机器学习在新型冠状病毒感染诊疗中的应用研究进展

新型冠状病毒感染(COVID-19)暴发以来,机器学习被广泛应用于其流行趋势的预测、高风险人群的筛查与追踪、早期诊断与监护等,显著提高了疫情期间信息的处理效率,为临床医师提供了高效的决策支持,但因用于开发模型的数据类型与规模、训练方法等不同,执行诊断或预后任务的模型存在不同的局限性。本文从机器学习结合影像资料、实验室检查结果,以及整合这两部分数据所训练的模型综述机器学习在COVID-19诊断与预后中的应用,以期为机器学习的训练与应用提供更贴合实践的思路。

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌对喹诺酮类药物的耐药特性及机制研究

背景 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)对喹诺酮类药物的耐药机制及对新一代喹诺酮类药物西他沙星的耐药特性目前国内未见相关研究。目的 研究CRKP对喹诺酮类药物的耐药特性及耐药机制。方法 收集解放军总医院临床分离非重复耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌29株,采用微量肉汤稀释法检测CRKP对喹诺酮类药物的敏感度及外排泵抑制剂对CRKP耐药性的影响;通过棋盘法检测西他沙星联合其他抗菌药物对CRKP的体外抗菌活性;采用Sanger测序检测喹诺酮耐药决定区(quinolone resistance determining region,QRDR)突变;全基因组测序检测质粒介导的喹诺酮耐药基因(plasmid mediated quinolone resistance,PMQR)、外排泵、多位点序列分型等分子病原学特征。结果 29株CRKP对西他沙星、莫西沙星、环丙沙星的耐药率分别为90%、93%、93%,西他沙星MIC50值是莫西沙星的4倍、环丙沙星的8倍。西他沙星对blaKPC、blaNDM、blaOXA-48阳性的CRKP的敏感度分别为4.7%、66.6%、0。联合药敏结果表明西他沙星与黏菌素、依拉环素、替加环素联合用药对CRKP的协同、部分协同及相加作用分别为70%、20%、6%。blaKPC、blaNDM、blaOXA-48阳性的CRKP的QRDR突变率分别为95%、0、100%;质粒介导的PMQR携带率为83%;RND家族外排泵在CRKP菌株中普遍携带,外排泵抑制剂使CRKP对西他沙星的敏感度由10%上升至83%,耐药率由90%降至7%。解放军总医院优势传播菌株为ST11型blaKPC-2阳性菌株。结论 CRKP对喹诺酮类药物耐药率高,西他沙星与黏菌素的协同效果最好。QRDR突变和外排泵过表达是CRKP对喹诺酮类药物主要的耐药机制,产NDM酶CRKP的QRDR未见突变并且对喹诺酮类药物敏感性较好;ST11型blaKPC-2阳性菌株是解放军总医院优势流行菌株。

临床产多种β-内酰胺酶大肠埃希菌的生物学研究

目的对临床分离出产多种β-内酰胺酶的大肠埃希菌,进行生物学以及耐药特性研究。方法用三维试验、等电聚焦以及酶抑制试验以及接合试验,对临床分离的1株对多种β-内酰胺类抗生素高度耐药的大肠埃希菌进行分析,用E-TEST法进行最小抑菌浓度(MIC)测定。结果该菌株三维试验为阳性显示高产AmpC酶,等电聚焦以及酶抑制试验表明,该菌株能够产3种等电点(PI)分别为5.4、8.2及9.0的β-内酰胺酶,等电点为9.0的β-内酰胺酶能够被氯唑西林抑制,而不能被克拉维酸抑制;等电点为8.2和5.4的β内酰胺酶能够被克拉维酸抑制而不能被氯唑西林抑制,而且接合实验表明这两种酶的特性可以被转移到受体菌;检测表明该菌株对环丙沙星、阿米卡星、青霉素类、酶抑制剂合剂、三代头孢菌素类甚至头孢吡肟耐药,但对碳青酶烯类的亚胺培南和伊他培南均敏感。结论我院临床分离大肠埃希菌中已经出现同时产AmpC、ESBLs等多种广谱β内酰胺酶的菌株,并造成对多种三代头孢菌素及头孢西丁耐药,对临床的抗生素治疗带来严重威胁。

