基于TCGA分析HAVCR2基因在食管癌中表达及其与免疫微环境的关系

目的利用TCGA数据库中转录组数据分析HAVCR2基因在食管癌中的表达及其与临床特征、免疫微环境的关系,为改进食管癌的治疗方法提供一定的理论依据。方法从TCGA公共数据库中获取食管癌组织及正常食管黏膜组织的RNA测序数据和食管癌组织所对应的临床数据。通过非参数检验分析HAVCR2在食管癌组织和正常食管组织的表达差异。根据TCGA-ESCA数据库中总生存期数据绘制HAVCR2高低表达组的Kaplan-Meier生存曲线,并进行Log-rank检验。通过单因素Cox回归分析初步找出影响食管癌患者生存状态的主要因素。最后评估HAVCR2表达与肿瘤免疫微环境之间的关系。结果HAVCR2基因在食管癌组织中表达上调,但HAVCR2基因表达与食管癌患者的总生存期无关,不能够作为食管癌的预后因子。单因素Cox回归分析显示,有淋巴结转移的食管癌患者预后较差。在肿瘤微环境的分析中,HAVCR2高表达的食管癌中免疫成分和基质成分更高,但肿瘤纯度较低。HAVCR2高表达时,肿瘤微环境中免疫细胞种类及数量增多,免疫功能可能处于激活状态。高低表达组之间免疫细胞差异和免疫检查点基因表达差异显著。富集分析显示差异表达基因主要富集于与免疫相关的通路。结论HAVCR2基因在食管癌样本中表达高于正常食管黏膜组织,与临床特征的关系并不显著,在肿瘤免疫微环境中发挥作用,表明HAVCR2基因可以为食管癌的治疗和诊断提供一定的思路。