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Kindlin与β整合素的相互作用的分子动力学模拟
1
作者
罗仙雯
方颖
+1 位作者
吴建华
李趣欢
《医用生物力学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第S01期415-415,共1页
目的Kindlin是激活整合素的重要胞内适配蛋白,是黏附斑的主要成分。Kindlin-2与β整合素胞质尾部远端的特异性结合通过Kindlin-2的特定口袋与β整合素的TTV基序结合,该口袋的相关突变会引起kindlin-2黏附斑定位的缺失,并影响整合素的激...
目的Kindlin是激活整合素的重要胞内适配蛋白,是黏附斑的主要成分。Kindlin-2与β整合素胞质尾部远端的特异性结合通过Kindlin-2的特定口袋与β整合素的TTV基序结合,该口袋的相关突变会引起kindlin-2黏附斑定位的缺失,并影响整合素的激活,因此探索kindlin-2与β整合素突变后的结合机制,可为靶向Kindlin-2蛋白治疗的相关药物设计提供理论基础。方法通过选取kindlin-2与β1整合素的共晶体以及对接结构,借助分子动力学模拟手段,在原子水平上揭示野生型与TTV突变及疾病相关突变对kindlin与β整合素结合机制的影响。结果与野生型体系相比,突变体系存在不稳定性。关键的氢键相互作用减少,使kindlin与β整合素的相互作用减弱,解离概率增加。在受到力的拉伸下,突变体复合物解离的时间变短,解离力变小,复合物机械强度降低。结论Kindlin相关突变后会影响复合物的稳定性,增加复合物的解离概率,影响kindlin与整合素的结合,从而导致整合素激活受损、黏附斑定位缺失以及相关疾病的产生。
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关键词
β整合素
Β1整合素
远端的
氢键相互作用
共晶体
结合机制
分子动力学模拟
野生型
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职称材料
题名
Kindlin与β整合素的相互作用的分子动力学模拟
1
作者
罗仙雯
方颖
吴建华
李趣欢
机构
华南理工大学生物科学与工程学院
出处
《医用生物力学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第S01期415-415,共1页
基金
国家自然科学基金项目,31870928,32271360
广东省自然科学基金项目,2021A1515010040,2023A1515010829
文摘
目的Kindlin是激活整合素的重要胞内适配蛋白,是黏附斑的主要成分。Kindlin-2与β整合素胞质尾部远端的特异性结合通过Kindlin-2的特定口袋与β整合素的TTV基序结合,该口袋的相关突变会引起kindlin-2黏附斑定位的缺失,并影响整合素的激活,因此探索kindlin-2与β整合素突变后的结合机制,可为靶向Kindlin-2蛋白治疗的相关药物设计提供理论基础。方法通过选取kindlin-2与β1整合素的共晶体以及对接结构,借助分子动力学模拟手段,在原子水平上揭示野生型与TTV突变及疾病相关突变对kindlin与β整合素结合机制的影响。结果与野生型体系相比,突变体系存在不稳定性。关键的氢键相互作用减少,使kindlin与β整合素的相互作用减弱,解离概率增加。在受到力的拉伸下,突变体复合物解离的时间变短,解离力变小,复合物机械强度降低。结论Kindlin相关突变后会影响复合物的稳定性,增加复合物的解离概率,影响kindlin与整合素的结合,从而导致整合素激活受损、黏附斑定位缺失以及相关疾病的产生。
关键词
β整合素
Β1整合素
远端的
氢键相互作用
共晶体
结合机制
分子动力学模拟
野生型
分类号
R914 [医药卫生—药物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Kindlin与β整合素的相互作用的分子动力学模拟
罗仙雯
方颖
吴建华
李趣欢
《医用生物力学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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