临床产ESBLs细菌耐药特性及其基因分型的研究

目的 了解并研究产超广谱 β-内酰胺酶 (ESBL s)细菌流行及耐药特点 ,应用聚合酶链反应(PCR)对产 ESBL s细菌进行初步分型。方法 先后用 nitrocefin及纸片扩散初筛法、纸片扩散确认法从临床分离的肺炎克雷伯氏菌及大肠埃希氏菌中检测产 ESBL s菌株 ,用微量稀释法测定不同类抗生素对产 ESBL s菌株的 MIC值 ,并用聚合酶链反应对 ESBL s基因进行初步分型。结果 我院临床分离肺炎克雷伯氏菌产ESBL s率为 16 .7%、大肠埃希氏菌产 ESBL s率为 12 .4%。产 ESBL s细菌对青霉素类及第三代头孢菌素类耐药率约为 70 %～ 10 0 % ,加用酶抑制剂后它们的耐药率降为 2 %～ 6 0 %。它们对磺胺甲口恶唑 /甲氧苄氨嘧啶、环丙沙星及头孢吡肟的耐药率分别为 6 9.2 3%、5 6 .41%和 2 0 .5 1% ,但它们对阿米卡星的耐药率为 12 .82 %。而非典型 β-内酰胺类抗生素头孢西丁、头孢美唑及拉氧头孢对产 ESBL s菌株的敏感率分别为 94.88%、92 .32 %和 97.44 %。碳青霉烯类的亚胺培南和美罗培南表现了最高的敏感率未发现耐药菌株。 ESBL s对单独头孢哌酮的水解率为 43.93% ,而当结合了舒巴坦、克拉维酸及三唑巴坦时对头孢哌酮的水解率分别下降为2 0 .91%、18.13%及 15 .2 7%。产 ESBL s肺炎克雷伯氏菌中产 SHV型、TEM型、SHV和

高产AmpC酶肺炎克雷伯菌的临床报道

的 对临床分离出的高产AmpC肺炎克雷伯菌分子生物学以及耐药特性进行研究。方法 对从临床分离的 1株头孢西丁高度耐药的肺炎克雷伯菌进行分析 ;用三维试验初步检测其高产AmpC ,然后用等电聚焦以及酶抑制试验等进行确认 ;用接合试验检验耐药基因的转移性 ,最后用E TEST法进行最小抑菌浓度 (MIC)测定。结果 该菌株三维试验为阳性 ,等电聚焦以及酶抑制试验表明 ,该菌株产一种等电点 (PI)为 7 8的能够被氯唑西林抑制而不能被克拉维酸抑制的 β 内酰胺酶 ;接合试验表明表达该 β 内酰胺酶的基因具有转移性 ,用E TEST法检测表明该菌株对环丙沙星、阿米卡星、青霉素类、酶抑制剂合剂及三代头孢菌素类均耐药 ,但它们对头孢吡肟、碳青酶烯类的亚胺培南和伊他培南均敏感。结论 我院临床分离肺炎克雷伯菌已经出现中高产AmpC菌株 ,其耐药性能够水平传播 ,并造成对多种三代头孢菌素及头孢西丁耐药 ,已经对临床的抗生素治疗带来重大威胁。

临床产ESBLs细菌耐药特性及其基因分型的研究

目的:了解并研究产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)细菌流行及耐药特点,应用聚合酶链反应(PCR)对产ESBLs细菌进行初步分型.方法:先后用头孢硝噻吩及纸片扩散初筛法、纸片扩散确认法从临床分离的肺炎克雷伯菌及大肠埃希氏菌中检测产ESBLs菌株,用微量稀释法测定不同类抗生素对产ESBLs菌株的MIC值,并用聚合酶链反应对ESBLs基因进行初步分型.结果:我院临床分离肺炎克雷伯菌产ESBLs率为16.7%、大肠埃希氏菌产ESBLs率为12.4%.产ESBLs细菌对青霉素类及三代头孢菌素类耐药率约为70%-100%.加用酶抑制剂后它们的耐药率降为2%-60%左右.它们对复方磺胺、环丙沙星及头孢吡肟的耐药率分别为:69.23%,56.41%和20.51%.但它们对阿米卡星的耐药率为12.82%.而非典型β-内酰胺类抗生素头孢西丁、头孢美唑及拉氧头孢对产ESBLs菌株的敏感率分别为94.88%,92.32%,和97.44%.碳青霉烯类的亚胺培南和美罗培南表现了最高的敏感率末发现耐药菌株.ESBLs对单独头孢哌酮的水解率为43.93%,而当结合了舒巴坦、克拉维酸及三唑巴坦时对头孢哌酮的水解率分别下降为20.91%,18.13%及15.27%.产ESBLs肺炎克雷伯菌中产SHV型,TEM型,及SHV和TEM型β-内酰胺酶基因的百分率依次为41.66%,8.33%和50%,而在大肠埃希氏菌中百分率依次为96.3%,0%和3.7%.结论产ESBLs细菌对青霉素、头孢菌素类耐药率较高,并对不同类抗生素有多重耐药的特点.它们对头孢霉素类及氧头孢烯类表现出相当高的敏感率;碳青霉烯类是对产ESBLs细菌最有效的药物.酶抑制剂对产ESBLs细菌的体外效果以头孢哌酮共同底物的情况下为三唑巴坦略优于克拉维酸,但二药都强于舒巴坦.产ESBLs细菌均携带SHV或TEM型β-内酰胺酶基因,其中大肠埃希氏菌绝大部分产TEM型β-内酰胺酶,而对于产ESBLs肺炎克雷伯菌则主要以产SHV型β-内酰胺酶为主.

