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武汉市市售淡水小龙虾中副溶血性弧菌的分离鉴定及多位点序列分型
被引量:
6
1
作者
周颖
高耿
+3 位作者
李智
竺倩
宋颖颉
李锦铨
《湖北农业科学》
2015年第18期4548-4551,4559,共5页
采集武汉市各大农贸市场52份小龙虾(即克氏原螯虾,Procambarus clarkii)样品,利用1%氯化钠碱性蛋白胨水(APW)和TCBS对小龙虾样品中副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)进行分离和初步鉴定,用PCR扩增副溶血性弧菌具有种特异性的tl基...
采集武汉市各大农贸市场52份小龙虾(即克氏原螯虾,Procambarus clarkii)样品,利用1%氯化钠碱性蛋白胨水(APW)和TCBS对小龙虾样品中副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)进行分离和初步鉴定,用PCR扩增副溶血性弧菌具有种特异性的tl基因来验证疑似菌株。PCR检测方法共检出14株副溶血性弧菌,检出率为26.92%。在小龙虾中分离得到的14株副溶血性弧菌,对其进行基于dna E-gyr Brec A-dtd S-pnt A-pyr C-tna A的多位点序列分型。其中dtd S的多态性位点比例均高于其他6个基因,为5.2%。7个基因串联后将14株副溶血性弧菌分为12个序列型,其中7株序列型未知,分辨力达0.967。可知武汉市市售淡水小龙虾中副溶血性弧菌呈现出较大的多样性。Neighbor-joining系统进化树将分离得到的14株副溶血性弧菌分为2个群,VP2、VP13、VP7和VP14同属一个群,其他10株则属于另外一个群。其中VP13和已知的临床分离株ST3在进化树上表现出较高的亲缘性(69%)。
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关键词
副溶血性弧菌(Vibrio
parahaemolyticus)
小龙虾(Procambarus
clarkii)
多位点序列分型
系统进化树
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职称材料
题名
武汉市市售淡水小龙虾中副溶血性弧菌的分离鉴定及多位点序列分型
被引量:
6
1
作者
周颖
高耿
李智
竺倩
宋颖颉
李锦铨
机构
华中农业大学食品科技学院
出处
《湖北农业科学》
2015年第18期4548-4551,4559,共5页
基金
全国大学生创新创业训练计划项目(201410504059)
湖北省自然科学基金项目(2015CKC901)
863计划项目(2012AA101601)
文摘
采集武汉市各大农贸市场52份小龙虾(即克氏原螯虾,Procambarus clarkii)样品,利用1%氯化钠碱性蛋白胨水(APW)和TCBS对小龙虾样品中副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)进行分离和初步鉴定,用PCR扩增副溶血性弧菌具有种特异性的tl基因来验证疑似菌株。PCR检测方法共检出14株副溶血性弧菌,检出率为26.92%。在小龙虾中分离得到的14株副溶血性弧菌,对其进行基于dna E-gyr Brec A-dtd S-pnt A-pyr C-tna A的多位点序列分型。其中dtd S的多态性位点比例均高于其他6个基因,为5.2%。7个基因串联后将14株副溶血性弧菌分为12个序列型,其中7株序列型未知,分辨力达0.967。可知武汉市市售淡水小龙虾中副溶血性弧菌呈现出较大的多样性。Neighbor-joining系统进化树将分离得到的14株副溶血性弧菌分为2个群,VP2、VP13、VP7和VP14同属一个群,其他10株则属于另外一个群。其中VP13和已知的临床分离株ST3在进化树上表现出较高的亲缘性(69%)。
关键词
副溶血性弧菌(Vibrio
parahaemolyticus)
小龙虾(Procambarus
clarkii)
多位点序列分型
系统进化树
Keywords
Vibrio parahaemolyticus
Cambarus clarkii
multilocus sequence typing
phylogenetic tree
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
S966.12 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
武汉市市售淡水小龙虾中副溶血性弧菌的分离鉴定及多位点序列分型
周颖
高耿
李智
竺倩
宋颖颉
李锦铨
《湖北农业科学》
2015
6
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