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基于公共数据库综合分析转录因子19在胰腺癌中的表达与预后作用
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作者 余志龙 童山石 姜可伟 《腹部外科》 2022年第5期317-324,共8页
目的探究转录因子19(transcription factor 19,TCF19)在胰腺癌中的表达及临床意义,并构建相关预后模型。方法利用Oncomine与GEPIA数据库提取数据并分析TCF19在正常胰腺组织与胰腺腺癌中的表达差异;利用GEPIA与Kaplan-Meier plotter数据... 目的探究转录因子19(transcription factor 19,TCF19)在胰腺癌中的表达及临床意义,并构建相关预后模型。方法利用Oncomine与GEPIA数据库提取数据并分析TCF19在正常胰腺组织与胰腺腺癌中的表达差异;利用GEPIA与Kaplan-Meier plotter数据库分析TCF19的表达水平与胰腺腺癌病人预后之间的相关性;利用MethSurv数据库分析TCF19基因甲基化位点在胰腺腺癌中的分布情况;利用TISIDB与TIMER数据库分析在胰腺腺癌中TCF19是否与肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infiltrating lymphocytes,TIL)、免疫调节剂、趋化因子、免疫浸润细胞等相关;利用R统计软件进行单因素Cox、LASSO回归分析与多因素Cox回归分析构建预后预测模型,并在验证组中进行验证。结果Oncomine与GEPIA显示,胰腺腺癌中TCF19的表达水平明显高于正常组织(P<0.05);运用Kaplan-Meier生存分析发现,胰腺腺癌中高表达TCF19病人较低表达TCF19病人预后差;MethSurv数据库鉴定得到11个TCF19甲基化位点与预后相关;TISIDB和TIMER数据库挖掘发现TCF19与TIL、免疫调节剂、趋化因子和免疫浸润细胞相关;利用R软件鉴定得到4个与TCF19相关基因(ANLN、FAM111B、DLGAP5、CEP55)并构建预后模型,该模型在训练组与验证组中均具有良好的预测能力。结论TCF19基因在胰腺癌中高表达,与病人不良预后有关。TCF19相关基因预后模型能很好地评估、预测胰腺癌病人的预后。 展开更多
关键词 转录因子19 胰腺癌 预后模型 癌症基因图谱数据库
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从进化论视角看胆道肿瘤的综合治疗
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作者 童山石 刘颖斌 《肿瘤》 CAS 北大核心 2023年第2期114-121,共8页
胆道肿瘤是一类恶性程度极高的消化系统肿瘤,虽然手术治疗、化疗和靶向治疗已经取得了良好的治疗效果,但是由于其复杂的生物学特性和易产生耐药性,导致其复发率仍然较高。在地球上曾出现过的物种中,超过99.9%的物种都已灭绝,这些物种拥... 胆道肿瘤是一类恶性程度极高的消化系统肿瘤,虽然手术治疗、化疗和靶向治疗已经取得了良好的治疗效果,但是由于其复杂的生物学特性和易产生耐药性,导致其复发率仍然较高。在地球上曾出现过的物种中,超过99.9%的物种都已灭绝,这些物种拥有和肿瘤细胞类似的对外界选择压力的抵抗能力。因此,从自然进化与物种灭绝的视角看胆道肿瘤的综合治疗,将物种灭绝的原因与现有的肿瘤治疗方案类比,有望为其基础与临床研究提供新思路。 展开更多
关键词 胆囊癌 进化论 物种灭绝
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真核翻译起始因子4γ1通过哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路促进胰腺癌细胞增殖的机制
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作者 童山石 李一鸣 +2 位作者 刘元鼎 李茂岚 刘颖斌 《中华实验外科杂志》 CAS 北大核心 2023年第1期14-17,共4页