自发性气胸的病因及发病机制

气胸是临床上常见的急症，而自发性气胸又为其中最常见类型。自发性气胸可分为原发性自发性气胸和继发性自发性气胸，虽然它们各自的病因不同，但大多数患者都能发现肺气肿疱的存在，肺气肿疱形成的研究正日益受到关注。同时随着肺结核、艾滋病的迅速传播及脏器移植的发展...

临床阴沟肠杆菌感染的分布与耐药特性研究

目的 调查我院临床分离阴沟肠杆菌的分布以及对临床常用抗菌药物的耐药性变化。方法 药物敏感性试验采用纸片扩散法，数据采用WHONET5．3软件分析。结果 2000-2004年间，我院共从临床标本中分离得到阴沟肠杆菌416株；标本主要分布于呼吸内科、外科监护病区、神经内科等科室，分别占25．2％、9．6％、8．6％；阴沟肠杆菌对头孢噻肟、头孢他啶、环丙沙星的耐药性5年间有不同程度的增加，阿米卡星、头孢吡肟对摘床分离阴沟肠杆菌有较好的抗菌活性，亚胺培南仍保持了较高的敏感率。结论 阴沟肠杆菌对临床常用抗菌药物具有高耐药率且多重耐药较为普遍，合理使用抗菌药物以降低耐药性是非常重要的。

维生素B6对利奈唑胺相关性血细胞减少影响的回顾性研究

目的观察维生素B6辅助治疗对利奈唑胺相关性红细胞、血小板减少的作用。方法采用回顾性分析,将利奈唑胺治疗的肺部感染患者38例,根据是否应用维生素B6,分为利奈唑胺组和联合用药组,研究维生素B6对红细胞和血小板的作用。结果利奈唑胺组的红细胞(RBC)、血红蛋白(Hb)、红细胞比积(Hct)及血小板(Plt)与用药前比较减低,差异有统计学意义(P<0.05);而联合用药组仅血小板计数有下降的趋势,其他指标差异无统计学意义(P>0.05)。结论维生素B6在预防利奈唑胺相关性红细胞和血小板减少方面有一定的作用,以红细胞更为明显。

产ESBLs并高产AmpC酶肺炎克雷伯氏杆菌中整合子的基因研究

目的 :观察 4株从临床分离产超广谱内 β内酰胺酶 (ESBLs)及AmpC酶肺炎克雷伯氏杆菌的多重耐药情况 ,分析其中整合子的存在 ,对整合子的特性进行研究 ,探讨整合子基因盒表达对肺炎克雷伯杆菌耐药表型的影响。方法 :采用微量稀释法测定复方新诺明等 15种抗菌药物对细菌的最低抑菌浓度 (MIC)。PCR技术检测整合子基因 ,DNA测序研究整合子插入耐药基因盒情况。结果 :这 4株菌对多种抗菌素耐药。其中 1株存在整合子 (扩增片段 2 0 0 0bp左右 ) ,携有dhfrXII和aadA2基因。结论 :4株菌中仅 1株存在整合子结构 ,尽管产ESBLs和AmpC酶基因未位于整合子的基因盒上 ,但整合子参与多重耐药的产生。

