目的:基于网络药理学探讨“兰州方”治疗急性髓系白血病(acute myelogenous leukemia,AML)的药理机制。方法:通过中药系统药理学与分析平台(traditional Chinese medicine systems phar macology database,TCMSP)收集“兰州方”的活性...目的:基于网络药理学探讨“兰州方”治疗急性髓系白血病(acute myelogenous leukemia,AML)的药理机制。方法:通过中药系统药理学与分析平台(traditional Chinese medicine systems phar macology database,TCMSP)收集“兰州方”的活性成分及对应作用靶点。从Disgenet、Drugbank、NCBI、OMIM、Pharmgkb和TTD疾病数据库中收集AML的相关靶点。使用Cytoscape软件建立“兰州方”治疗AML的有效成分及对应靶点的网络,探寻药物主要活性成分,并利用CytoNCA和CytoHubba插件寻找治疗作用的核心基因。通过基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析“兰州方”治疗AML起作用的主要功能和通路,通过分子对接验证化合物与靶蛋白的亲和性。结果:“兰州方”中共有139种与AML相关的有效化合物。6个疾病数据库中共收集到348个AML疾病相关基因,其中有39个“兰州方”作用于AML的靶基因。“兰州方”中Quercetin、Luteolin、Kaempferol、Naringenin、Diosgenin可能是治疗AML的主要活性成分。治疗作用影响的核心基因有MAPK3、STAT3、TP53、VEGFA、HIF1A、IL1B、CXCL8和PTGS2。GO分析发现“兰州方”治疗AML的基因功能主要富集在血管生成、活性氧代谢过程、对有毒物质的反应及代谢过程等。KEGG分析发现主要通路富集在铂类药物抵抗、癌症中的miRNA、PI3K-Akt通路、HIF-1通路、癌症中的转录失调、VEGF信号通路、NF-kappa B信号通路等。分子对接结果显示“兰州方”中多种化合物与疾病相关靶点PTGS2具有良好的亲和性。结论:“兰州方”通过“多种药物,多个靶点”的模式治疗AML。展开更多
文摘目的:基于网络药理学探讨“兰州方”治疗急性髓系白血病(acute myelogenous leukemia,AML)的药理机制。方法:通过中药系统药理学与分析平台(traditional Chinese medicine systems phar macology database,TCMSP)收集“兰州方”的活性成分及对应作用靶点。从Disgenet、Drugbank、NCBI、OMIM、Pharmgkb和TTD疾病数据库中收集AML的相关靶点。使用Cytoscape软件建立“兰州方”治疗AML的有效成分及对应靶点的网络,探寻药物主要活性成分,并利用CytoNCA和CytoHubba插件寻找治疗作用的核心基因。通过基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析“兰州方”治疗AML起作用的主要功能和通路,通过分子对接验证化合物与靶蛋白的亲和性。结果:“兰州方”中共有139种与AML相关的有效化合物。6个疾病数据库中共收集到348个AML疾病相关基因,其中有39个“兰州方”作用于AML的靶基因。“兰州方”中Quercetin、Luteolin、Kaempferol、Naringenin、Diosgenin可能是治疗AML的主要活性成分。治疗作用影响的核心基因有MAPK3、STAT3、TP53、VEGFA、HIF1A、IL1B、CXCL8和PTGS2。GO分析发现“兰州方”治疗AML的基因功能主要富集在血管生成、活性氧代谢过程、对有毒物质的反应及代谢过程等。KEGG分析发现主要通路富集在铂类药物抵抗、癌症中的miRNA、PI3K-Akt通路、HIF-1通路、癌症中的转录失调、VEGF信号通路、NF-kappa B信号通路等。分子对接结果显示“兰州方”中多种化合物与疾病相关靶点PTGS2具有良好的亲和性。结论:“兰州方”通过“多种药物,多个靶点”的模式治疗AML。
