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水稻组蛋白H1三突变体的创建和转录组学分析
1
作者
杨淇
魏子迪
+6 位作者
宋娟
童堃
杨柳
王佳涵
刘海燕
栾维江
马轩
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期85-96,共12页
【目的】组蛋白H1对于染色质高级结构的维持和稳定具有重要作用,研究水稻H1对基因表达的影响,为深入理解水稻H1的生物学调控功能提供依据。【方法】通过半定量RT-PCR与RT-qPCR对水稻4个H1基因进行表达分析,利用CRISPR技术创建水稻H1基...
【目的】组蛋白H1对于染色质高级结构的维持和稳定具有重要作用,研究水稻H1对基因表达的影响,为深入理解水稻H1的生物学调控功能提供依据。【方法】通过半定量RT-PCR与RT-qPCR对水稻4个H1基因进行表达分析,利用CRISPR技术创建水稻H1基因编辑植株,鉴定突变体表型,对突变体进行转录组学分析。【结果】水稻4个H1基因的表达比较广谱,在根中的表达较低;在T_(0)代CRISPR突变体筛选过程中发现H1.1-H1.4发生多种突变;在T_(1)代筛选到一株Osh1.1 Osh1.3 Osh1.4纯合三突变体,该三突变体具有多种发育缺陷,成为转录组分析的材料;进一步在T_(2)代得到三突和四突群体,该群体约25%为白化苗,植株生长迟缓,在响应干旱胁迫方面发生缺陷;对三突变体进行转录组学分析,鉴定到1055个差异表达基因,显著上调的基因约为下调基因的2.5倍,说明H1可能具有抑制基因表达的功能。【结论】在突变体中,光合作用、胁迫响应、氨基酸代谢和RNA代谢等多种途径均发生调控紊乱;其中,核糖体蛋白和光合作用相关基因显著上调,与干旱胁迫相关的脱氢酶基因显著下调。核糖体途径基因过量表达可能造成蛋白质稳态失调,导致植物发育缺陷。
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关键词
水稻
组蛋白H1
CRISPR
转录组测序
RT-QPCR
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职称材料
缺氧诱导的外泌体活化自噬促进肝癌进展
2
作者
王坪锋
胡培
+3 位作者
童堃
童尧尧
李莹
严世荣
《山西医科大学学报》
CAS
2023年第8期1019-1028,共10页
目的探讨缺氧诱导的外泌体对肝癌进展的调节作用及其机制。方法将Huh7细胞置于0.1%O_(2)培养箱培养24 h作为缺氧组,另设常氧组,提取外泌体,纳米追踪技术检测外泌体的浓度和粒径大小,免疫印迹检测HSP70、Alix、CD63的表达。将Huh7细胞分...
目的探讨缺氧诱导的外泌体对肝癌进展的调节作用及其机制。方法将Huh7细胞置于0.1%O_(2)培养箱培养24 h作为缺氧组,另设常氧组,提取外泌体,纳米追踪技术检测外泌体的浓度和粒径大小,免疫印迹检测HSP70、Alix、CD63的表达。将Huh7细胞分为对照组(PBS)、常氧外泌体组(20μg/ml常氧外泌体)、缺氧外泌体组(20μg/ml缺氧外泌体),实时无标记细胞分析仪(real-time cell analysis,RTCA)实验检测细胞增殖,划痕实验检测细胞迁移,免疫印记检测细胞PCNA、cyclin D1、Bax、E-cadherin、N-cadherin、Vimentin、Beclin1、LC3、p62的表达,激光共聚焦检测自噬流的改变。Huh7细胞分为对照组(PBS)、缺氧外泌体组(20μg/ml缺氧外泌体)、缺氧外泌体+3-MA组(5 mmol/L 3-甲基腺嘌呤+1 h后20μg/ml缺氧外泌体),检测细胞增殖、迁移和相关蛋白的表达。结果与常氧组相比,缺氧组外泌体浓度增加,但外泌体粒径的大小没有明显变化,缺氧组外泌体标记蛋白HSP70、Alix、CD63的表达增加(P<0.05)。与常氧外泌体组相比,缺氧外泌体组Huh7细胞增殖和迁移能力增强(均P<0.05),PCNA、cyclin D1、N-cadherin、Vimentin、Beclin1、LC3-Ⅱ的表达上调,Bax、E-cadherin和p62的表达下调(均P<0.05),自噬流增强(P<0.05)。与缺氧外泌体组相比,缺氧外泌体+3-MA组Huh7细胞增殖、迁移和上皮间质转化作用减弱(P<0.05),PCNA、cyclin D1、N-cadherin、Vimentin、Beclin1、LC3-Ⅱ的表达下调(P<0.05),Bax、E-cadherin和p62的表达上调(P<0.05)。结论缺氧诱导的外泌体可以参与细胞自噬的发生进而促进肝癌进展。