鲍曼不动杆菌产碳青霉烯酶对舒巴坦联合碳青霉烯抗生素协同作用的影响

背景临床上耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌检出率逐年上升。以往研究表明舒巴坦联合碳青霉烯类抗生素仅对部分耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)有协同作用,这种疗效差异是否与鲍曼不动杆菌产碳青霉烯酶情况有关,尚待阐明。目的研究耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌产β-内酰胺酶情况对舒巴坦联合碳青霉烯抗生素协同作用的影响,为临床应用这一联合用药方案提供依据。方法采用琼脂平板稀释法测定亚胺培南、美罗培南、头孢哌酮/舒巴坦、哌拉西林他唑巴坦、头孢他啶、氨苄西林舒巴坦等抗菌药物对源自全国13家教学医院肺炎患者下呼吸道标本的102株耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌的最低抑菌浓度(MIC),用棋盘法分别检测舒巴坦+美罗培南和舒巴坦+亚胺培南两种联合方案对耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌菌株的协同抗菌活性。应用等电聚焦电泳、PCR扩增和DNA测序分析耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌产生β-内酰胺酶的情况。结果美罗培南+舒巴坦、亚胺培南+舒巴坦两种联合方案协同效应[部分抑菌浓度指数(fractional inhibitory concentration index,FICI)≤0.5]的比例分别为21.57%和12.75%、相加效应(FICI>0.5,≤1)的比例分别为71.57%和84.31%,无关效应(FICI>1,≤4)的比例分别为6.86%和2.94%,没有菌株出现拮抗效应(FICI>4)。102株耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌全部产生OXA-23和OXA-51型碳青霉烯酶;其中19株同时产生OXA-58型碳青霉烯酶、13株同时产生GES-5型碳青霉烯酶;同时产生OXA-23、OXA-51和OXA-58碳青霉烯酶的CRAB中,舒巴坦和碳青霉烯抗生素联用产生协同效应的比例最高,达到了56.25%(9/16);在产GES-5型碳青霉烯酶的CRAB菌株中,舒巴坦与碳青霉烯抗生素联合未发现体外协同效应。结论舒巴坦+碳青霉烯两种联合方案对部分产OXA型碳青霉烯酶的鲍曼不动杆菌可以产生体外协同抗菌效应,对产酶模式为OXA-23+OXA-51+OXA-58的CRAB的协同抗菌比例较高,但对产GES-5型碳青霉烯酶的鲍曼不动杆菌未见协同抗菌效应。

1例化疗联合贝伐珠单抗治疗的肺腺癌患者的药学监护

1例54岁女性患者,因"左肺腺癌7个月余"入院,入院后给予多西他赛联合卡铂合并贝伐珠单抗化疗,同时给予抑制骨转移、止吐和护肝等对症治疗。化疗第2天,患者出现明显头晕,血压升高。下肢血管超声示静脉血栓栓塞,分别给予苯磺酸左旋氨氯地平降压、达肝素钠及华法林抗凝治疗。药师给予患者全程药学监护,通过查阅文献,结合患者病情,对治疗方案进行分析并详细药学问诊,考虑头晕及血栓栓塞与贝伐珠单抗有关。建议行动态血压监测,持续跟进降血压治疗、抗凝治疗,对患者进行详细用药教育。患者病情平稳后出院。建议临床在使用抗血管生成药物时应充分考虑患者血压升高和出血/高凝风险。

65株鲍曼不动杆菌的临床分布和耐药特征分析

目的分析鲍曼不动杆菌感染的耐药特征,为临床预防和治疗鲍曼不动杆菌感染提供实验依据。方法收集解放军总医院2007年5-6月收治的鲍曼不动杆菌感染患者的痰、血液、尿及创口分泌物等临床标本,应用琼脂稀释法测定鉴定为鲍曼不动杆菌标本的MIC值,分析耐药特征。结果分离到的65株鲍曼不动杆菌主要分布在呼吸科、外科重症监护室、急诊科,它们对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别达80%和90.8%,对替加环素的耐药率为9.2%,对多黏菌素均敏感。结论本次临床分离到的鲍曼不动杆菌为多药耐药不动杆菌,以耐碳青霉烯类(CRA)的多药耐药鲍曼不动杆菌为主,针对此时的MDRA临床感染,治疗上不推荐单药抗菌药物治疗。

门诊支气管哮喘患者就诊情况分析

目的:了解门诊支气管哮喘患者的就诊规律及用药情况等,以期为临床工作质量提高提供参考。方法:对我院呼吸科军人门诊2013年1月25日–5月31日期间就诊的132例支气管哮喘患者进行调查,采用询问病史和复习门诊病历的方法,将调查病例分为两组,一组为规律就诊组,另一组为非规律就诊组。调查内容包括:教育背景、就诊规律、治疗情况、哮喘知识教育、肺功能定期复查情况等。结果:76例患者不规律就诊,56例患者为规律就诊。不规律就诊组就诊的主要原因是喘憋加重等急性发作症状。132例患者中仅24.2%的患者定期接受肺功能检查,42.0%的患者接受过哮喘知识教育。不规律就诊组及规律就诊组本科以上学历分别占38.1%、73.2%。结论:门诊哮喘患者存在大部分非规律就诊以及肺功能定期检测率低等情况。加强医患交流及哮喘知识宣传教育对加强患者规律就诊及合理用药具有重要意义。