目的检测真核翻译起始因子4γ1(EIF4G1)在胰腺癌中的表达,并探究其促进胰腺癌细胞增殖的相关机制。方法利用在线数据库分析EIF4G1在肿瘤中的表达量与预后意义;实时荧光定量聚合酶链式反应检测人胰腺癌细胞系的EIF4G1表达水平。慢病毒转... 目的检测真核翻译起始因子4γ1(EIF4G1)在胰腺癌中的表达,并探究其促进胰腺癌细胞增殖的相关机制。方法利用在线数据库分析EIF4G1在肿瘤中的表达量与预后意义;实时荧光定量聚合酶链式反应检测人胰腺癌细胞系的EIF4G1表达水平。慢病毒转染构建EIF4G1低表达细胞系,分别为敲减#1,敲减#2与对照;慢病毒转染构建EIF4G1过表达细胞系,为过表达与空载;细胞计数试剂盒(CCK-8)实验与克隆形成实验检测胰腺癌的增殖能力;蛋白印迹法检测EIF4G1敲减后哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号(mTOR)通路的变化,组间比较选择t检验。结果多个数据库显示EIF4G1在胰腺癌中表达量升高,与胰腺癌的不良预后有关;低表达组PANC-1在第5天的吸光度显著低于对照组(0.85±0.03、0.92±0.05比1.35±0.04,t=22.160、14.670,P<0.01);低表达组PA-TU-8988T在第5天的吸光度显著低于对照组(1.00±0.05、0.99±0.04比1.99±0.07,t=26.740、29.390,P<0.01);低表达组PANC-1的克隆形成数目著低于对照组(91.00±7.55、107.00±7.00比147.70±21.83,t=4.250、3.070,P<0.05),低表达组PA-TU-8988T的克隆形成数目著低于对照组(137.00±16.09、147.30±13.50比222.70±18.50,t=6.050、5.700,P<0.01);过表达组MIA PaCa-2在第5天的吸光度显著高于对照组(1.55±0.14比1.21±0.10,t=4.360,P<0.01);过表达组BxPC-3在第5天的吸光度显著高于对照组(1.03±0.01比0.69±0.07,t=10.840,P<0.01);过表达组MIA PaCa-2的克隆形成数目显著高于对照组(127.30±14.57比81.33±10.26,t=4.470,P<0.05);过表达组BxPC-3的克隆形成数目显著高于对照组(105.70±13.58比47.00±7.55,t=6.540,P<0.01)。低表达组PANC-1细胞的p-mTOR含量低于对照组PANC-1细胞(1.00±0.12比0.55±0.19、0.54±0.19,t=3.480、3.450,P<0.05);低表达组PA-TU-8988T细胞的p-mTOR含量低于对照组PA-TU-8988T细胞(1.00±0.05比0.57±0.14、0.49±0.09,t=5.140、8.410,P<0.01)。结论EIF4G1在胰腺癌中上调,可能通过mTOR通路促进胰腺癌的增殖。 展开更多
关键词 胰腺癌 真核翻译起始因子4γ1 哺乳动物雷帕霉素靶蛋白 增殖
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中国胆囊癌外科治疗现状与病理学特征多中心回顾性研究(附4345例报告) 被引量:5
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作者 孙旭恒 任泰 +81 位作者 耿亚军 杨佳华 李永盛 刘法涛 李茂岚 吴向嵩 吴文广 刘赟 王许安 陈炜 李可为 陈涛 何敏 王辉 杨林华 姜皓 许鑫森 王贵阳 邱世梅 蒋程恺 边睿 宋晓玲 李洋 李雪川 李霖 刘立果 杨洋 王泽宇 王子逸 邹路 刘珂 李国强 苗慧洁 严思远 崔旭雅 杨波 张凌宵 颜伟康 央茂 童山石 李一鸣 刘照南 龚伟 董平 王雪峰 顾钧 黄雯 束翌俊 包润发 张飞 邵子雨 袁瑞研 钱叶本 费哲为 顾剑峰 朱春富 姜小清 马强 张学利 刘昌军 孙备 崔云甫 李兵 曹宏 王昆华 郑林辉 蔡鸿宇 曹景玉 刘军 张再洋 党学义 王益 王旭林 金慧涵 王雷 张启瑜 周蒙滔 刘昌 戴朝六 全志伟 彭淑牖 刘颖斌 《中国实用外科杂志》 CSCD 北大核心 2021年第1期99-106,共8页