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关键词
肝细胞癌
外泌体
缺氧
自噬
自噬流
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职称材料
基于支架式教学模式的初中物理课堂教学设计
3
作者
童堃
《当代教研论丛》
2015年第12期18-19,共2页
物理是一门严密的,有公理化逻辑体系的科学理论,对于大部分学生来说,物理是一门相对困难的科目,需要用清晰的逻辑来理解消化,它对学生的抽象思维能力提出了较高的要求。为促进学生物理学习质量及效率的不断提高,教师可以采用支架式教学...
物理是一门严密的,有公理化逻辑体系的科学理论,对于大部分学生来说,物理是一门相对困难的科目,需要用清晰的逻辑来理解消化,它对学生的抽象思维能力提出了较高的要求。为促进学生物理学习质量及效率的不断提高,教师可以采用支架式教学模式来进行课堂教学设计,为学生营造一种良好的教学氛围。
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关键词
支架式教学模式
初中物理课堂
教学设计
相关探讨
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职称材料
题名
水稻组蛋白H1三突变体的创建和转录组学分析
1
作者
杨淇
魏子迪
宋娟
童堃
杨柳
王佳涵
刘海燕
栾维江
马轩
机构
天津师范大学生命科学学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期85-96,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31871321)
天津市研究生科研创新项目(2022SKY244)。
文摘
【目的】组蛋白H1对于染色质高级结构的维持和稳定具有重要作用,研究水稻H1对基因表达的影响,为深入理解水稻H1的生物学调控功能提供依据。【方法】通过半定量RT-PCR与RT-qPCR对水稻4个H1基因进行表达分析,利用CRISPR技术创建水稻H1基因编辑植株,鉴定突变体表型,对突变体进行转录组学分析。【结果】水稻4个H1基因的表达比较广谱,在根中的表达较低;在T_(0)代CRISPR突变体筛选过程中发现H1.1-H1.4发生多种突变;在T_(1)代筛选到一株Osh1.1 Osh1.3 Osh1.4纯合三突变体,该三突变体具有多种发育缺陷,成为转录组分析的材料;进一步在T_(2)代得到三突和四突群体,该群体约25%为白化苗,植株生长迟缓,在响应干旱胁迫方面发生缺陷;对三突变体进行转录组学分析,鉴定到1055个差异表达基因,显著上调的基因约为下调基因的2.5倍,说明H1可能具有抑制基因表达的功能。【结论】在突变体中,光合作用、胁迫响应、氨基酸代谢和RNA代谢等多种途径均发生调控紊乱;其中,核糖体蛋白和光合作用相关基因显著上调,与干旱胁迫相关的脱氢酶基因显著下调。核糖体途径基因过量表达可能造成蛋白质稳态失调,导致植物发育缺陷。
关键词
水稻
组蛋白H1
CRISPR
转录组测序
RT-QPCR
Keywords
rice
histone H1
CRISPR
transcriptome sequencing
RT-qPCR
分类号
S511 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
缺氧诱导的外泌体活化自噬促进肝癌进展
2
作者
王坪锋
胡培
童堃
童尧尧
李莹
严世荣
机构
湖北医药学院湖北省胚胎干细胞研究重点实验室