计算机辅助诊断系统在肺结节教学中的应用

目的:探讨计算机辅助诊断系统(computer-aided diagnosis,CAD)在肺结节教学中的应用价值。方法:选取2020年9-12月在本院呼吸与危重症医学部规培的临床型硕士研究生50名,根据随机法分为常规教学组(n=25)和CAD教学组(n=25)。常规教学组使用传统讲授教学法进行肺结节教学。CAD教学组将计算机辅助诊断系统融入常规肺结节教学。教学结束后进行肺结节考试(包括理论知识考试与实践病例考试),评估两组学生对肺结节特征描述准确率,结节良恶性判断准确率及治疗决策判断准确率。并通过不记名问卷调查方式,由学生进行学习效果及教学满意度评分。结果:常规教学组理论知识考试成绩(44.64±2.69)分,与CAD教学组的(45.08±2.43)分比较,差异无统计学意义(P>0.05);CAD教学组学生实践病例考试成绩(42.12±2.54)分,高于常规教学组的(30.40±2.35)分,差异有统计学意义(P<0.05)。CAD教学组学生对结节特征描述准确率,结节良恶性判断准确率及治疗决策判断准确率均高于常规教学组,差异有统计学意义(P<0.05)。CAD教学组学生学习效果及教学满意度评分高于常规教学组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:利用计算机辅助诊断系统可以提高肺结节教学质量。

中国健康男性志愿者单次口服甲磺酸酚妥拉明片耐受性研究

目的 :在中国男性健康志愿者中评价单次口服Ⅳ +Ⅴ类新药甲磺酸酚妥拉明片的安全性、耐受性。方法 :根据新药临床试验指导原则设计试验方案 ,按照赫尔辛基宣言和GCP指导原则 ,选择 18～5 0岁健康成人 ,用区组随机化设计方法 ,按随机表将 36名受试者随机分配至 10、2 0、30、4 0、5 0和 6 0mg剂量组 ,每组 6名受试者。观察指标为临床症状、生命体征、心电图、血常规、尿常规、肝功能、肾功能、电解质等。结果 :单次口服 10～ 6 0mg甲磺酸酚妥拉明片 ,志愿者体温、脉搏、呼吸频率、卧立位血压、心电图、血常规、肝功能、肾功能、电解质等各项指标测定值均在正常范围内 ,仅见面部潮红、鼻塞、头晕头痛或脉率增快 (2 0例 )等与药物可能有关的一过性轻微不良反应。 9例志愿者在给药后 2 0～ 30min后发生阴茎勃起现象 ,约持续 5min左右。结论 :36名中国男性健康受试者单次口服甲磺酸酚妥拉明片最大剂量至 6 0mg比较安全、耐受性较好。

单次口服甲磺酸酚妥拉明片耐受性试验

目的:在中国男性健康志愿者中评价单次口服Ⅳ+V类新药甲磺酸酚妥拉明片的安全性、耐受性.方法:根据新药临床试验指导原则设计试验方案,并获得解放军总医院医学伦理委员会审查通过.按照赫尔辛基宣言和GCP指导原则,试验前由研究人员向受试者解释研究性质、目的、风险及其权益,受试者须自愿签署知情同意书.选择18～50岁健康成人,经体检及实验室检查,各项指标均在正常范围内方可入选.用区组随机化设计方法,按随机表将36名受试者随机分配至10mg、20mg、30mg、40mg、50mg和60mg剂量组,每组6名受试者.观察指标为临床症状、生命体征、心电图、血常规、尿常规、肝功能、肾功能、电解质等.结果:单次口服10mg～60mg甲磺酸酚妥拉明片,志愿者体温、脉搏、呼吸频事、卧立位血压、心电图、血常规、肝功能、肾功能、电解质等各项指标测定值均在正常范围内,仅见面部潮红、鼻塞、头晕头痛或脉率增快(20例)等与药物可能有关的一过性轻微不良反应.9例志愿者在给药后20～30分钟后发生阴茎勃起现象,约持续5分钟左右.结论:36名中国男性健康受试者单次口服甲磺酸酚妥拉明片最大剂量至60mg比较安全,耐受性较好.