基于线粒体基因的新疆托氏兔遗传多样性和种群遗传结构评价

旨在利用线粒体基因测序方法评价新疆托氏兔的遗传多样性水平,并探究亚种间的遗传结构。本研究通过PCR扩增及测序技术,获得来自新疆北部、西北部以及中东部地区的共计78例新疆托氏兔线粒体DNA的CO1和D-LOOP基因序列,并采用生物信息学的方法进行数据分析。结果表明,78个新疆托氏兔样本的合并序列共定义了68种单倍型,新疆托氏兔的单倍型多样性(h=0.996±0.002)和核苷酸多样性(π=0.049±0.023)均较高;系统发育关系和单倍型中介网络图显示,本研究中的托氏兔样本被分成3个大枝(Clade A-C),其中Clade A和C包含绝大多数来自新疆北部和西北部组群的野兔,即托氏兔西域亚种,Clade B中的野兔绝大多数来自新疆中、东部地区,即托氏兔中亚亚种,除小部分样本较为混杂,其余样本的聚类情况与其分布范围和地理距离相吻合;AMOVA分析、Fst以及基因流结果显示,新疆托氏兔亚种间遗传分化较大、基因流较小,亚种内遗传分化相对较小、基因流相对较大。中性检验结果显示,新疆托氏兔群体Tajima`D值为1.075(P>0.05),Fu`s Fs为-15.100(P<0.01),核苷酸错配分布呈现多峰,EBSPs分析显示新疆托氏兔在距今大约0.01 Ma时发生过种群扩张。基于线粒体2个基因的综合分析结果表明,新疆托氏兔具有丰富的遗传多样性和较明显的系统地理分布格局;西域亚种的北部和西北部组群间存在较强的基因流和较小的遗传分化,但中亚亚种的中部和东部组群间出现了较大的分化,可能是由于较远的地理距离所致;此外,新疆托氏兔近期经历过种群扩张。

东帕米尔高原地区藏兔群体遗传进化分析

旨在利用分子遗传学方法检测东帕米尔高原地区极端环境对当地藏兔群体的遗传多样性、遗传结构及遗传分化的影响,为帕米尔高原物种多样性和遗传多样性的保护提供研究资料。本研究通过PCR扩增及测序技术测定东帕米尔高原地区藏兔的线粒体CO1与ND4基因序列,使用相关生物信息学软件进行数据分析。结果表明,东帕米尔高原地区4个采样点37例藏兔样本的线粒体基因串联序列共检测到17种单倍型,总核苷酸多样性为(0.012±0.006),单倍型多样性为(0.935±0.021),均低于世界其他兔属物种如塔里木兔、欧兔,且海拔相对较高的藏兔群体的遗传多样性低于海拔相对较低的藏兔群体。ML树及中介网络图将全部藏兔分成3个枝Clade A-C,A枝中的样本包含了全部采样地的混合单倍型,B枝仅包含红其拉甫口岸的样本,C枝的样本在世界兔属物种系统发育树中与塔里木兔聚在一起。遗传分化方面,采样点中海拔最高的红其拉甫口岸地区的藏兔种群与其他地理种群间的分化程度最大,乌恰县与阿克陶县两个地理种群间分化程度最小且基因流最大。结合前人的研究成果,本研究结果显示,生活在东帕米尔高原地区的藏兔遗传多样性较低,且未呈现出较强的系统地理分布格局;红其拉甫口岸的藏兔受高原极端环境影响,在线粒体基因水平上与其他藏兔存在一定程度的分化,可能形成了不同的生态型;并且在部分藏兔样本中发现了与塔里木兔线粒体基因渗透现象。

基于SLAF-Seq技术的塔里木兔(Lepus yarkandensis)小体型相关基因的筛选及初步分析

本研究旨在探究与塔里木兔(Lepus yarkandensis)体型大小相关的受选择基因,以为个体发育生长相关的主要基因的鉴定提供参考。本研究基于SLAF-Seq(Specific-locus amplified fragment sequencing)技术对11只大体型的蒙古兔(Lepus tolai)和15只小体型的塔里木兔进行选择清除分析(Selective sweep),并对受选择区域进行GO和KEGG注释和富集分析,以筛选出塔里木兔的体型大小相关基因。根据F_(st)值和πratio值的95%分位数(F_(st)>0.566,πratio>5.80)的结果显示,共计439420个SNPs被选择。SNPs位置注释显示这些位点涉及1943个候选基因。KEGG富集分析结果表明,泛素介导的蛋白质水解(Ubiquitin mediated proteolysis)、mTOR(Mammalian target of rapamycin)和Wnt信号通路可能与塔里木兔的体型大小相关。KEGG和GO富集分析表明有25个候选基因可能与塔里木兔的体型大小相关,这些基因与骨骼和肌肉的形成发育、脂肪代谢、能量产生、细胞增殖和凋亡以及器官大小相关。其他动物研究指出PTEN、WNT1、WNT7A、FGF13、RPS6KB1、RRAGA和GANC等候选基因的功能可能与动物的体型大小相关,并且其中有部分基因富集在调控体型相关的通路中。这些基因可能在控制塔里木兔的体型大小中发挥着重要的作用,可作为影响塔里木兔体型大小的关键候选基因。本研究结果为今后深入挖掘与动物体型大小相关基因及研究其分子调控机制提供了参考。

强化水质检测监管 保障农村供水安全

伴随我国经济的快速发展,人们对于供水的要求也逐渐提高。借助对当下我国农村供水中所存在的问题进行阐述,就安全饮水这个角度来阐述农村供水水质检验所存在的重要性,提出优化水质检测监管的有效措施。对于当下农村水厂操控水质的关键点,落实好适用于农村各种供水水质检验相关技术的研究,并初步获得成果。