基于系统生物学整合技术挖掘结直肠癌形成中的核心通路和驱动基因

目的探索结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)形成中的核心通路和关键基因。方法利用meta分析技术从以往5项CRC发生相关转录组学研究中筛选癌及癌旁差异表达基因。采用ComBat方法合并5项研究的癌组织基因表达谱数据,针对上述差异表达基因用PCIT软件进行共表达网络构建。利用CFinder软件揭示该共表达网络中存在的核心亚网络,并用Gather软件确定主要核心亚网络所富集的生物学功能。以重要核心亚网络(或通路)为重点,联合节点基因在CRC中的表达变化方向和相应染色体区域扩增或缺失的信息,发现亚网络功能形成中的候选驱动基因。结果 Meta分析转录组学研究共发现差异表达基因2 073个,其中在5项研究的癌组织中一致上调1 174个,一致下调899个,这些基因在CRC样本中形成的共表达网络包括798个基因节点和1 462条边,存在22个核心亚网络。最大的核心亚网络由77个基因和436条边组成,功能涉及细胞周期和增殖信号调控,UBE2C、MYBL2、FAM83 D、AURKA、TPX2等11个基因被预测为该信号功能的驱动基因。结论细胞周期和增殖信号通路是结直肠癌发生中的核心通路,UBE2C和AURKA等11个基因是该核心通路的驱动基因。

指纹基因群分析揭示锯齿型结直肠癌的预后和耐药特性

目的利用指纹基因群（GES）分析技术挖掘现有公共芯片数据揭示锯齿型结直肠癌的预后和耐药特性。方法从基因表达谱数据储存公共平台（GEO）中下载4个有预后信息的结直肠癌表达谱芯片数据（GSE14333、GSE17538、GSE33113、GSE37892）,用批间误差校正和单基因信息抽提等信息技术获得1个整合的表达谱队列（n=600）。获得锯齿型结直肠癌表达谱有关数据及相应特异性指纹基因群,并与前面的表达谱队列合并,建立指纹基因群评分系统,依托已知锯齿型结直肠癌样本的基因群评分确定分组界值。根据分组界值,将600例结直肠癌分为锯齿型、过渡型和传统型结直肠癌组,利用Kaplan-Meier和Cox模型分析锯齿型结直肠癌的预后特征。同时,收集并下载与不可切除结直肠癌姑息治疗有关的表达谱数据（GSE28702、GSE5851）,经表达谱数据抽提整理后,获得每个样本的锯齿型指纹基因群评分,通过比较治疗有效组和无效组之间评分的统计学差异来揭示锯齿型结直肠癌与药物耐药的关系。结果根据结直肠癌亚型评分界值,600个结直肠癌中有50个被分为锯齿型,126个被分类为过渡型,424个被分为传统型。锯齿型和过渡型结直肠癌与传统型结直肠癌相比具有几乎完全相同的预后能力,多因素Cox模型发现锯齿型和过渡型结直肠癌是患者术后复发的独立危险因素。单纯比较锯齿型和传统型结直肠癌,多因素Cox模型发现锯齿型结直肠癌是患者预后的不良因素（AHR=1.792,95%CI 1.011~3.177）。西妥昔治疗有效组的指纹基因群评分显著低于无效组（P=0.017）,但FOLFOX治疗有效组和无效组的基因群评分无差异。结论结直肠癌锯齿型亚型是结直肠癌患者术后复发的独立危险因素,且与西妥昔单抗治疗耐药相关。

