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中西医结合治疗慢性乙型肝炎的本体构建研究
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作者 齐文颖 邹翔云 +7 位作者 王秋月 刘琪瑶 李小科 张嘉鑫 甘大楠 杜宏波 糟小宾 叶永安 《中西医结合肝病杂志》 CAS 2024年第10期865-869,共5页
目的:为了给中西医结合治疗慢性乙型肝炎(CHB)提供更加全面、综合的治疗策略,形成系统化和结构化的知识体系,辅助实现知识的共享与交互,构建一个融合中西医结合治疗理念、方法和实践的CHB本体知识库。方法:基于斯坦福医学院本体七步法,... 目的:为了给中西医结合治疗慢性乙型肝炎(CHB)提供更加全面、综合的治疗策略,形成系统化和结构化的知识体系,辅助实现知识的共享与交互,构建一个融合中西医结合治疗理念、方法和实践的CHB本体知识库。方法:基于斯坦福医学院本体七步法,以网络本体语言(OWL)为描述语言,使用Protégé5.6.0本体编辑工具,构建中西医结合治疗CHB本体,并使用推理机HermiT进行推理完成本体一致性检验。结果:所构建的中西医结合治疗CHB本体共有类44个,对象属性12个,数据属性128个,实例509个,基本实现了对中西医结合治疗CHB领域知识的语义化表达。结论:通过中西医结合治疗CHB本体构建,实现了中西医结合治疗CHB的知识推理和共享,并为中西医结合治疗CHB相关领域知识图谱的构建及其智能化应用研究提供支撑。 展开更多
关键词 中西医结合 慢性乙型肝炎 本体知识库 知识共享 智能应用
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乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的关键基因筛选及临床意义
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作者 曹旭 李小科 +5 位作者 糟小宾 杨先照 张嘉鑫 李志国 杜宏波 叶永安 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2021年第6期1753-1772,共20页
目的应用生物信息学筛选出乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌的关键基因及潜在药物。方法从GEO数据库下载HBV相关肝癌高通量芯片数据集GSE121248和GSE49713,通过GEO2R法分析获得差异表达基因(DEGs)。通过DAVID数据库对DEGs进行GO和KEGG分析... 目的应用生物信息学筛选出乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌的关键基因及潜在药物。方法从GEO数据库下载HBV相关肝癌高通量芯片数据集GSE121248和GSE49713,通过GEO2R法分析获得差异表达基因(DEGs)。通过DAVID数据库对DEGs进行GO和KEGG分析。String数据库建立蛋白-蛋白互作网络(PPI),利用Cytoscape软件构建hub基因及可视化网络。通过Kaplan-Meier Plotter和UALCAN数据库确认有临床预后价值的关键基因。通过cBioPortal数据库分析关键基因在肝癌组织中的表达相关性、突变和生存预后,通过CTD数据库获取对关键基因有潜在作用的化合物并进行比较。结果共获得93个DEGs,这些基因主要富集在氧化还原、蛋白质水解和有丝分裂核分裂等生物学过程;主要富集在细胞外小体、细胞外区域和细胞外隙等细胞成分;主要与血红素结合、铁离子结合和染色质结合等功能;主要集中在代谢途径,丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢以及色氨酸代谢3条通路。筛选分析hub基因并从中得到10个关键基因,在突变、表达相关性及预后上均有统计学意义(P<0.05)。基于以上靶点筛选出白藜芦醇、雷公藤甲素、穿心莲内酯、黄芩提取物、水飞蓟宾、姜黄素、槲皮素、隐丹参酮等候选药物。结论本研究通过数据挖掘与生物信息学分析,找到多个关键基因与潜在药物,为临床HBV相关肝癌治疗靶点的选择及药物方案的优化提供了参考。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 肝细胞癌 基因芯片 生物信息学
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叶永安治疗肝纤维化的学术思想与临床经验 被引量:4
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作者 黄宁宇 李悦 +4 位作者 皮珊珊 糟小宾 李萌 叶永安 杜宏波 《湖南中医药大学学报》 CAS 2021年第7期1085-1088,共4页
肝纤维化是各种慢性肝病向肝硬化发展过程中的关键步骤和影响肝病预后的重要环节。叶永安教授在肝纤维化治疗实践中形成了具有一定个人特色的诊疗思路。肝纤维化治疗首重病因,以毒立论;次重病机,强调守方;善调气血,由重向轻;兼调他脏,... 肝纤维化是各种慢性肝病向肝硬化发展过程中的关键步骤和影响肝病预后的重要环节。叶永安教授在肝纤维化治疗实践中形成了具有一定个人特色的诊疗思路。肝纤维化治疗首重病因,以毒立论;次重病机,强调守方;善调气血,由重向轻;兼调他脏,注重脾肾等观点,构成了其肝纤维化诊疗的主要思路。 展开更多
关键词 肝纤维化 肝硬化 病毒 酒精性肝病 叶永安
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基于网络药理学及分子对接研究苦参治疗慢性乙型肝炎的作用机制 被引量:5
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作者 李晓斌 曹旭 +5 位作者 糟小宾 李硕 陈贺宁 朱顺 李小科 叶永安 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2021年第6期1737-1744,共8页
目的本研究通过网络药理学及分子对接方法研究苦参治疗慢性乙型肝炎的物质基础与分子机制。方法依据中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选苦参有效化学成分及靶点基因。检索GeneCards数据库及OMIM数据库获取慢性乙型肝炎(CHB)相... 目的本研究通过网络药理学及分子对接方法研究苦参治疗慢性乙型肝炎的物质基础与分子机制。方法依据中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选苦参有效化学成分及靶点基因。检索GeneCards数据库及OMIM数据库获取慢性乙型肝炎(CHB)相关靶点基因。采用Cytoscape3.7.2构建苦参治疗CHB的"相关活性成分-潜在作用靶点"网络并进行拓扑结构分析,利用STRING平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络,通过R 3.6.2进行基因富集分析。依据AutoDock vina将关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果获得苦参治疗CHB的相关活性成分23个,潜在作用靶点97个。网络分析结果提示苦参可能通过作用于IL-6、SSR1、AR、RELA、PPARG和CASP3 6个核心靶点及相关通路以达到治疗CHB的目的。分子对接预测结果提示关键活性成分与核心靶点稳定结合。结论本研究初步揭示了苦参治疗慢性乙型肝炎多成分、多靶点、多通路的作用机制,为苦参的临床开发提供基础。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 苦参 慢性乙型肝炎
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