鬼箭羽通过调节EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药信号通路延缓糖尿病肾病的进展

目的结合GEO数据库利用网络药理学、分子对接技术及动物实验探究鬼箭羽治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制。方法通过TCMSP、PubChem及Swiss Target Prediction数据库获取鬼箭羽的活性成分和作用靶点。利用GEO数据库找出与DKD相关基因芯片,使用R语言分析筛选出差异表达基因,结合GeneCards、DisGeNet、OMIM以及TTD疾病数据库整合获取DKD的治疗靶点。利用Venny2.1.0平台将药物与DKD相关的靶基因取交,利用STRING平台构建蛋白-蛋白互作网络图,并利用Cytoscape3.8.2软件进行核心靶点的拓扑属性分析以及“药物-成分-靶点-疾病”网络图构建;利用David平台进行KEGG与GO分析。利用Autodock vina V1.2.0软件对核心靶点及主要药效成分进行分子对接,并通过db小鼠动物实验进一步加以验证。结果符合条件的基因芯片为GSE96804、GSE30528和GSE30529,共包含60例患病和45例正常样本数据,R语言分析得到111个差异基因。网络药理学分析显示鬼箭羽相关靶基因共226种,DKD相关靶基因共4252种,二者取交得到鬼箭羽治疗DKD的潜在靶基因共161种;PPI网络图中筛选出关键核心靶基因为SRC、EGFR、AKT1等,“药物-成分-靶点-疾病”网络图得到鬼箭羽的主要核心活性成分为槲皮素、山奈酚、香叶木素、柚皮素。GO和KEGG富集分析显示,鬼箭羽治疗DKD的生物过程与外源刺激的反应、蛋白质磷酸化等有关,可能主要通过调节EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药通路发挥作用。分子对接结果显示鬼箭羽的主要核心活性成分与关键核心靶点具有良好的结合活性。体内动物实验结果证明鬼箭羽能够改善肾脏组织的病理学变化,且显著抑制了SRC、EGFR、AKT1的表达(P<0.05),延缓DKD的进一步恶化。结论鬼箭羽可能是通过槲皮素、山奈酚、香叶木素、柚皮素等多种活性成分调控SRC、EGFR、AKT1等基因表达,从而影响EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药信号通路治疗DKD。

基于网络药理学和分子对接技术探讨复方菖蒲益智汤治疗轻度认知功能障碍的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探究复方菖蒲益智汤治疗轻度认知功能障碍(MCI)的药理学作用机制。方法:通过TCMSP平台和PubChem、Swiss Target Prediction数据库获取复方菖蒲益智汤主要的6味中药的活性成分和作用靶点,从GeneCards、DisGeNet、OMIM、TTD数据库获取MCI的相关基因。利用Venny 2.1.0平台将药物的成分靶点与MCI相关的靶基因取交集,利用Cytoscape 3.7.2进行“药物-成分-靶点-疾病”网络图的构建,并利用STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,然后利用Metascape平台进行KEGG通路富集分析与GO功能富集分析。最后利用Autodock vina V1.2.0对核心作用靶点及主要药效成分进行分子对接,验证它们之间的紧密联系程度。结果:复方菖蒲益智汤治疗MCI的潜在靶基因共178种。PPI网络图筛选出AKT1、TNF、EGFR、CASP3、IL1B、VEGFA 6个关键核心靶点,涉及7NH5、6Q00、8A27等关键核心靶蛋白;KEGG通路富集分析结果表明,AKT1、TNF、IL1B、VEGFA 4个关键核心靶点在AGE-RAGE信号通路中。分子对接结果显示,复方菖蒲益智汤的有效成分与上述6个关键核心靶点的结合活性良好。结论:复方菖蒲益智汤中主要的6味中药的活性成分可作用于AKT1、TNF、IL1B等多个靶点,通过调控AGE-RAGE通路发挥治疗MCI的作用。