目的探讨中国胆囊癌病人的外科治疗模式、病理学特征和预后。方法收集中国13个省市的26家医院自2010年1月至2017年12月收治的4345例胆囊癌病人临床资料,分析中国胆囊癌病人的地区、性别、年龄分布;基于病人的诊疗记录与检查结果对手术... 目的探讨中国胆囊癌病人的外科治疗模式、病理学特征和预后。方法收集中国13个省市的26家医院自2010年1月至2017年12月收治的4345例胆囊癌病人临床资料,分析中国胆囊癌病人的地区、性别、年龄分布;基于病人的诊疗记录与检查结果对手术病人肿瘤的可切除性进行评估,分析可切除性肿瘤病人的外科治疗模式,参照术前检查、手术记录和术后病理学检查结果评估可切除性肿瘤手术治疗是否达到根治标准,分析行根治性手术胆囊癌病人的病理学特征。结果4345例胆囊癌病人中,男性1664例(38.23%),女性2681例(61.77%)。行外科手术治疗的病人3129例(71.01%),其中可切除性肿瘤2074例(66.28%)。在可切除性肿瘤2074例病人中,仅1133例(54.63%)在术前即诊断为胆囊恶性肿瘤,1002例(48.31%)行根治性切除,1072例(51.69%)未达根治标准。胆囊癌根治性切除病人的病理学检查结果中,736例(73.45%)为腺癌,348例(34.73%)为低分化癌,376例(37.52%)伴肝侵犯,152例(15.17%)伴神经浸润,96例(9.58%)伴血管内癌栓,78例(7.78%)伴周围脂肪组织浸润,89例(8.88%)伴周围器官受累,328例(32.73%)活体组织病理学检查淋巴结阳性。获得生存随访资料的2357例手术治疗病人术后中位生存期为16.17个月,多因素Cox回归生存分析结果显示肿瘤TNM分期(P<0.001)、肿瘤分化程度(P<0.001)、肝脏侵犯(P<0.001)、R0切除(P=0.003)均为术后生存期的独立预后因素。结论中国胆囊癌术前诊断率有待提高;胆囊癌外科治疗模式亟待规范;病理学检查报告中反映的多个因素与胆囊癌病人预后密切相关,其描述的规范化对指导胆囊癌病人的精准治疗有重要意义。 展开更多
关键词 胆囊恶性肿瘤 外科治疗 病理特征 预后
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加热灭活及4 ℃储存对血浆新型冠状病毒总抗体稳定性影响的研究 被引量:3
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作者 李爱敏 于思洋 +8 位作者 董晓宇 童山石 林宝月 彭译漫 陈晓杭 张丽婷 张明霞 张政 魏兰兰 《国际免疫学杂志》 CAS 2021年第5期493-499,共7页
目的探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染患者的血液标本经不同灭活和储存处理后,SARS-CoV-2总抗体稳定性的变化,从而论证以56℃,60 min加热作为患者血液标本安全有效的... 目的探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染患者的血液标本经不同灭活和储存处理后,SARS-CoV-2总抗体稳定性的变化,从而论证以56℃,60 min加热作为患者血液标本安全有效的灭活方法的可行性。方法选取2020年2月24日至2020年3月30日深圳市第三人民医院收治的47例2019新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)确诊患者,另外选取同期因其他疾病入院的已排除患有COVID-19可能的33例住院患者。抽取两组研究对象的肘静脉乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)抗凝血液,应用化学发光微粒子免疫检测法检测56℃,30 min灭活前后和60 min灭活前后血浆SARS-CoV-2总抗体水平,并在指定时间点检测SARS-CoV-2总抗体,进一步比较不同灭活处理方式及不同储存时间对SARS-CoV-2总抗体的影响。结果56℃,30 min灭活前后和60 min灭活前后,血浆样本中SARS-CoV-2总抗体检测阳性结果一致率分别为96.15%和100%,灭活前后总抗体样本临界指数(cut-off index,COI)值的Pearson相关系数分别为0.9965(95%CI:0.9920~0.9984,P<0.05)和0.9981(95%CI:0.9962~0.9990,P<0.05)。血浆样本经先离心再灭活处理与先灭活再离心处理,SARS-CoV-2总抗体阳性结果一致率为100%,两组总抗体COI值的Pearson相关系数为0.9995(95%CI:0.9950~0.9999,P<0.05)。未灭活样本4℃储存30 d;56℃,30 min或60 min灭活样本4℃储存10 d,SARS-CoV-2总抗体COI值均未出现显著性变化。结论56℃,30 min或60 min灭活处理血浆样本及灭活后4℃储存10 d,未灭活4℃储存30 d均不会对SARS-CoV-2总抗体的检测结果造成影响。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 抗体稳定性 病毒灭活 离心 储存时间