湖北医药学院生物医学工程学院
湖北医药学院附属太和医院检验科
长江大学附属黄冈市中心医院检验科
长江航运总医院检验科
湖北医药学院药学院湖北省武当地方中药研究重点实验室
出处
《山西医科大学学报》
CAS
2023年第8期1019-1028,共10页
基金
湖北省自然科学基金项目(2020CFB235)
陈孝平基金肝胆胰恶性肿瘤研究计划项目(CXPJJH1200001-2020340)。
文摘
目的探讨缺氧诱导的外泌体对肝癌进展的调节作用及其机制。方法将Huh7细胞置于0.1%O_(2)培养箱培养24 h作为缺氧组,另设常氧组,提取外泌体,纳米追踪技术检测外泌体的浓度和粒径大小,免疫印迹检测HSP70、Alix、CD63的表达。将Huh7细胞分为对照组(PBS)、常氧外泌体组(20μg/ml常氧外泌体)、缺氧外泌体组(20μg/ml缺氧外泌体),实时无标记细胞分析仪(real-time cell analysis,RTCA)实验检测细胞增殖,划痕实验检测细胞迁移,免疫印记检测细胞PCNA、cyclin D1、Bax、E-cadherin、N-cadherin、Vimentin、Beclin1、LC3、p62的表达,激光共聚焦检测自噬流的改变。Huh7细胞分为对照组(PBS)、缺氧外泌体组(20μg/ml缺氧外泌体)、缺氧外泌体+3-MA组(5 mmol/L 3-甲基腺嘌呤+1 h后20μg/ml缺氧外泌体),检测细胞增殖、迁移和相关蛋白的表达。结果与常氧组相比,缺氧组外泌体浓度增加,但外泌体粒径的大小没有明显变化,缺氧组外泌体标记蛋白HSP70、Alix、CD63的表达增加(P<0.05)。与常氧外泌体组相比,缺氧外泌体组Huh7细胞增殖和迁移能力增强(均P<0.05),PCNA、cyclin D1、N-cadherin、Vimentin、Beclin1、LC3-Ⅱ的表达上调,Bax、E-cadherin和p62的表达下调(均P<0.05),自噬流增强(P<0.05)。与缺氧外泌体组相比,缺氧外泌体+3-MA组Huh7细胞增殖、迁移和上皮间质转化作用减弱(P<0.05),PCNA、cyclin D1、N-cadherin、Vimentin、Beclin1、LC3-Ⅱ的表达下调(P<0.05),Bax、E-cadherin和p62的表达上调(P<0.05)。结论缺氧诱导的外泌体可以参与细胞自噬的发生进而促进肝癌进展。
关键词
肝细胞癌
外泌体
缺氧
自噬
自噬流
Keywords
hepatocellular carcinoma
exosome
hypoxia
autophagy
autophagy flux
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于支架式教学模式的初中物理课堂教学设计
3
作者
童堃
机构
南平市建阳区第二中学
出处
《当代教研论丛》
2015年第12期18-19,共2页
文摘
物理是一门严密的,有公理化逻辑体系的科学理论,对于大部分学生来说,物理是一门相对困难的科目,需要用清晰的逻辑来理解消化,它对学生的抽象思维能力提出了较高的要求。为促进学生物理学习质量及效率的不断提高,教师可以采用支架式教学模式来进行课堂教学设计,为学生营造一种良好的教学氛围。
关键词
支架式教学模式
初中物理课堂
教学设计
相关探讨
分类号
G633.7 [文化科学—教育学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻组蛋白H1三突变体的创建和转录组学分析
杨淇
魏子迪
宋娟
童堃
杨柳
王佳涵
刘海燕
栾维江
马轩
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
缺氧诱导的外泌体活化自噬促进肝癌进展
王坪锋
胡培
童堃
童尧尧
李莹
严世荣
《山西医科大学学报》
CAS
2023
0
下载PDF
职称材料
3
基于支架式教学模式的初中物理课堂教学设计
童堃
《当代教研论丛》
2015
0
下载PDF
职称材料
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