联合应用基因表达谱和拷贝数变异信息探索结直肠癌分子亚型

目的：整合基因表达谱和拷贝数变异谱数据来揭示Ⅱ～Ⅲ期结直肠癌的分子分型，并探索各分型与结直肠癌术后复发的关系。方法：从网络公共资源中下载结直肠癌的基因表达谱数据及对应的拷贝变异谱数据，经批间校正、四分位数标准化、缺失值估算及特征过滤等处理后获得用于后续整合分析的基因表达谱和基因组拷贝数谱数据；选用贝叶斯一致性聚类（BCC）算法整合上述两种谱学数据进行结直肠癌分子亚型分析；结合结直肠癌患者的复发和生存数据，利用生存分析评价各亚型的预后预测能力；并用基因系列富集度分析软件比较不同亚型所富集的生物学信号。所有谱数据分析基于R-3．0．1平台，统计分析采用SPSS 16．0软件包。结果：从公共数据库中共选用335例结直肠癌患者的结直肠癌组织谱学数据，在特征选择后有1578个mRNA探针和345个拷贝数变异位置用于BCC综合聚类；BCC法聚类将335例结直肠癌分为4个亚型，该结果与单纯的基因表达谱分型（Cramer’s V=0．49，P〈0．001）、基因拷贝数谱分型（Cramer’s V=0．51，P〈0．001）及芯片数据提供者的表达谱分型（Cramer’s V=0．32，P〈0．001）显著相关，其中，BCC-Ⅰ亚型预后最好，BCC-Ⅳ亚型预后最差，而BCC-（Ⅱ＋Ⅲ）亚型预后居中，三组的log—rank P〈0．001，单因素Cox模型分析所得HR=1．55（95％CI：1．22～1．99）；基因富集度分析显示BCC—Ⅳ亚型相对于BCC-Ⅰ亚型的最大差异生物功能信号是DNA损伤修复（涉及52个基因），用DNA损伤修复基因重新对BCC-Ⅳ亚型和BCC—Ⅰ亚型的结直肠癌样本分组，该分组的预后效果明显优于BCC分型，但与BCC分型结果显著相关（Cramer＇s V=0．39，P〈0．001）。结论：BCC法能够有效整合不同组学数据进行结直肠癌肿瘤分型；BCC-Ⅳ亚型的预后最差，可能与DNA损伤修复能力降低有关。

腹腔镜结直肠癌根治术对患者血清MDA、SOD及能量代谢指标的影响

目的探讨腹腔镜结直肠癌根治术治疗对患者血清MDA、SOD以及能量代谢指标影响。方法回顾分析2017年3月至2020年3月在本院拟行结直肠癌根治术患者70例,分成两组各35例。对照组采用开腹结直肠癌根治术治疗,观察组则行腹腔镜结直肠癌根治术,对比两组患者手术前后的氧化应激因子指标丙二醛(Malondialdehyde,MDA)、超氧歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)水平以及能量代谢指标前清蛋白(Prealbumin,PA)、视黄醇蛋白(Retinol protein,RBP)、清蛋白(Albumin,ALB)、转铁蛋白(Transferrin,TRE)。结果手术前两组患者血清MDA、SOD比较(P>0.05),术后两组的MDA均升高(P<0.05),且对照组高于观察组(P<0.05)。术后对照组与观察组的SOD水平均降低(P<0.05),且对照组低于观察组(P<0.05);术后两组患者的水平PA、ALB、TRE、RBP均降低,且对照组低于观察组(P<0.05)。结论采用腹腔镜结直肠癌根治术治疗对患者氧化应激反应及能量代谢影响较小,利于患者术后康复。

老年肠梗阻154例临床分析

为了提高对老年肠梗阻的诊治水平,现将我院1989年1月至1997年10月收治的60岁以上肠梗阻154例作一回顾分析,报道如下。

减少直肠癌误诊的探讨

直肠癌是最常见的消化道恶性肿瘤之一。我院1989年1月至1996年10月收治直肠癌127例(均经病理检查证实),其中有误诊史者达112例。为提高直肠癌的早期诊断率,现对误诊原因作一分析,并对减少误诊的措施作一探讨。

腹腔镜胆囊切除术710例临床分析

目的探讨腹腔镜胆囊切除术（LC）的适应证、手术方法及及主要并发症的预防。方法回顾分析LC手术710例患者的临床资料。结果LC切除胆囊700例，手术时间15～150min，平均75min，术后住院时间2～5d，平均3．4d；10例中转开腹手术；发生术后并发症12例；随访未发现胆漏、胆道残留结石、胆道狭窄等。结论实施LC术者需掌握手术适应证，术中要正确处理胆囊三角，同时正视腹腔镜技术的局限性，及时中转开腹。

闭合性腹部外伤290例诊治分析

目的 总结腹部闭合性外伤的诊断和治疗经验。方法回顾性分析290例闭合性腹部外伤患者的临床资料。结果非手术治疗39例，36例治愈，3例改手术治疗。手术治疗254例，244例治愈，随访均无远期并发症；10例死亡，4例因创伤严重于术中死亡，6例术后因严重颅脑损伤、多脏器功能衰竭死亡。结论对腹部闭合性损伤的患者，早期做出正确的诊断，把握好手术指征，术中进行正确的处理，可提高患者的生存率及治愈率。