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几丁质酶3样1蛋白在胃癌组织的表达及其临床意义 被引量:3
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作者 余志龙 童山石 姜可伟 《中华实验外科杂志》 CAS 北大核心 2022年第2期215-219,共5页
目的通过生物信息学探讨几丁质酶3样1蛋白(CHI3L1)在胃癌中的作用及其临床意义。方法利用Oncomine、基因表达谱交互分析(GEPIA)和Kaplan-Meier Plotter等数据库探讨CHI3L1在胃癌中的表达及其与患者生存之间的关系。利用Methsurv数据库分... 目的通过生物信息学探讨几丁质酶3样1蛋白(CHI3L1)在胃癌中的作用及其临床意义。方法利用Oncomine、基因表达谱交互分析(GEPIA)和Kaplan-Meier Plotter等数据库探讨CHI3L1在胃癌中的表达及其与患者生存之间的关系。利用Methsurv数据库分析CHI3L1启动子和CpG位点甲基化水平及其与胃癌临床病理特征的相关性。通过LinkedOmics分析胃癌中CHI3L1共表达网络并进行基因本体和京都基因(GO)和基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过分析肿瘤免疫估计资源(TIMER)和肿瘤免疫系统交互数据库(TISIDB)数据库探讨CHI3L1与胃癌免疫浸润之间的关联。体外实验使用细胞计数试剂盒(CCK-8)、Transwell、蛋白质印迹法(Western blot)等方法进一步验证CHI3L1在胃癌中的生物学功能。结果 Oncomine数据库和GEPIA数据库均示CHI3L1在癌组织的表达水平高于正常组织(P<0.05), Kaplan-Meier Plotter数据库也显示CHI3L1表达在胃癌组织中显著增高(P<0.05)并与较低的总体生存率相关(P<0.01)。胃癌组织中CHI3L1的启动子和大部分CpG位点(cg19081101、cg04361579和cg14085262)甲基化水平显着高于正常组织且与患者的生存明显相关。GO和KEGG分析显示CHI3L1共表达相关性较高的前50个基因主要参与免疫反应与代谢调节。在免疫浸润方面, 胃癌患者肿瘤组织中CHI3L1表达与CD8+细胞、B淋巴细胞、树突状细胞和嗜中性粒细胞浸润显著相关。在体外实验中, CHI3L1不仅被证明作为癌基因促进细胞增殖和转移, 且促进PD-L1的表达。结论 CHI3L1的表达上调和甲基化突变位点可能有助于预测胃癌患者的不良预后, CHI3L1能够调控胃癌免疫抑制微环境。 展开更多
关键词 胃癌 生物信息学 免疫
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酪氨酸激酶受体信号通路在胆囊癌发生发展与靶向治疗中作用的研究进展
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作者 童山石 刘颖斌 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第48期3891-3894,共4页
胆囊癌是恶性程度最高的胆道系统肿瘤,预后差。酪氨酸激酶受体(ErbB)信号通路是胆囊癌研究中最为深入的信号通路之一,与胆囊癌的发生发展、转移与耐药等恶性生物学行为密切相关。部分针对ErbB信号通路的靶向治疗药物在胆囊癌的临床试验... 胆囊癌是恶性程度最高的胆道系统肿瘤,预后差。酪氨酸激酶受体(ErbB)信号通路是胆囊癌研究中最为深入的信号通路之一,与胆囊癌的发生发展、转移与耐药等恶性生物学行为密切相关。部分针对ErbB信号通路的靶向治疗药物在胆囊癌的临床试验中展现出良好的治疗效果。本文就近年来ErbB信号通路在胆囊癌中的研究新进展与靶向治疗新理念作一综述。 展开更多
关键词 胆囊癌 ERBB 靶向治疗
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