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X射线衍射晶体法解析脱卤酶DehDIV-R结构的研究
被引量:
1
1
作者
童超迪
吴坚平
+1 位作者
杨立荣
徐刚
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期19-25,共7页
R-2-卤代酸脱卤酶能立体选择性水解R-2-卤代酸。解析酶的单晶结构对提高酶的选择性和活性提供了直接的结构指导,是目前酶结构领域研究的前沿。以实验室前期得到的来自假单胞菌ZJU26的R-2-氯丙酸脱卤酶(Deh DIV-R)为研究对象,采用X射...
R-2-卤代酸脱卤酶能立体选择性水解R-2-卤代酸。解析酶的单晶结构对提高酶的选择性和活性提供了直接的结构指导,是目前酶结构领域研究的前沿。以实验室前期得到的来自假单胞菌ZJU26的R-2-氯丙酸脱卤酶(Deh DIV-R)为研究对象,采用X射线衍射晶体法进行结构解析。采用pp SUMO载体融合表达Deh DIV-R蛋白,依次通过Ni-NTA亲和层析、透析酶切、二次NiNTA亲和层析以及凝胶过滤层析纯化得到单一条带,且均一性好的蛋白。接着对结晶条件进行初筛与优化,得到的最佳结晶条件为0.1mol/L HEPES p H 7,12%PEG 6 000,0.2mol/L Mg Cl2,8mmol/L CHAPS。晶体在上海同步辐射光源BL18U1线站上收集衍射数据,采用分子置换法成功解析获得了分辨率为2.35的Deh DIV-R的晶体结构。Ramachandran图表明98.02%的氨基酸位于最适区,证明了该结构的合理性。Deh DIV-R的纯化、结晶以及结构解析为进一步深入了解其结构和功能奠定了基础。
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关键词
R-2-卤代酸脱卤酶
纯化
结晶
X射线衍射
原文传递
题名
X射线衍射晶体法解析脱卤酶DehDIV-R结构的研究
被引量:
1
1
作者
童超迪
吴坚平
杨立荣
徐刚
机构
浙江大学化学工程与生物工程学院
出处
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期19-25,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(21076187)
国家973计划(2011CB710800)资助项目
文摘
R-2-卤代酸脱卤酶能立体选择性水解R-2-卤代酸。解析酶的单晶结构对提高酶的选择性和活性提供了直接的结构指导,是目前酶结构领域研究的前沿。以实验室前期得到的来自假单胞菌ZJU26的R-2-氯丙酸脱卤酶(Deh DIV-R)为研究对象,采用X射线衍射晶体法进行结构解析。采用pp SUMO载体融合表达Deh DIV-R蛋白,依次通过Ni-NTA亲和层析、透析酶切、二次NiNTA亲和层析以及凝胶过滤层析纯化得到单一条带,且均一性好的蛋白。接着对结晶条件进行初筛与优化,得到的最佳结晶条件为0.1mol/L HEPES p H 7,12%PEG 6 000,0.2mol/L Mg Cl2,8mmol/L CHAPS。晶体在上海同步辐射光源BL18U1线站上收集衍射数据,采用分子置换法成功解析获得了分辨率为2.35的Deh DIV-R的晶体结构。Ramachandran图表明98.02%的氨基酸位于最适区,证明了该结构的合理性。Deh DIV-R的纯化、结晶以及结构解析为进一步深入了解其结构和功能奠定了基础。
关键词
R-2-卤代酸脱卤酶
纯化
结晶
X射线衍射
Keywords
R-2-haloacid dehalogenase
Purification
Crystallization
X-ray diffraction
分类号
Q814 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
X射线衍射晶体法解析脱卤酶DehDIV-R结构的研究
童超迪
吴坚平
杨立荣
徐刚
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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