库中筛选得到一个受低温诱导的基因Egr DREB2A(Eucgr.G03094),通过对其蛋白序列特征、亚细胞定位特点以及低温、ABA和盐胁迫逆境处理条件下基因表达方式的分析,讨论Egr DREB2A在巨桉非生物逆境响应中所发挥的作用。【方法】使用SMART,Mat Inspector和MEGA等生物信息学软件,分析Egr DREB2A的序列和编码蛋白特征,搜寻启动子上的重要顺式作用元件并构建其蛋白序列进化树;亚细胞定位采用基因枪轰击洋葱表皮的方法;Egr DREB2A组织表达特异性及低温、ABA和盐胁迫条件下的基因表达分析分别采用半定量和定量RT-PCR方法进行;在4℃低温下随处理时间(0.5,2,6,12,24,48 h)的基因数字表达谱基础上,用WGCNA和Cytoscape软件对Egr DREB2A进行基因共表达分析。【结果】Egr DREB2A编码的蛋白序列含有1个典型的AP2结构域,且结构域内部包含YRG和RAYD 2个保守区,属于DREB2类基因,进化树构建结果表明该基因属于DREB2类基因的亚型Ⅰ。Egr DREB2A启动子序列上含有多个与植物逆境响应相关的顺式作用元件。该基因有明显的核定位区,亚细胞定位结果也表明其编码蛋白主要在核中表达。正常条件下,根、茎和叶中Egr DREB2A都有表达,但叶片中表达水平相对较高。在不同低温(0,2,4,6,8℃)下Egr DREB2A被强烈诱导,4℃低温下随处理时间(0.5,2,6,12,24,48 h)的延长,其表达量呈上升趋势,不同时间处理下与Egr DREB2A具有共表达关系的基因多属于参与植物对逆境响应的基因。ABA(100μmol·L-1)对Egr DREB2A的表达表现为先促进而后抑制,而Na Cl(200 mmol·L-1)的处理则表现为先抑制后促进。昼夜节律同样影响Egr DREB2A的表达,光照下基因表达升高,黑暗条件下基因表达降低。【结论】巨桉Egr DREB2A属于DREB2类基因,其表达受低温诱导,同时受ABA、盐和昼夜节律的影响。该基因启动子序列上启动子元件及与其共表达基因大多与植物逆境响应有关。这些结果表明Egr DREB2A可能在巨桉抵抗非生物逆境因子的过程中发挥比较重要的作用。
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关键词
巨桉
EgrDREB2A
基因表达
非生物胁迫
昼夜节律
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Keywords
Eucalyptus grandis
EgrDREB2A
gene expression
abiotic stress
circadian rhythm
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分类号
S718.46
[农业科学—林学]
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题名巨桉低温胁迫响应基因EgrCR的表达与功能
被引量:2
- 2
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作者
徐凤华
程龙军
魏晓玲
窦锦青
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机构
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地
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出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期59-67,共9页
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基金
国家自然科学基金项目"巨桉锌指结构蛋白基因EgrZPCT在抗冷胁迫中功能和调控机制的研究"(31270657)
国家"863"项目子项目"白桦
桉树等分子育种与品种创制"(2011AA100202)
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文摘
【目的】通过对巨桉中冷响应基因EgrCR(Eucgr.B02857)的蛋白序列特征、亚细胞定位、低温等非生物逆境条件下的表达以及拟南芥中该基因超表达株系的表型分析,探讨EgrCR基因在巨桉响应低温等非生物逆境中的作用。【方法】利用Protparam,PSIPRED,TMHMM,Mat Inspector和MEGA等生物信息学软件,预测EgrCR编码蛋白结构特征、启动子上的重要顺式作用元件,并构建其同源蛋白序列进化树;同时,采用基因枪轰击洋葱表皮方法进行基因编码蛋白亚细胞定位分析;组织特异性表达及低温等非生物逆境及昼夜节律下的表达分析,分别采用半定量和定量RT-PCR方法。通过构建35S::EgrCR超表达载体转化拟南芥,观察转基因株系在不同低温(0,4℃)处理下的表现,研究该基因对低温响应的功能特性。【结果】EgrCR编码的蛋白序列含有144个氨基酸,二级结构中包含4个α螺旋、3个β折叠,没有预测到结构域、跨膜域的存在。在进化的亲缘关系上,EgrCR与毛果杨中的同源蛋白亲缘关系最近,氨基酸序列相似度达到68%。在其启动子序列上含有多个与植物逆境响应相关的顺式作用元件。亚细胞定位结果表明其编码蛋白在核中表达。正常条件下,EgrCR主要在茎和叶中表达。不同低温(0,2,4,6,8℃)处理和4℃低温下随处理时间(2,6,12,24,48 h)的延长,EgrCR受到强烈的诱导。ABA(100μmol·L^(-1))对EgrCR表达没有明显影响,而NaCl(200 mmol·L^(-1))处理下则表现为先抑制后促进。昼夜节律也影响EgrCR的表达,光照下基因表达被诱导,黑暗条件下基因表达受抑制。拟南芥中EgrCR超表达转基因株系4℃处理条件下,花青素苷积累现象减轻;0℃处理3天再恢复生长1周后,超表达株系能快速恢复生长,表现出较强的耐低温能力。【结论】EgrCR基因参与巨桉低温胁迫响应,还可能参与巨桉的高盐胁迫响应,昼夜节律对其表达也有影响。
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关键词
巨桉
EgrCR
低温胁迫
基因表达
