拷贝数变异分析及染色体核型分析在发育迟缓与智力障碍儿童中的应用

目的探讨拷贝数变异分析及染色体核型分析在发育迟缓/智力障碍(DD/ID)儿童中的应用。方法对湖南省儿童医院连续649例DD/ID患儿进行染色体微阵列(CMA)检测。通过参考以前的报告或使用荧光原位杂交(FISH)及定量聚合酶链反应(q-PCR)进行的亲本检测结果来评估拷贝数变异(CNV)的致病性。结果649例DD/ID患儿中有110例检出致病性CNV,检出率为16.9%,其中包括长度为270 kb~30 Mb的100个缺失和31个重复。对66例患儿父母进行CMA检测,其中86.4%携带新生CNV。8例患儿的致病性CNV遗传自健康父母,具有平衡易位。在2p21p16.3、3p21.31、10p11.22、14q24.2和21q22.13位点验证了5个罕见报告的缺失。结论CMA检测在DD/ID患儿的基因诊断中具有临床实用性。CMA检测可作为所有DD/ID儿童的临床诊断检测。

3142例遗传咨询儿童外周血染色体核型分析

目的 通过对遗传咨询儿童的染色体核型进行检测,了解染色体异常的发生率以及临床表现。方法 回顾并分析2017年1月—2021年12月因特殊面容、精神运动发育迟缓、智力低下、多发畸形、身材矮小等原因在湖南省儿童医院就诊并进行遗传咨询的3 142例患儿的临床资料,利用外周血淋巴细胞培养-G显带-染色体核型分析法对儿童外周血染色体核型进行检测、记录和分析。结果 3 142例受检儿童中,检出异常染色体核型共416例,检出率为13.24%,其中染色体数目异常286例,占所有染色体异常核型的68.75%;染色体结构异常48例,占所有染色体异常核型的11.54%;染色体多态性82例,占所有染色体异常核型的19.71%。结论 染色体异常核型中,染色体数目异常最为常见,是导致儿童特殊面容、智力低下、发育异常的主要原因。

两对同卵双胞胎1型神经纤维瘤与骨假关节的基因型与表型分析

目的通过对两对患1型神经纤维瘤(neurofibromatosis type 1,NF1)的同卵双胞胎进行全基因组测序分析对比儿童先天性骨假关节(congenital pseudarthrosis,CP)表型和非CP表型患儿的分子特征,鉴定CP患儿的致病变异,并对相关表型和1型神经纤维瘤致病基因NF1变异进行特征描述。方法根据胫骨假关节诊断标准和NF1临床诊断标准,纳入两对均患有NF1的同卵双胞胎,均为女性,且每对双胞胎中均仅1人有CP表型。对两对同卵双胞胎的外周血提取DNA进行全基因组测序,运用生物信息学方法分析单核苷酸变异(single nucleotide variant,SNV)、短插入缺失变异(short insertion deletion variants,InDel)、拷贝数变异(copy number variant,CNV)和结构变异(structural variant,SV),鉴定出涉及NF1基因的致病变异及CP患者特有的胚系致病变异;对鉴定出的致病变异在双胞胎及父母中进行一代测序验证。结果两对NF1型同卵双胞胎中均鉴定到NF1基因的致病胚系变异,分别为:c.3047_3048del(p.Cys1016SerfsTer4)和c.4267A>G(p.Lys1423Glu)杂合变异;经过家系4人的一代测序验证,表明均为新发变异。除NF1基因外,在CP患儿特有而未患CP的同胞姐妹没有的变异中,未鉴定到其他致病或可能致病的SNV/InDel、结构变异或CNV变异。进一步比较两对双胞胎中CP患儿特有的评级为意义不明的低频有害错义变异和功能缺失型SNV和InDels变异,发现这些变异共同影响的基因有1802个,无共同基因存在编码区的变异;评级为意义不明的结构变异或CNV变异所在的基因无交集,即无共同变异基因。结论全基因组测序分析揭示两对患有NF1同卵双胞胎均鉴定到了1型神经纤维瘤致病基因NF1的致病变异,未鉴定到双胞胎中CP患者特有的其他致病变异,且两个CP患者中未检测到其他的共同基因包含可能致病的变异。