基因功能
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Keywords
Eucalyptus grandis
EgrCR
cold stress
gene expression
gene function
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分类号
S718.46
[农业科学—林学]
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题名对军队院校图书馆信息资源共建共享管理的思考与对策
被引量:1
- 3
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作者
窦锦青
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机构
南京政治学院上海分院军事信息管理系
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出处
《内蒙古科技与经济》
2011年第5期75-77,共3页
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文摘
论述了军队院校图书馆在信息资源共建共享过程中,因缺乏集中统一管理而出现的主要问题,并提出了相应的措施。
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关键词
军队院校
图书馆
信息资源
管理
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分类号
G251
[文化科学—图书馆学]
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题名加强军队档案信息化建设的思考
- 4
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作者
窦锦青
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机构
第二炮兵装备研究院
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出处
《信息管理(上海)》
2012年第6期4-7,21,共5页
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文摘
随着现代化信息技术的快速发展,军队档案工作的重要性逐渐提高,工作思路发生了转变,开始了信息化建设,决定了档案资源数字化、标准化、蚓络化的工作目标。本文阐述了军队档案信息化建设的必要性,分析了建设现状中还存在的部分问题,并提出了加速军队档案信息化建设的五条对策,以推动军队档案信息化建设快速健康的发展。
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关键词
军队
档案工作
信息化建设
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分类号
G270.7
[文化科学—档案学]
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题名光皮桦BBX类基因BlCOL13的克隆与表达分析
被引量:6
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作者
窦锦青
程龙军
徐凤华
张俊红
童再康
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机构
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地
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出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第7期1367-1377,共11页
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基金
浙江省农业新品种育种重大专项项目(2012C12908-8)
国家自然科学基金项目(31300566)
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文摘
利用RACE、RT-PCR以及基因组步移技术克隆得到光皮桦Bl COL13全长c DNA(Gen Bank登录号:KP663425)、全长DNA及其启动子序列。该基因DNA全长2 808 bp,具有4个外显子,3个内含子;c DNA全长1 370 bp,包含1 140 bp的开放阅读框,编码含379个氨基酸的蛋白。Bl COL13蛋白N、C端分别有两个B-box和一个CCT结构域,属于典型的BBX蛋白。以拟南芥中BBX蛋白的分类为参照,通过聚类分析表明Bl COL13属于Ⅱ型BBX蛋白;克隆得到的Bl COL13启动子序列长685 bp,含有多个与成花、光响应、激素信号转导以及逆境胁迫相关的顺式作用元件。亚细胞定位试验结果表明该基因主要在细胞核中表达。不同组织中该基因都有一定程度的表达,但在雄花中表达量最高。低温、干旱、ABA和盐胁迫等非生物逆境都在一定程度上诱导Bl COL13的表达,盐胁迫的影响最为明显,表明该基因在光皮桦逆境响应中可能发挥比较重要的作用。
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关键词
光皮桦
BETULA
luminifera
BlCOL13
BBX
基因克隆
表达分析
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Keywords
Betula luminifera
BlCOL13
BBX
gene clone
gene express
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分类号
S68
[农业科学—观赏园艺]
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